25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_A0109 on replicon NC_011081
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011081  SeHA_A0109  shufflon protein B'  100 
 
 		 448 aa  906    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3727  shufflon protein  48.6 
 
 		 425 aa  388  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59350  Type IV B pilus protein  39.83 
 
 		 442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00610666  hitchhiker  0.0000000000033381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4478  type IV pilus protein PilV  38.54 
 
 		 459 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1510  prepilin  35.45 
 
 		 468 aa  196  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0021  type IV pilus biogenesis protein PilV  33.33 
 
 		 428 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0001  shufflon protein, N-terminal constant region  30.35 
 
 		 418 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0634  shufflon domain protein  29.85 
 
 		 532 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5430  putative adhesin precursor  35.44 
 
 		 412 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.178225  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5024  hypothetical protein  35.44 
 
 		 412 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5442  hypothetical protein  34.5 
 
 		 507 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0103893  normal  0.133635 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5249  methylation  32.03 
 
 		 547 aa  82.8  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0506403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1540  hypothetical protein  28.84 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0216242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5205  putative adhesin precursor  28.84 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.685771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2071  prepilin-type N- cleavage/methylation domain protein  40.78 
 
 		 478 aa  67  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00288729  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1581  putative type IV prepilin  43.48 
 
 		 482 aa  63.2  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5873  type IV prepilin  27.81 
 
 		 565 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5656  type IV prepilin  28.09 
 
 		 565 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0112418 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0776  type IV prepilin  25.13 
 
 		 560 aa  54.3  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1761  putative type IV prepilin  32.08 
 
 		 512 aa  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7249  hypothetical protein  25.12 
 
 		 426 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2166  putative type IV pilus protein  25.83 
 
 		 560 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0422322  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2250  putative type IV pilus protein  25.83 
 
 		 560 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0649  type IV prepilin  26.67 
 
 		 560 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48711  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1603  type IV prepilin  25.69 
 
 		 575 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0116074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>