More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0751 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0751  ABC transporter related  100 
 
 
365 aa  734    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5708  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  59.05 
 
 
366 aa  415  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2713  ABC transporter related  54.32 
 
 
366 aa  391  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5579  ABC transporter related  54.25 
 
 
361 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal  0.157659 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3453  ABC transporter related  52.17 
 
 
377 aa  364  1e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.919883  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  49.3 
 
 
375 aa  342  5e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  48.35 
 
 
378 aa  339  5e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  49.58 
 
 
359 aa  339  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  45.88 
 
 
368 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  45.88 
 
 
368 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.88 
 
 
365 aa  335  9e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0296  ABC transporter related  47.38 
 
 
362 aa  334  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  48.88 
 
 
380 aa  334  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  49.03 
 
 
362 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  49.15 
 
 
361 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  45.88 
 
 
366 aa  333  4e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  49.16 
 
 
357 aa  333  4e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  48.6 
 
 
376 aa  332  5e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  50.14 
 
 
370 aa  332  5e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  48.03 
 
 
367 aa  332  8e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  49.72 
 
 
359 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0391  ABC transporter related  49.03 
 
 
362 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53752  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  47.37 
 
 
362 aa  329  5.0000000000000004e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  48.31 
 
 
377 aa  328  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  47.91 
 
 
362 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  47.75 
 
 
353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  48.3 
 
 
361 aa  325  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0851  ABC transporter related  47.34 
 
 
368 aa  324  1e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.236599 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  45.8 
 
 
371 aa  325  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  46.07 
 
 
357 aa  324  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  49.72 
 
 
356 aa  322  4e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  49.15 
 
 
353 aa  322  6e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.72 
 
 
349 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  44.94 
 
 
372 aa  320  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  46.72 
 
 
366 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  48.91 
 
 
363 aa  320  3e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  48.75 
 
 
357 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3427  ABC transporter related  46.78 
 
 
349 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  46.63 
 
 
344 aa  319  5e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3143  ABC transporter related protein  44.29 
 
 
379 aa  319  5e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27093  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0135  ABC transporter-related protein  47.19 
 
 
350 aa  319  5e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.370225 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  49.01 
 
 
357 aa  318  6e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3948  ABC sugar transporter, ATPase subunit  50.14 
 
 
373 aa  318  7e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32305  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1275  ABC transporter related  44.94 
 
 
369 aa  318  7.999999999999999e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  45.96 
 
 
358 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1322  ABC transporter related protein  45.51 
 
 
360 aa  318  9e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.08 
 
 
363 aa  318  1e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2957  ABC transporter related  45.79 
 
 
360 aa  318  1e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0714  ABC transporter related  45.68 
 
 
363 aa  318  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0292  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  43.14 
 
 
373 aa  317  2e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.237925  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5203  ABC transporter related  48.38 
 
 
385 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300266  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5485  ABC transporter related  48.5 
 
 
382 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011502 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5656  ABC transporter related  48.38 
 
 
385 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115239  normal  0.353379 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  45.94 
 
 
359 aa  317  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  45.68 
 
 
370 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0380  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  44.69 
 
 
369 aa  317  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3912  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  44.69 
 
 
369 aa  317  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31471  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0308  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  44.69 
 
 
369 aa  317  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  46.17 
 
 
366 aa  316  5e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  45.07 
 
 
359 aa  315  6e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0462  ABC transporter related  46.91 
 
 
365 aa  315  6e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  48.53 
 
 
333 aa  315  6e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.72 
 
 
349 aa  315  7e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3198  ABC transporter related  47.83 
 
 
382 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6938  ABC sugar transporter, ATPase subunit  48.61 
 
 
359 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0063026  normal  0.624171 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4930  ABC transporter related  48.23 
 
 
382 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001327  maltose/maltodextrin transport ATP-binding protein MalK  43.14 
 
 
372 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.704873  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4579  ABC transporter related  47.84 
 
 
385 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000381614 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.72 
 
 
349 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2142  ABC transporter related  46.78 
 
 
365 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0488971  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0240  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  44.57 
 
 
369 aa  313  2.9999999999999996e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05213  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  43.14 
 
 
372 aa  312  5.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5686  ABC transporter related  46.5 
 
 
377 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.661701  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3776  ABC transporter related  47.47 
 
 
360 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429106  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  44.66 
 
 
369 aa  311  7.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  45.6 
 
 
369 aa  311  7.999999999999999e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2512  ABC transporter ATP-binding protein  41.97 
 
 
360 aa  311  7.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.408974  normal  0.94843 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2007  ABC transporter related  45.04 
 
 
367 aa  311  7.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.91 
 
 
369 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  45.22 
 
 
368 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  45.96 
 
 
370 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2324  ABC transporter related  45.11 
 
 
381 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517442  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3672  ABC transporter related protein  47.83 
 
 
363 aa  311  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  46.24 
 
 
370 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0662  ABC transporter related  45.51 
 
 
366 aa  311  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  46.24 
 
 
360 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4573  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  44.13 
 
 
369 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.01143 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4487  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  44.13 
 
 
369 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0231  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.52 
 
 
363 aa  310  2e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  46.48 
 
 
361 aa  311  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4624  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  44.13 
 
 
369 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.102994 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4422  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  44.13 
 
 
369 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00031053 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0183  ABC transporter related  46.59 
 
 
359 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4572  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  44.13 
 
 
369 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2913  ABC transporter for sugar/spermidine/putrescine/iron/thiamine ATP-binding protein  45.94 
 
 
366 aa  310  2e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  47.73 
 
 
355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3556  ABC transporter related  46.37 
 
 
359 aa  310  4e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2649  ABC transporter related  44.57 
 
 
381 aa  309  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6630  ABC transporter related  46.5 
 
 
377 aa  309  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44916 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  44.85 
 
 
363 aa  309  5e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>