20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_0482 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0482  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  447  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0477  hypothetical protein  98.73 
 
 
236 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0967701  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0449  hypothetical protein  96.19 
 
 
235 aa  394  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2965  hypothetical protein  37.76 
 
 
239 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3099  hypothetical protein  37.08 
 
 
240 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.526593  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3000  hypothetical protein  38.75 
 
 
240 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3200  hypothetical protein  37.5 
 
 
240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.384687  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1981  TM helix repeat-containing protein  28.69 
 
 
246 aa  75.9  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1406  TM helix protein  26.54 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0345535  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2159  TM helix protein  28.41 
 
 
230 aa  64.7  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.760211  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2021  TM helix repeat-containing protein  32.39 
 
 
239 aa  62.4  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4747  TM helix repeat-containing protein  23.04 
 
 
275 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00173258  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1259  CmpX protein  30.95 
 
 
221 aa  59.3  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0500  TM helix protein  28.39 
 
 
547 aa  53.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.587519  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1684  TM helix repeat-containing protein  22.75 
 
 
499 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2407  TM helix protein  21.96 
 
 
565 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533371  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2078  TM helix protein  24.35 
 
 
276 aa  49.7  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2252  TM helix repeat-containing protein  27.78 
 
 
525 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2091  hypothetical protein  21.21 
 
 
582 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.395964  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1308  hypothetical protein  18.85 
 
 
227 aa  42  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>