More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1654 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1654  glutathione peroxidase  100 
 
 		 186 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323621  hitchhiker  0.0047837 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3670  glutathione peroxidase  80.33 
 
 		 184 aa  315  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.174884  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1719  glutathione peroxidase family protein  77.47 
 
 		 183 aa  310  9e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00731943  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4033  glutathione peroxidase  72.53 
 
 		 183 aa  276  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1244  glutathione peroxidase  76.57 
 
 		 176 aa  276  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.300123 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1686  glutathione peroxidase  72.53 
 
 		 202 aa  275  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.677668  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1284  glutathione peroxidase  71.98 
 
 		 183 aa  274  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.604655  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4103  putative glutathione peroxidase  76.07 
 
 		 184 aa  263  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47550  putative glutathione peroxidase  76.07 
 
 		 184 aa  263  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.532704 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1762  glutathione peroxidase  74.23 
 
 		 183 aa  251  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.533866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0359  glutathione peroxidase  48.35 
 
 		 182 aa  186  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2515  glutathione peroxidase  56.73 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3180  glutathione peroxidase  49.13 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000271589  normal  0.0170233 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2853  glutathione peroxidase  49.16 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.154923  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3022  glutathione peroxidase  46.93 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00278721  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3037  glutathione peroxidase  49.13 
 
 		 230 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000026286  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1341  glutathione peroxidase  49.13 
 
 		 179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267656  hitchhiker  0.0000000425712 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2526  glutathione peroxidase  46.37 
 
 		 180 aa  179  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2684  glutathione peroxidase  49.69 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.553323  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  49.69 
 
 		 212 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1267  glutathione peroxidase  47.13 
 
 		 203 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0133013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1197  glutathione peroxidase  47.13 
 
 		 203 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644229  normal  0.718028 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1196  glutathione peroxidase  47.13 
 
 		 203 aa  171  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0218447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2474  glutathione peroxidase, putative  51.28 
 
 		 180 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  48.47 
 
 		 208 aa  170  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3349  glutathione peroxidase, putative  47.09 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02196  Glutathione peroxidase  47.85 
 
 		 184 aa  164  5.9999999999999996e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0197549  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  50.31 
 
 		 202 aa  164  8e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2679  glutathione peroxidase  46.63 
 
 		 192 aa  164  8e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.241309  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1427  GMP synthase-like  43.5 
 
 		 190 aa  161  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  46.24 
 
 		 189 aa  159  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000573  glutathione peroxidase  49.33 
 
 		 181 aa  159  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  46.41 
 
 		 199 aa  154  8e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  46.96 
 
 		 205 aa  153  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05309  glutathione peroxidase  46.45 
 
 		 181 aa  153  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  47.24 
 
 		 208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  45.14 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  44.17 
 
 		 213 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  48.34 
 
 		 185 aa  144  7.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  44.17 
 
 		 231 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  43.98 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  43.95 
 
 		 195 aa  141  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  42.05 
 
 		 193 aa  141  6e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1409  glutathione peroxidase  41.67 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  43.04 
 
 		 233 aa  138  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  49.64 
 
 		 195 aa  136  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  47.71 
 
 		 161 aa  136  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1801  glutathione peroxidase  43.75 
 
 		 199 aa  135  5e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.740072  hitchhiker  0.00000253639 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  41.99 
 
 		 185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  50.36 
 
 		 162 aa  132  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  39.53 
 
 		 191 aa  129  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2389  putative glutathione peroxidase  42.36 
 
 		 176 aa  121  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401751  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1053  glutathione peroxidase  42.36 
 
 		 176 aa  121  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.281088  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  42.86 
 
 		 158 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1354  glutathione peroxidase  44.62 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1863  glutathione peroxidase  47.06 
 
 		 195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0694  glutathione peroxidase  45.07 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000130339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  43.26 
 
 		 161 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2454  Peroxiredoxin  46.38 
 
 		 160 aa  118  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0184161  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1010  glutathione peroxidase  44.29 
 
 		 162 aa  117  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1499  glutathione peroxidase  48.39 
 
 		 157 aa  117  7e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.278578  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0360  glutathione peroxidase  43.18 
 
 		 184 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0316  glutathione peroxidase  43.18 
 
 		 184 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.282271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41100  Glutathione peroxidase  40.13 
 
 		 160 aa  117  9e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341833  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1883  glutathione peroxidase  40.15 
 
 		 152 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  44.12 
 
 		 159 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4894  Peroxiredoxin  45.52 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2699  glutathione peroxidase  45 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  42.07 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0392  glutathione peroxidase  42.42 
 
 		 188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0773128  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0904  glutathione peroxidase  42.86 
 
 		 158 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000826936  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0007  glutathione peroxidase  41.67 
 
 		 157 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  42.86 
 
 		 159 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  44.2 
 
 		 159 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  42.14 
 
 		 159 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3665  glutathione peroxidase  43.75 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1384  glutathione peroxidase  41.67 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  42.86 
 
 		 159 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  42.86 
 
 		 159 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  40 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  43.07 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  44.27 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2764  glutathione peroxidase  40 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0187221  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0867  glutathione peroxidase  43.17 
 
 		 159 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000118287  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  43.51 
 
 		 161 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  43.07 
 
 		 161 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2055  putative glutathione peroxidase  36.57 
 
 		 177 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.265735 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1368  glutathione peroxidase  41.67 
 
 		 165 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5475  glutathione peroxidase  39.42 
 
 		 189 aa  111  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416682  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2975  Glutathione peroxidase  41.67 
 
 		 161 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36322  normal  0.036622 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  43.51 
 
 		 161 aa  111  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1207  glutathione peroxidase  42.98 
 
 		 158 aa  111  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.205921 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  40.3 
 
 		 160 aa  111  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  39.87 
 
 		 161 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  41.43 
 
 		 159 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  41.43 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  41.01 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  39.72 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  40.46 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  42.14 
 
 		 159 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>