120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4560 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4560  sodium/sulphate symporter  100 
 
 		 555 aa  1023    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.760965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4931  sodium/sulphate symporter  44.57 
 
 		 486 aa  259  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2193  sodium/solute symporter family protein  29.75 
 
 		 476 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00348194  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2239  sodium/solute symporter family protein  29.98 
 
 		 473 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.93542e-30 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2055  sodium/solute symporter family protein  29.31 
 
 		 476 aa  220  6e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0229525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2211  sodium/solute symporter family protein  29.31 
 
 		 476 aa  220  6e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  25.86 
 
 		 533 aa  101  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0363  sodium/sulphate symporter  24.8 
 
 		 532 aa  99  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288684  hitchhiker  0.00000731788 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3654  anion transporter  26.37 
 
 		 422 aa  96.7  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3548  anion transporter  26.37 
 
 		 422 aa  96.7  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3619  anion transporter  26.37 
 
 		 422 aa  96.3  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.254252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3716  anion transporter  26.37 
 
 		 422 aa  96.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.672339 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  27.8 
 
 		 482 aa  93.2  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4053  sodium/sulphate symporter  30.41 
 
 		 434 aa  91.3  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3547  anion transporter  26.82 
 
 		 422 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1909  sodium/sulphate symporter  25.87 
 
 		 463 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1867  sodium/sulphate symporter  29.84 
 
 		 462 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.970119  normal  0.269593 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  25.97 
 
 		 483 aa  84  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2111  sodium/sulphate symporter  28.48 
 
 		 462 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2351  sodium/sulphate symporter  28.29 
 
 		 463 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.9001  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2340  sodium/sulphate symporter  27.91 
 
 		 463 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2456  sodium/sulphate symporter  27.52 
 
 		 463 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.240991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2007  sodium/sulphate symporter  28.68 
 
 		 463 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000568868 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1922  sodium/sulphate symporter  27.66 
 
 		 462 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  25.44 
 
 		 568 aa  79  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0787  sodium/sulphate symporter  26.32 
 
 		 491 aa  78.6  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  25.06 
 
 		 483 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  25.79 
 
 		 493 aa  77.8  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7176  sodium/sulphate symporter  31.29 
 
 		 433 aa  77  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6317  sodium/sulphate symporter  32.01 
 
 		 433 aa  77  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  hitchhiker  0.00328538 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  25.72 
 
 		 458 aa  76.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  21.27 
 
 		 489 aa  74.3  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43990  sodium/solute symporter protein  29.32 
 
 		 432 aa  72.8  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  25.36 
 
 		 482 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  26.55 
 
 		 478 aa  67  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  27.12 
 
 		 510 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0456  sodium/sulphate symporter  30.27 
 
 		 433 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  22.37 
 
 		 470 aa  63.9  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  26.71 
 
 		 462 aa  63.9  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  28.24 
 
 		 456 aa  62  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1482  sodium/sulphate symporter  25 
 
 		 478 aa  61.6  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0963428 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0892  anion transporter  25.57 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0801  anion transporter  25.57 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0860  anion transporter  25.57 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.918843  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  23.38 
 
 		 518 aa  61.2  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0829  anion transporter  25.78 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  22.73 
 
 		 517 aa  60.8  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  22.73 
 
 		 517 aa  60.8  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1851  sodium/sulphate symporter  26.7 
 
 		 521 aa  60.8  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  25.63 
 
 		 460 aa  60.8  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  26.82 
 
 		 491 aa  60.8  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1048  DASS family divalent anion:Na(+) symporter  26.21 
 
 		 473 aa  60.1  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.486409 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  27.21 
 
 		 491 aa  60.1  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  26.57 
 
 		 486 aa  59.7  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01988  Na+/dicarboxylate symporter  22.83 
 
 		 478 aa  59.7  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5269  sodium/sulphate symporter  25.95 
 
 		 530 aa  59.3  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.438877 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1343  sodium/sulphate symporter  21.57 
 
 		 618 aa  58.5  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5677  sodium/sulphate symporter  28.49 
 
 		 465 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0143035  normal  0.0333919 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4275  sodium/sulphate symporter  30.39 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5900  sodium/sulphate symporter  28.22 
 
 		 465 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.020602 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  22.69 
 
 		 485 aa  58.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1559  sodium/sulphate symporter  31.7 
 
 		 502 aa  57.8  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  25.82 
 
 		 513 aa  57  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0889  anion transporter  27.86 
 
 		 495 aa  57  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517689  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00580  citrate:succinate antiporter  25.55 
 
 		 487 aa  57  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3013  anion transporter  25.55 
 
 		 487 aa  57  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0421609  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0663  sodium:sulfate symporter family protein  25.55 
 
 		 487 aa  57  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0634  citrate transporter  25.55 
 
 		 487 aa  57  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3032  anion transporter  25.55 
 
 		 487 aa  57  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00569  hypothetical protein  25.55 
 
 		 487 aa  57  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0700  sodium:sulfate symporter family protein  25.55 
 
 		 476 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  21.92 
 
 		 459 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  31.74 
 
 		 600 aa  55.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  28.18 
 
 		 456 aa  55.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  24.48 
 
 		 557 aa  54.7  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  21.97 
 
 		 446 aa  54.3  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0672  sodium:sulfate symporter family protein  24.94 
 
 		 487 aa  54.7  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07320  anion transporter  24.29 
 
 		 526 aa  53.5  0.000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.039375  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0658  sodium:sulfate symporter family protein  24.7 
 
 		 487 aa  53.5  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00118  sodium-dependent transporter  26.88 
 
 		 471 aa  52.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1359  anion transporter  23.33 
 
 		 534 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3599  sodium/sulphate symporter  31.14 
 
 		 441 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.914538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0731  sodium:sulfate symporter family protein  24.94 
 
 		 487 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0777  sodium:sulfate symporter family protein  24.7 
 
 		 487 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.406229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2740  putative transporter  25.16 
 
 		 478 aa  52.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997908  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002249  transporter  25.57 
 
 		 471 aa  52.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154168  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0631  sodium:sulfate symporter family protein  24.88 
 
 		 476 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1421  anion transporter  25.52 
 
 		 474 aa  52  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0194982  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  23.43 
 
 		 522 aa  52  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  21.65 
 
 		 489 aa  52  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0281  anion transporter  26.32 
 
 		 505 aa  51.2  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1868  sodium/sulphate symporter  21.74 
 
 		 461 aa  51.2  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1358  helix-turn-helix, AraC type  26 
 
 		 467 aa  50.8  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  27.43 
 
 		 490 aa  50.4  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2041  sodium/sulphate symporter  22.71 
 
 		 488 aa  49.7  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341922  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3207  divalent anion:sodium symporter family protein  25.08 
 
 		 474 aa  49.7  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  24.32 
 
 		 514 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  22.32 
 
 		 536 aa  48.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3165  anion transporter  24.01 
 
 		 487 aa  48.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  23.28 
 
 		 507 aa  47.8  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>