30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1510 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1510  prepilin  100 
 
 		 468 aa  942    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59350  Type IV B pilus protein  52.42 
 
 		 442 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00610666  hitchhiker  0.0000000000033381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4478  type IV pilus protein PilV  47.7 
 
 		 459 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0001  shufflon protein, N-terminal constant region  36.24 
 
 		 418 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0021  type IV pilus biogenesis protein PilV  34.84 
 
 		 428 aa  233  8.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3727  shufflon protein  33.17 
 
 		 425 aa  227  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0109  shufflon protein B'  35.45 
 
 		 448 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5430  putative adhesin precursor  37.77 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178225  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5024  hypothetical protein  37.77 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5249  methylation  31.3 
 
 		 547 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0506403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5442  hypothetical protein  30.71 
 
 		 507 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0103893  normal  0.133635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1540  hypothetical protein  40 
 
 		 432 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0216242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5205  putative adhesin precursor  40 
 
 		 432 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.685771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0634  shufflon domain protein  25.53 
 
 		 532 aa  88.6  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1603  type IV prepilin  32.75 
 
 		 575 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116074  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0665  type IV prepilin  32.14 
 
 		 575 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.754488  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1986  type IV prepilin  32.14 
 
 		 575 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.610006  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2166  putative type IV pilus protein  32.14 
 
 		 560 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0422322  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2250  putative type IV pilus protein  32.14 
 
 		 560 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0649  type IV prepilin  31.7 
 
 		 560 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48711  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0776  type IV prepilin  26.07 
 
 		 560 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5656  type IV prepilin  31.56 
 
 		 565 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0112418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2071  prepilin-type N- cleavage/methylation domain protein  26.36 
 
 		 478 aa  70.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00288729  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5873  type IV prepilin  31.11 
 
 		 565 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5917  type IV prepilin  29.57 
 
 		 534 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.136349  normal  0.0238074 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3500  hypothetical protein  52.46 
 
 		 899 aa  66.6  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.512789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0064  hypothetical protein  28.88 
 
 		 457 aa  62.4  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583147 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1581  putative type IV prepilin  22.06 
 
 		 482 aa  62  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1761  putative type IV prepilin  24.6 
 
 		 512 aa  56.6  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1109  hypothetical protein  34.52 
 
 		 153 aa  43.9  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.925948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>