91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0638 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0638  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  522  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3531  hypothetical protein  34.67 
 
 		 276 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4747  TM helix repeat-containing protein  26.64 
 
 		 275 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00173258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41590  putative cytoplasmic membrane protein  36.92 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1708  TM helix protein  36.36 
 
 		 261 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0232168  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23310  Mechanosensitive ion channel protein  34.57 
 
 		 274 aa  116  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2090  TM helix repeat-containing protein  34.86 
 
 		 274 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00247017  normal  0.258692 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2078  TM helix protein  28.57 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1406  TM helix protein  30.81 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0345535  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0961  hypothetical protein  31.2 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1775  TM helix protein  33.94 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2095  TM helix protein  34.11 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0461104  hitchhiker  0.00386478 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2297  hypothetical protein  34.74 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000644862  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1605  TM helix repeat-containing protein  33.49 
 
 		 274 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00681338  decreased coverage  0.000000000154997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1598  TM helix repeat-containing protein  33.03 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0082628  hitchhiker  0.00441813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3653  TM helix repeat-containing protein  33.49 
 
 		 274 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0445182  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2087  TM helix repeat-containing protein  33.49 
 
 		 274 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.245727  normal  0.0375248 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2632  TM helix repeat-containing protein  33.09 
 
 		 273 aa  95.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.225391  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1981  TM helix repeat-containing protein  29.21 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2159  TM helix protein  30.88 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.760211  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1259  CmpX protein  30.23 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1308  hypothetical protein  27.67 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2021  TM helix repeat-containing protein  34.16 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16810  hypothetical protein  29.35 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.403378 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1614  TM helix repeat-containing protein  28.05 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.232731  normal  0.487938 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2965  hypothetical protein  30.39 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1719  TM helix repeat-containing protein  34.21 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.082128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1787  TM helix repeat-containing protein  34.21 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1740  TM helix protein  34.21 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1684  TM helix repeat-containing protein  26.25 
 
 		 499 aa  62  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5533  TM helix repeat-containing protein  26.11 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  0.837846 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0909  TM helix repeat-containing protein  25.83 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2252  TM helix repeat-containing protein  26.15 
 
 		 525 aa  56.2  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1737  TM helix repeat-containing protein  32 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.5984  decreased coverage  0.000938993 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3099  hypothetical protein  31.19 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.526593  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2465  hypothetical protein  24.6 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1751  TM helix repeat-containing protein  30.86 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.232886 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1787  TM helix protein  31.05 
 
 		 494 aa  54.7  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2091  hypothetical protein  23.66 
 
 		 582 aa  52.4  0.000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.395964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2407  TM helix protein  23.66 
 
 		 565 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0449  hypothetical protein  27.33 
 
 		 235 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1056  TM helix repeat-containing protein  27.18 
 
 		 229 aa  52  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0376279  normal  0.186599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1329  TM helix repeat-containing protein  31.28 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00100917  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0517  hypothetical protein  26.49 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.328951  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0334  TM helix repeat-containing protein  25.62 
 
 		 228 aa  50.8  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.172175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  34 
 
 		 310 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3828  Conserved TM helix repeat-containing protein  28.19 
 
 		 265 aa  49.7  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.222399 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0477  hypothetical protein  26.86 
 
 		 236 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0967701  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  30.43 
 
 		 311 aa  49.3  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0482  hypothetical protein  27.33 
 
 		 236 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3213  TM helix protein  27.32 
 
 		 486 aa  48.9  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.529906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1704  TM helix repeat-containing protein  25 
 
 		 228 aa  48.9  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2715  small-conductance mechanosensitive channel  40 
 
 		 270 aa  48.9  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3200  hypothetical protein  30.95 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.384687  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3041  hypothetical protein  27.61 
 
 		 487 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5911  TM helix repeat-containing protein  26.7 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2978  hypothetical protein  27.61 
 
 		 487 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0146  hypothetical protein  27.61 
 
 		 487 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.279624  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  32.74 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0500  TM helix protein  23.36 
 
 		 547 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.587519  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1301  TM helix repeat-containing protein  27.27 
 
 		 543 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3329  hypothetical protein  27.61 
 
 		 503 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4016  hypothetical protein  27.61 
 
 		 503 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1560  hypothetical protein  27.61 
 
 		 503 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3944  hypothetical protein  27.61 
 
 		 503 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0127  TM helix repeat-containing protein  27.82 
 
 		 487 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0141  TM helix repeat-containing protein  27.82 
 
 		 487 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  33.73 
 
 		 288 aa  47.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2928  TM helix protein  27.82 
 
 		 487 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606719  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1569  MscS mechanosensitive ion channel  26.35 
 
 		 342 aa  47.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0300  hypothetical protein  28.11 
 
 		 260 aa  47.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0317825  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05319  hypothetical protein  26.32 
 
 		 487 aa  47  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.243091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1329  TM helix repeat-containing protein  27.27 
 
 		 543 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521958 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0220  hypothetical protein  28.24 
 
 		 241 aa  47  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0117  TM helix repeat-containing protein  29.1 
 
 		 487 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0127  TM helix repeat-containing protein  29.1 
 
 		 487 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3000  hypothetical protein  32.37 
 
 		 240 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  29.41 
 
 		 288 aa  45.8  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3286  hypothetical protein  26.12 
 
 		 487 aa  45.8  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4521  MscS Mechanosensitive ion channel  29.24 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0141  MscS Mechanosensitive ion channel  34.62 
 
 		 373 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195967  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4182  MscS mechanosensitive ion channel  29.34 
 
 		 324 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3307  hypothetical protein  27.61 
 
 		 487 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0125  TM helix repeat-containing protein  27.07 
 
 		 487 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0505  MscS Mechanosensitive ion channel  21.25 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.271457  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0381  hypothetical protein  28.33 
 
 		 189 aa  43.5  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  37.65 
 
 		 295 aa  42.7  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1441  mechanosensitive ion channel  24.7 
 
 		 262 aa  43.1  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  25.81 
 
 		 288 aa  42  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2162  periplasmic binding protein; mechanosensitive ion channel component  28.28 
 
 		 794 aa  42  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>