More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0774 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0768  dihydrolipoamide dehydrogenase  89.82 
 
 
511 aa  956    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.377987 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0774  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
511 aa  1057    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1769  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.97 
 
 
515 aa  550  1e-155  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0826  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.44 
 
 
489 aa  356  5e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4777  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.77 
 
 
482 aa  351  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000411672 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1974  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.83 
 
 
479 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3487  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.21 
 
 
479 aa  348  1e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0135  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.98 
 
 
487 aa  346  7e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2215  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.95 
 
 
484 aa  345  8.999999999999999e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4081  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.98 
 
 
487 aa  345  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3889  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.98 
 
 
487 aa  345  1e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.523756 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002318  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.47 
 
 
490 aa  340  2.9999999999999998e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00037  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.11 
 
 
490 aa  339  7e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4451  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.24 
 
 
466 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2712  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.89 
 
 
488 aa  330  3e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3471  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.48 
 
 
483 aa  326  6e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.654288  normal  0.739502 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2433  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 
470 aa  323  3e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.284173  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1181  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.33 
 
 
469 aa  324  3e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1714  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4888  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.98 
 
 
480 aa  323  4e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226887  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1254  dihydrolipoamide dehydrogenase  40 
 
 
489 aa  323  6e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0240  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  38.52 
 
 
497 aa  320  3.9999999999999996e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2524  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.71 
 
 
481 aa  318  1e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.698329  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.62 
 
 
473 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5354  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.35 
 
 
464 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0181  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.2 
 
 
484 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2245  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.49 
 
 
470 aa  310  5.9999999999999995e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1629  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.98 
 
 
470 aa  309  6.999999999999999e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.361871  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0121  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.66 
 
 
474 aa  309  6.999999999999999e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.89 
 
 
474 aa  302  9e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0680162  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3949  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.21 
 
 
464 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.479691 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2075  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.14 
 
 
500 aa  298  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0140167  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4080  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.13 
 
 
460 aa  286  5e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4448  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.71 
 
 
460 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0145  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.64 
 
 
465 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.709282  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0645  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.98 
 
 
462 aa  279  9e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4561  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.53 
 
 
456 aa  276  8e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.198826  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1491  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.89 
 
 
469 aa  271  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3724  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.2 
 
 
461 aa  249  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.859961  normal  0.138612 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1352  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.18 
 
 
455 aa  243  5e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2398  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.85 
 
 
458 aa  240  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  hitchhiker  0.00000373105 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3245  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.04 
 
 
466 aa  237  4e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114174  hitchhiker  0.00583811 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.04 
 
 
467 aa  174  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.32 
 
 
467 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.19 
 
 
463 aa  172  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.11 
 
 
467 aa  172  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.52 
 
 
458 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.39 
 
 
471 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.03 
 
 
465 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.24 
 
 
467 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.03 
 
 
467 aa  164  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63850  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.93 
 
 
467 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.63 
 
 
468 aa  163  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4996  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.3 
 
 
462 aa  162  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.48 
 
 
463 aa  161  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3504  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.21 
 
 
465 aa  160  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.305711 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.36 
 
 
467 aa  160  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.39 
 
 
581 aa  158  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.78 
 
 
492 aa  159  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.75 
 
 
463 aa  158  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  28.63 
 
 
550 aa  159  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.81 
 
 
462 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.42 
 
 
467 aa  157  5.0000000000000005e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0703  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.27 
 
 
454 aa  157  6e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3460  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.45 
 
 
458 aa  156  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.09 
 
 
462 aa  156  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.6 
 
 
462 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.09 
 
 
468 aa  156  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.13 
 
 
464 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.15 
 
 
466 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.18 
 
 
562 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.18 
 
 
458 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.36 
 
 
468 aa  154  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0984  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.57 
 
 
457 aa  154  4e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.365373  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.62 
 
 
467 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  28.28 
 
 
457 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00285558  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2575  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.21 
 
 
459 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0023205  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2886  dihydrolipoyl dehydrogenase  29.15 
 
 
464 aa  152  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0945112  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.11 
 
 
467 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.81 
 
 
470 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  28.31 
 
 
466 aa  152  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1978  hypothetical protein  27.64 
 
 
462 aa  152  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.3 
 
 
465 aa  151  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0551  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.21 
 
 
464 aa  151  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.09 
 
 
467 aa  151  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.72 
 
 
466 aa  150  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.85 
 
 
468 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.54 
 
 
468 aa  150  6e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4269  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.71 
 
 
462 aa  150  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.170998  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0235  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.94 
 
 
466 aa  149  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.71 
 
 
470 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.1 
 
 
482 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2168  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.86 
 
 
466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1451  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.3 
 
 
466 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1363  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.85 
 
 
448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  29.21 
 
 
767 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2479  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.57 
 
 
467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6148  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.82 
 
 
461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268459  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.84 
 
 
464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1104  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.59 
 
 
466 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550844  normal  0.0253682 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.35 
 
 
468 aa  149  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>