285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1936 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1936  lipoyltransferase  100 
 
 		 218 aa  441  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00922586 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0665  lipoate-protein ligase B  73.83 
 
 		 218 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119674  normal  0.0262975 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  71.7 
 
 		 246 aa  319  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  72.43 
 
 		 267 aa  316  2e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0528  lipoate-protein ligase B  71.96 
 
 		 218 aa  315  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.740621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1878  lipoate-protein ligase B  71.96 
 
 		 218 aa  315  4e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  71.96 
 
 		 267 aa  315  5e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  72.17 
 
 		 270 aa  311  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  71.03 
 
 		 216 aa  310  1e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  67.44 
 
 		 220 aa  302  3.0000000000000004e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  69.01 
 
 		 239 aa  298  3e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  68.08 
 
 		 244 aa  294  8e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  68.08 
 
 		 262 aa  294  9e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  64.79 
 
 		 243 aa  293  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3088  lipoyltransferase  68.22 
 
 		 225 aa  287  7e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3083  lipoate-protein ligase B  68.54 
 
 		 255 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  63.51 
 
 		 243 aa  272  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  62.96 
 
 		 237 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2074  lipoate-protein ligase B  63.43 
 
 		 237 aa  272  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  64.15 
 
 		 236 aa  272  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  57.48 
 
 		 241 aa  272  3e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3161  lipoate-protein ligase B  69.16 
 
 		 241 aa  269  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2371  lipoate-protein ligase B  65.73 
 
 		 255 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417087  normal  0.838068 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  62.74 
 
 		 225 aa  266  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  63.26 
 
 		 216 aa  264  8e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  60.09 
 
 		 262 aa  263  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1745  lipoate-protein ligase B  67.28 
 
 		 226 aa  259  3e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548162  normal  0.138545 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  64.32 
 
 		 244 aa  259  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3348  lipoate-protein ligase B  67.13 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  63.85 
 
 		 244 aa  257  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2290  lipoate-protein ligase B  62.21 
 
 		 228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  62.67 
 
 		 241 aa  252  3e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3579  lipoate-protein ligase B  67.14 
 
 		 245 aa  252  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4892  lipoate-protein ligase B  65.26 
 
 		 240 aa  249  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  59.42 
 
 		 217 aa  247  9e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  60.29 
 
 		 223 aa  246  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4726  lipoate-protein ligase B  65.05 
 
 		 211 aa  244  8e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.78228  normal  0.0194812 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5311  lipoate-protein ligase B  65.57 
 
 		 235 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1731  lipoyltransferase  59.15 
 
 		 231 aa  239  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.558674  normal  0.523049 
 
 
-
 
NC_002978  WD1014  lipoate-protein ligase B  46.73 
 
 		 205 aa  233  2.0000000000000002e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.449501  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0371  lipoate-protein ligase B  44.04 
 
 		 214 aa  215  5e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0131987  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  56.99 
 
 		 222 aa  214  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0640  lipoate-protein ligase B  42.66 
 
 		 214 aa  207  1e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0120  lipoate-protein ligase B  49.33 
 
 		 232 aa  203  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.580477  normal  0.0291639 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0100  lipoate-protein ligase B  43.93 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0288  lipoate-protein ligase B  40.74 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  40.38 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  40.58 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0269  lipoate-protein ligase B  42.16 
 
 		 218 aa  142  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.896037 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2704  lipoate-protein ligase B  41.35 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  39.78 
 
 		 214 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0665  lipoate-protein ligase B  41.97 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  43.37 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  43.02 
 
 		 224 aa  136  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0528  lipoate-protein ligase B  39.6 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1669  lipoyltransferase  35.16 
 
 		 214 aa  135  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4819  lipoate-protein ligase B  39.32 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0555  lipoate-protein ligase B  44.13 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.668487  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4359  lipoate-protein ligase B  38.83 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  36.32 
 
 		 230 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0659  lipoate-protein ligase B  40.22 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0600  lipoate-protein ligase B  43.58 
 
 		 226 aa  132  5e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0216  lipoate-protein ligase B  40.38 
 
 		 255 aa  132  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0244  lipoate-protein ligase B  40.48 
 
 		 222 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0179  lipoate-protein ligase B  39.5 
 
 		 215 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.799971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2954  lipoate-protein ligase B  40.22 
 
 		 233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000757866  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  40.22 
 
 		 259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  40.45 
 
 		 227 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1962  lipoyltransferase  33.94 
 
 		 214 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4213  lipoate-protein ligase B  40.58 
 
 		 241 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3155  lipoate-protein ligase B  38.98 
 
 		 227 aa  128  7.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0109  lipoate-protein ligase B  41.71 
 
 		 207 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20872  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  37.31 
 
 		 244 aa  128  8.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1176  lipoate-protein ligase B  39.43 
 
 		 227 aa  127  9.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000926852  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3026  lipoate-protein ligase B  39.66 
 
 		 233 aa  127  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0519842  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3029  lipoate-protein ligase B  38.92 
 
 		 216 aa  127  9.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.572663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1854  lipoate-protein ligase B  39.66 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4854  lipoate-protein ligase B  35.92 
 
 		 215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0385  lipoate-protein ligase B  36.36 
 
 		 255 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.915915  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0411  lipoate-protein ligase B  36.73 
 
 		 241 aa  126  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1196  lipoate-protein ligase B  38.42 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0503  lipoate-protein ligase B  43.09 
 
 		 241 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.052969 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3935  lipoate-protein ligase B  36.65 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385529  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4801  lipoate-protein ligase B  36.41 
 
 		 216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.255218 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3335  lipoate-protein ligase B  41.08 
 
 		 216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000375701  normal  0.0176495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3326  lipoate-protein ligase B  40.61 
 
 		 213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4676  lipoate-protein ligase B  36.41 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.946401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0620  lipoate-protein ligase B  35.92 
 
 		 215 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0053  lipoate-protein ligase B  38.76 
 
 		 257 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0626  lipoate-protein ligase B  38.76 
 
 		 254 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  34.1 
 
 		 221 aa  125  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0085  lipoate-protein ligase B  41.71 
 
 		 236 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51227  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0219  lipoate-protein ligase B  38.76 
 
 		 249 aa  124  9e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3187  lipoate-protein ligase B  38.76 
 
 		 249 aa  124  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.498526  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0463  lipoate-protein ligase B  38.76 
 
 		 246 aa  124  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0443  lipoate-protein ligase B  38.76 
 
 		 252 aa  124  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1374  lipoate-protein ligase B  38.76 
 
 		 249 aa  124  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  38.22 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3560  lipoate-protein ligase B  39.34 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1551  lipoate-protein ligase B  37.62 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>