30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4478 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4478  type IV pilus protein PilV  100 
 
 		 459 aa  933    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59350  Type IV B pilus protein  89.4 
 
 		 442 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00610666  hitchhiker  0.0000000000033381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1510  prepilin  47.05 
 
 		 468 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0001  shufflon protein, N-terminal constant region  40.12 
 
 		 418 aa  246  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0021  type IV pilus biogenesis protein PilV  37.17 
 
 		 428 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3727  shufflon protein  36.19 
 
 		 425 aa  219  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0109  shufflon protein B'  38.54 
 
 		 448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5024  hypothetical protein  37.92 
 
 		 412 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5430  putative adhesin precursor  37.92 
 
 		 412 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178225  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5249  methylation  33.33 
 
 		 547 aa  127  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0506403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5205  putative adhesin precursor  32.69 
 
 		 432 aa  123  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.685771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1540  hypothetical protein  32.69 
 
 		 432 aa  123  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0216242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5442  hypothetical protein  32.55 
 
 		 507 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0103893  normal  0.133635 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0634  shufflon domain protein  26.04 
 
 		 532 aa  96.7  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1603  type IV prepilin  35.43 
 
 		 575 aa  91.7  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116074  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0665  type IV prepilin  35.43 
 
 		 575 aa  91.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.754488  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1986  type IV prepilin  35.43 
 
 		 575 aa  91.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.610006  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2166  putative type IV pilus protein  35.43 
 
 		 560 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0422322  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2250  putative type IV pilus protein  35.43 
 
 		 560 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0649  type IV prepilin  34.98 
 
 		 560 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48711  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0776  type IV prepilin  34.09 
 
 		 560 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2071  prepilin-type N- cleavage/methylation domain protein  25.12 
 
 		 478 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00288729  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5917  type IV prepilin  32.16 
 
 		 534 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.136349  normal  0.0238074 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5656  type IV prepilin  30 
 
 		 565 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0112418 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5873  type IV prepilin  30.91 
 
 		 565 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0064  hypothetical protein  29 
 
 		 457 aa  68.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583147 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3500  hypothetical protein  52.73 
 
 		 899 aa  67  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.512789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1581  putative type IV prepilin  21.95 
 
 		 482 aa  60.5  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4765  hypothetical protein  22.96 
 
 		 471 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1761  putative type IV prepilin  23.4 
 
 		 512 aa  44.3  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>