26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_A0001 on replicon NC_009704
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009704  YpsIP31758_A0001  shufflon protein, N-terminal constant region  100 
 
 		 418 aa  855    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3727  shufflon protein  39.31 
 
 		 425 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59350  Type IV B pilus protein  40.4 
 
 		 442 aa  239  8e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00610666  hitchhiker  0.0000000000033381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4478  type IV pilus protein PilV  40.12 
 
 		 459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1510  prepilin  34.82 
 
 		 468 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0021  type IV pilus biogenesis protein PilV  33.33 
 
 		 428 aa  183  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0109  shufflon protein B'  30.35 
 
 		 448 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5205  putative adhesin precursor  30.23 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.685771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1540  hypothetical protein  30.23 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0216242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5024  hypothetical protein  33.71 
 
 		 412 aa  110  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5430  putative adhesin precursor  34.19 
 
 		 412 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178225  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5442  hypothetical protein  29.91 
 
 		 507 aa  88.2  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0103893  normal  0.133635 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5249  methylation  26.7 
 
 		 547 aa  84.7  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0506403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3500  hypothetical protein  50 
 
 		 899 aa  70.1  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.512789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0634  shufflon domain protein  26.48 
 
 		 532 aa  68.9  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1581  putative type IV prepilin  22.48 
 
 		 482 aa  62  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2071  prepilin-type N- cleavage/methylation domain protein  23.56 
 
 		 478 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00288729  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1761  putative type IV prepilin  23.15 
 
 		 512 aa  53.9  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1986  type IV prepilin  24.53 
 
 		 575 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.610006  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1603  type IV prepilin  24.53 
 
 		 575 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116074  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0665  type IV prepilin  24.53 
 
 		 575 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.754488  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2166  putative type IV pilus protein  24.84 
 
 		 560 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0422322  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2250  putative type IV pilus protein  24.84 
 
 		 560 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0649  type IV prepilin  25 
 
 		 560 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48711  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0776  type IV prepilin  28.92 
 
 		 560 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5656  type IV prepilin  25.13 
 
 		 565 aa  43.1  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0112418 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>