25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_5024 on replicon NC_010683
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012851  Rpic12D_5430  putative adhesin precursor  99.76 
 
 		 412 aa  820    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178225  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5024  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  822    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5205  putative adhesin precursor  47.28 
 
 		 432 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.685771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1540  hypothetical protein  47.28 
 
 		 432 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0216242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1510  prepilin  41.85 
 
 		 468 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0021  type IV pilus biogenesis protein PilV  36.32 
 
 		 428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4478  type IV pilus protein PilV  37.39 
 
 		 459 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59350  Type IV B pilus protein  37.39 
 
 		 442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00610666  hitchhiker  0.0000000000033381 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0001  shufflon protein, N-terminal constant region  33.71 
 
 		 418 aa  110  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5249  methylation  32.06 
 
 		 547 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0506403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5442  hypothetical protein  31.54 
 
 		 507 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0103893  normal  0.133635 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3727  shufflon protein  35.12 
 
 		 425 aa  100  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0109  shufflon protein B'  35.44 
 
 		 448 aa  90.1  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1986  type IV prepilin  38.95 
 
 		 575 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.610006  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2250  putative type IV pilus protein  38.51 
 
 		 560 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2166  putative type IV pilus protein  38.51 
 
 		 560 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0422322  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0665  type IV prepilin  38.95 
 
 		 575 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.754488  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1603  type IV prepilin  38.95 
 
 		 575 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116074  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0649  type IV prepilin  38.37 
 
 		 560 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48711  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0634  shufflon domain protein  29.8 
 
 		 532 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5656  type IV prepilin  32.94 
 
 		 565 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0112418 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5873  type IV prepilin  32.42 
 
 		 565 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5917  type IV prepilin  31.9 
 
 		 534 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.136349  normal  0.0238074 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0776  type IV prepilin  36.21 
 
 		 560 aa  72  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5558  hypothetical protein  24.43 
 
 		 400 aa  52.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363207  normal  0.0854155 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>