26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5205 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5205  putative adhesin precursor  100 
 
 
432 aa  857    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.685771  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1540  hypothetical protein  100 
 
 
432 aa  857    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0216242  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5024  hypothetical protein  47.28 
 
 
412 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501103  normal 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5430  putative adhesin precursor  47.28 
 
 
412 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178225  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6558  hypothetical protein  31.67 
 
 
404 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4478  type IV pilus protein PilV  31.59 
 
 
459 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59350  Type IV B pilus protein  31.17 
 
 
442 aa  122  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00610666  hitchhiker  0.0000000000033381 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0001  shufflon protein, N-terminal constant region  30.23 
 
 
418 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0021  type IV pilus biogenesis protein PilV  29.21 
 
 
428 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5558  hypothetical protein  52.54 
 
 
400 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363207  normal  0.0854155 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1510  prepilin  39.52 
 
 
468 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5249  methylation  31.17 
 
 
547 aa  98.6  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0506403  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5442  hypothetical protein  33.33 
 
 
507 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0103893  normal  0.133635 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3727  shufflon protein  27.75 
 
 
425 aa  90.9  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0665  type IV prepilin  36.59 
 
 
575 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.754488  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1986  type IV prepilin  36.59 
 
 
575 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.610006  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1603  type IV prepilin  36.59 
 
 
575 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116074  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2166  putative type IV pilus protein  35.98 
 
 
560 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0422322  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2250  putative type IV pilus protein  35.98 
 
 
560 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0649  type IV prepilin  35.98 
 
 
560 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48711  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0634  shufflon domain protein  26.25 
 
 
532 aa  72.8  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5873  type IV prepilin  29.26 
 
 
565 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5656  type IV prepilin  29.26 
 
 
565 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0112418 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0109  shufflon protein B'  28.27 
 
 
448 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0776  type IV prepilin  32.32 
 
 
560 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5917  type IV prepilin  38.07 
 
 
534 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.136349  normal  0.0238074 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>