More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2945 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2945  ABC transporter-like  100 
 
 		 541 aa  1102    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0348  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  56.49 
 
 		 548 aa  548  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.860489  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2836  ABC transporter related  55.68 
 
 		 546 aa  537  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2310  ABC transporter related  54.91 
 
 		 551 aa  538  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2924  ABC transporter related  54.91 
 
 		 551 aa  538  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6267  ABC transporter, fused ATPase subunits  55.03 
 
 		 548 aa  531  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2939  ABC transporter related  55.01 
 
 		 550 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2973  ABC transporter related  55.31 
 
 		 546 aa  528  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0092  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  55.03 
 
 		 548 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0583  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  55.13 
 
 		 548 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2282  ABC transporter, ATP-binding protein  55.03 
 
 		 548 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2006  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  55.03 
 
 		 548 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0401  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  55.03 
 
 		 548 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15947  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0421  ABC transporter, ATP-binding protein  55.03 
 
 		 548 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3090  ABC transporter, ATP-binding protein  55.03 
 
 		 548 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4308  ABC transporter-related protein  50.19 
 
 		 539 aa  494  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3913  ABC transporter ATPase  44.28 
 
 		 557 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195461  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5053  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.34 
 
 		 536 aa  381  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46010  putative ATP-binding component of ABC transporter  43.21 
 
 		 538 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.640378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5740  ABC transporter related  41.13 
 
 		 553 aa  347  4e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750761 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1995  ABC transporter-related protein  44.04 
 
 		 532 aa  340  4e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  hitchhiker  0.000319079 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2411  ABC transporter related  39.42 
 
 		 530 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2265  ABC transporter related  39.62 
 
 		 525 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2418  ABC transporter related  39.46 
 
 		 525 aa  319  9e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0400  ABC transporter related  40.78 
 
 		 535 aa  315  1.9999999999999998e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132459  normal  0.738425 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3169  ABC transporter related  37.86 
 
 		 541 aa  311  2e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5386  ABC transporter ATP-binding protein  38.37 
 
 		 544 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.221909  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4514  ABC transporter-related protein  36.9 
 
 		 535 aa  296  4e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577215  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7127  ABC transporter related  35.73 
 
 		 541 aa  293  4e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.618924 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0518  ABC transporter related  37.81 
 
 		 533 aa  290  7e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2015  ABC transporter related  37.45 
 
 		 525 aa  288  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406124  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3596  ABC transporter related  34.91 
 
 		 527 aa  288  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.737822  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2896  ABC transporter-like protein  36.26 
 
 		 549 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2147  ABC transporter related protein  35.98 
 
 		 554 aa  282  8.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.168618  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4011  ABC transporter related  35.62 
 
 		 537 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4085  ABC transporter related  35.62 
 
 		 537 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4241  ABC transporter related  35.62 
 
 		 537 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0854  ABC transporter ATP-binding protein  31.18 
 
 		 534 aa  281  3e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0935  ABC transporter related  33.21 
 
 		 530 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3586  ABC transporter related protein  37.43 
 
 		 530 aa  273  6e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  34.98 
 
 		 535 aa  273  8.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5951  ABC transporter related protein  34.5 
 
 		 558 aa  272  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5328  ABC transporter related  34.72 
 
 		 524 aa  272  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.862409 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0822  ABC transporter related  33.52 
 
 		 531 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0684569  normal  0.79375 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1888  ABC transporter related  35.03 
 
 		 545 aa  261  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2015  ABC transporter related  35.11 
 
 		 553 aa  260  4e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464297  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2488  ABC transporter related  35.51 
 
 		 534 aa  258  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  34.54 
 
 		 531 aa  256  7e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0963  ABC transporter related  33.08 
 
 		 526 aa  252  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1436  ABC transporter ATPase  35.37 
 
 		 527 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2987  ABC transporter related  34.48 
 
 		 555 aa  251  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223105 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001382  ABC-type transport system ATPase component  33.2 
 
 		 523 aa  251  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0479008  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1859  ABC transporter related protein  35.65 
 
 		 535 aa  248  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0744608  normal  0.494788 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0461  ABC transporter related  33.65 
 
 		 531 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1472  ABC transporter related protein  34.61 
 
 		 520 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2181  ABC transporter related  35.11 
 
 		 565 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163034  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1807  putative ATP-binding component of ABC transporter  31.26 
 
 		 531 aa  240  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.451616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3386  ABC transporter related  34.42 
 
 		 516 aa  240  5e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0218  ABC transporter, ATP-binding protein  27.62 
 
 		 529 aa  239  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902745  normal  0.428381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3494  ABC transporter related  30.1 
 
 		 529 aa  238  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1526  ABC transporter related protein  33.98 
 
 		 548 aa  238  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.373611  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4684  ABC transporter related protein  32.55 
 
 		 536 aa  238  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2144  ABC transporter related  29.46 
 
 		 529 aa  236  6e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2095  ABC transporter related  36.29 
 
 		 534 aa  236  7e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3837  ABC transporter related  32.83 
 
 		 532 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2097  ABC transporter related  28.41 
 
 		 530 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0494627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4720  putative ABC transporter, ATP-binding protein  32.84 
 
 		 524 aa  222  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5557  ABC transporter related  28 
 
 		 529 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19010  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.64 
 
 		 555 aa  211  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0660652 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7142  ABC transporter related  25.72 
 
 		 528 aa  210  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06389  hypothetical protein  31.12 
 
 		 436 aa  208  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2772  ABC transporter related  28.98 
 
 		 519 aa  207  6e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0217  ABC transporter related protein  32.89 
 
 		 511 aa  202  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  29.12 
 
 		 635 aa  200  5e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  31.09 
 
 		 626 aa  199  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  32.95 
 
 		 649 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  31.91 
 
 		 649 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0806  ABC transporter related  35.74 
 
 		 569 aa  198  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  29.66 
 
 		 634 aa  197  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  29.81 
 
 		 668 aa  198  3e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0453  ABC transporter related protein  31.19 
 
 		 552 aa  197  6e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  33.08 
 
 		 688 aa  195  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  27.2 
 
 		 643 aa  194  3e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  32.56 
 
 		 661 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  32.56 
 
 		 661 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  32.36 
 
 		 649 aa  194  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  28.47 
 
 		 634 aa  193  7e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  31.25 
 
 		 659 aa  193  8e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  32.3 
 
 		 649 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  28.27 
 
 		 645 aa  191  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  29.89 
 
 		 659 aa  191  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50537  predicted protein  30.27 
 
 		 879 aa  190  5.999999999999999e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.437528  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  31.42 
 
 		 648 aa  189  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  30.67 
 
 		 636 aa  189  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  30.28 
 
 		 644 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  30.57 
 
 		 564 aa  188  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  30.18 
 
 		 663 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  31.29 
 
 		 645 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  28.13 
 
 		 629 aa  188  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  29.03 
 
 		 658 aa  188  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>