29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5249 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007949  Bpro_5249  methylation  100 
 
 
547 aa  1099    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0506403  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5442  hypothetical protein  91.68 
 
 
507 aa  878    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0103893  normal  0.133635 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4478  type IV pilus protein PilV  33.33 
 
 
459 aa  117  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59350  Type IV B pilus protein  33.05 
 
 
442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00610666  hitchhiker  0.0000000000033381 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5430  putative adhesin precursor  32.06 
 
 
412 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178225  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5024  hypothetical protein  32.06 
 
 
412 aa  108  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501103  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1510  prepilin  30.43 
 
 
468 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5917  type IV prepilin  32.84 
 
 
534 aa  98.6  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.136349  normal  0.0238074 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0021  type IV pilus biogenesis protein PilV  31.14 
 
 
428 aa  92.8  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2166  putative type IV pilus protein  30.33 
 
 
560 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0422322  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0665  type IV prepilin  30.33 
 
 
575 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.754488  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1986  type IV prepilin  30.33 
 
 
575 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.610006  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2250  putative type IV pilus protein  30.33 
 
 
560 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0001  shufflon protein, N-terminal constant region  26.7 
 
 
418 aa  84.7  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1540  hypothetical protein  31.17 
 
 
432 aa  84.3  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0216242  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5205  putative adhesin precursor  31.17 
 
 
432 aa  84.3  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.685771  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1603  type IV prepilin  30.33 
 
 
575 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116074  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0649  type IV prepilin  30 
 
 
560 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48711  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5656  type IV prepilin  30.94 
 
 
565 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0112418 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5873  type IV prepilin  31.46 
 
 
565 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0776  type IV prepilin  29.59 
 
 
560 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3727  shufflon protein  24.26 
 
 
425 aa  69.7  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0109  shufflon protein B'  32.03 
 
 
448 aa  68.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2598  hypothetical protein  34.52 
 
 
554 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6575  hypothetical protein  33.33 
 
 
555 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.576123  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7311  hypothetical protein  33.33 
 
 
555 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0634  shufflon domain protein  24.71 
 
 
532 aa  45.8  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2013  hypothetical protein  33.33 
 
 
555 aa  45.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4297  hypothetical protein  32.14 
 
 
555 aa  43.5  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>