61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0634 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0634  shufflon domain protein  100 
 
 		 532 aa  1085    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0638  Tail Collar domain protein  100 
 
 		 157 aa  320  5e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.437833  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0635  Tail Collar domain protein  68.28 
 
 		 140 aa  186  9e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0637  Tail Collar domain protein  68.57 
 
 		 140 aa  179  9e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.436358  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3727  shufflon protein  28.83 
 
 		 425 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0636  Tail Collar domain protein  53.85 
 
 		 144 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266713  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  43.96 
 
 		 689 aa  127  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0109  shufflon protein B'  29.03 
 
 		 448 aa  120  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  48.25 
 
 		 621 aa  115  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  40.43 
 
 		 646 aa  114  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  45.28 
 
 		 259 aa  113  7.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  45.28 
 
 		 259 aa  113  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1819  Tail Collar domain protein  48.92 
 
 		 166 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  42.76 
 
 		 682 aa  106  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0021  type IV pilus biogenesis protein PilV  26.28 
 
 		 428 aa  103  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  40.28 
 
 		 340 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59350  Type IV B pilus protein  27.55 
 
 		 442 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00610666  hitchhiker  0.0000000000033381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4478  type IV pilus protein PilV  26.04 
 
 		 459 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1062  Tail Collar domain protein  39.57 
 
 		 530 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  34.78 
 
 		 262 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5024  hypothetical protein  29.8 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5430  putative adhesin precursor  29.8 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178225  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1817  Tail Collar domain protein  36.62 
 
 		 196 aa  74.7  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386449  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  40.18 
 
 		 557 aa  73.9  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  29.61 
 
 		 371 aa  72.8  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  33.33 
 
 		 485 aa  71.6  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2097  Tail Collar domain protein  37.31 
 
 		 183 aa  71.6  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  42.39 
 
 		 498 aa  72  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1510  prepilin  25.53 
 
 		 468 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00854  hypothetical protein  42.17 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00848  bacteriophage tail fiber protein  42.17 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3032  tail Collar domain protein  42.86 
 
 		 176 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835332 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2758  tail collar domain-containing protein  42.86 
 
 		 177 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0001  shufflon protein, N-terminal constant region  26.48 
 
 		 418 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  49.21 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1540  hypothetical protein  25.87 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0216242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5205  putative adhesin precursor  25.87 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.685771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2198  tail collar domain-containing protein  32.48 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23854  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3092  hypothetical protein  48.24 
 
 		 472 aa  57.8  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.715953  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1141  tail fiber domain-containing protein  31.33 
 
 		 527 aa  55.1  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1692  hypothetical protein  27.12 
 
 		 225 aa  54.7  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.705113  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  39.13 
 
 		 962 aa  54.3  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  27 
 
 		 323 aa  51.2  0.00004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  37.66 
 
 		 1007 aa  50.4  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  37.33 
 
 		 516 aa  50.4  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  37.33 
 
 		 536 aa  49.7  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  27.47 
 
 		 817 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  37.84 
 
 		 1120 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  37.84 
 
 		 1137 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4480  tail collar domain-containing protein  31.41 
 
 		 492 aa  48.5  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.648631 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3393  tail fiber protein, putative  35.09 
 
 		 519 aa  48.9  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  30.63 
 
 		 580 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0873  side tail fiber protein  37.84 
 
 		 441 aa  46.6  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2098  Tail Collar domain protein  37.84 
 
 		 320 aa  46.6  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0113464  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0298  putative tail fiber protein  40.54 
 
 		 264 aa  46.2  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.991261  normal  0.467938 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5249  methylation  24.71 
 
 		 547 aa  45.8  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0506403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5442  hypothetical protein  26.05 
 
 		 507 aa  44.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0103893  normal  0.133635 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  36.62 
 
 		 805 aa  43.9  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  36.62 
 
 		 790 aa  43.9  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  32.56 
 
 		 483 aa  43.5  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  30.3 
 
 		 554 aa  43.5  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>