More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1112 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1112  type II secretion system protein  100 
 
 		 385 aa  778    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000155741 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3199  type II general secretion pathway (GSP) F protein  43.05 
 
 		 381 aa  314  9.999999999999999e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0614  type II secretion system protein  40.24 
 
 		 375 aa  253  4.0000000000000004e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.652399  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  31.44 
 
 		 405 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  31.58 
 
 		 405 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  31.03 
 
 		 405 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  32.74 
 
 		 406 aa  191  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  31.74 
 
 		 405 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  30.34 
 
 		 404 aa  189  8e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  29.05 
 
 		 406 aa  189  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.17 
 
 		 405 aa  186  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  30.37 
 
 		 405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  31.79 
 
 		 409 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  31.23 
 
 		 417 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  29.86 
 
 		 407 aa  179  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  31.23 
 
 		 417 aa  179  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  31.55 
 
 		 401 aa  177  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  29.24 
 
 		 417 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  31.75 
 
 		 410 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  30.48 
 
 		 401 aa  173  5e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002544  type 4 fimbrial assembly protein PilC  30.55 
 
 		 407 aa  172  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000177594  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  30.9 
 
 		 403 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  30.34 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  31.18 
 
 		 411 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 403 aa  169  5e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  29.52 
 
 		 416 aa  169  7e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1923  type II secretion system protein  29.74 
 
 		 402 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.919085  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03470  hypothetical protein  30.84 
 
 		 407 aa  168  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2001  type IV pilin biogenesis protein PilC  31.34 
 
 		 408 aa  168  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.148255  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  28.88 
 
 		 404 aa  168  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2080  type II secretion system protein  30.29 
 
 		 417 aa  169  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.917677  normal  0.551071 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  30.05 
 
 		 409 aa  168  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0419  type II secretion system protein  29.73 
 
 		 421 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  30.53 
 
 		 406 aa  168  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  32.25 
 
 		 403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  29.77 
 
 		 408 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4821  type II secretion system protein  30.13 
 
 		 405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  29.55 
 
 		 403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  30.43 
 
 		 420 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  30.43 
 
 		 424 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0061  general secretion pathway protein F  30.59 
 
 		 405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  31.1 
 
 		 417 aa  164  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.47 
 
 		 405 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0060  general secretion pathway protein F  31.9 
 
 		 405 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4499  putative general secretory pathway protein F  31.04 
 
 		 405 aa  162  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0681  type II secretion system protein  29.94 
 
 		 407 aa  162  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.524718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0050  general secretion pathway protein F  31.9 
 
 		 405 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899692  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0009  general secretion pathway protein F  31.65 
 
 		 405 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1580  Type II secretion system F domain protein  31.75 
 
 		 412 aa  162  8.000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0009  general secretion pathway protein F  31.65 
 
 		 405 aa  162  9e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2784  general secretion pathway protein F  31.65 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0079  general secretion pathway protein F  31.1 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  29.77 
 
 		 424 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0222  general secretion pathway protein F  31.65 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2664  general secretion pathway protein F  31.65 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  30.79 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0009  general secretion pathway protein F  31.65 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1888  general secretion pathway protein F  31.65 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0010  general secretion pathway protein F  31.1 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  28.95 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3516  general secretion pathway protein F  31.65 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  29.76 
 
 		 419 aa  162  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0060  general secretion pathway protein F  31.1 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211909  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  30.33 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0862  type IV pilus biogenesis protein PilC  28.35 
 
 		 405 aa  161  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  30.32 
 
 		 409 aa  161  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3109  type II secretion system protein  28.82 
 
 		 421 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.336893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  30 
 
 		 408 aa  160  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3242  general secretion pathway protein F  31.61 
 
 		 405 aa  160  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.458785 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  29.08 
 
 		 401 aa  160  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  29.6 
 
 		 409 aa  160  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  28.96 
 
 		 422 aa  159  6e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  29.45 
 
 		 405 aa  159  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3606  type II secretion system protein  30.06 
 
 		 421 aa  159  8e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.55 
 
 		 402 aa  159  9e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  29.86 
 
 		 409 aa  158  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  29.76 
 
 		 419 aa  158  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  28.98 
 
 		 463 aa  158  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3394  general secretion pathway protein F  29.65 
 
 		 405 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  28.42 
 
 		 406 aa  158  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  30.51 
 
 		 406 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  28.53 
 
 		 417 aa  157  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  29.58 
 
 		 419 aa  157  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  28.98 
 
 		 463 aa  157  3e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  29.91 
 
 		 404 aa  157  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  30.75 
 
 		 401 aa  157  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  28.78 
 
 		 401 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3072  general secretion pathway protein F  30.21 
 
 		 405 aa  156  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000734436 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  30.83 
 
 		 419 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1164  type II secretion system protein  29.76 
 
 		 401 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1134  type II secretion system protein  29.76 
 
 		 401 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0150  type II secretion system protein  27.43 
 
 		 410 aa  154  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  27.15 
 
 		 412 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  29.34 
 
 		 420 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3343  type II secretion system protein  29.38 
 
 		 401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.505202  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  29.8 
 
 		 409 aa  153  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  28.24 
 
 		 402 aa  153  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  29.03 
 
 		 406 aa  153  5e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  29.03 
 
 		 406 aa  153  5e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2707  type II secretion system protein  27.98 
 
 		 401 aa  153  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.315565 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>