49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3000 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3000  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  444  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3099  hypothetical protein  90.83 
 
 		 240 aa  381  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.526593  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3200  hypothetical protein  92.08 
 
 		 240 aa  356  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.384687  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2965  hypothetical protein  64.58 
 
 		 239 aa  277  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0477  hypothetical protein  38.75 
 
 		 236 aa  134  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0967701  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0449  hypothetical protein  38.33 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0482  hypothetical protein  38.75 
 
 		 236 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4747  TM helix repeat-containing protein  26.29 
 
 		 275 aa  79  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00173258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1406  TM helix protein  26.42 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0345535  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2078  TM helix protein  27.06 
 
 		 276 aa  68.6  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2159  TM helix protein  26.79 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.760211  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1259  CmpX protein  28 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1981  TM helix repeat-containing protein  28.7 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2252  TM helix repeat-containing protein  24.37 
 
 		 525 aa  57.8  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2091  hypothetical protein  25.54 
 
 		 582 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.395964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3213  TM helix protein  37.82 
 
 		 486 aa  56.2  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.529906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2407  TM helix protein  25 
 
 		 565 aa  56.2  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3286  hypothetical protein  31.11 
 
 		 487 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1560  hypothetical protein  31.54 
 
 		 503 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3329  hypothetical protein  31.54 
 
 		 503 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3944  hypothetical protein  31.54 
 
 		 503 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4016  hypothetical protein  31.54 
 
 		 503 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0500  TM helix protein  26.51 
 
 		 547 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.587519  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0146  hypothetical protein  29.78 
 
 		 487 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.279624  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2632  TM helix repeat-containing protein  31.78 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.225391  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2978  hypothetical protein  31.54 
 
 		 487 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3041  hypothetical protein  31.54 
 
 		 487 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0117  TM helix repeat-containing protein  29.9 
 
 		 487 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0127  TM helix repeat-containing protein  29.9 
 
 		 487 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0125  TM helix repeat-containing protein  29.46 
 
 		 487 aa  52.4  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1308  hypothetical protein  23.04 
 
 		 227 aa  52.4  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0127  TM helix repeat-containing protein  29 
 
 		 487 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0141  TM helix repeat-containing protein  29 
 
 		 487 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2928  TM helix protein  29 
 
 		 487 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606719  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3307  hypothetical protein  29.35 
 
 		 487 aa  52  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05319  hypothetical protein  28.72 
 
 		 487 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.243091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2021  TM helix repeat-containing protein  27.87 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1708  TM helix protein  30.16 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0232168  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5911  TM helix repeat-containing protein  26.9 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1684  TM helix repeat-containing protein  25.56 
 
 		 499 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1787  TM helix protein  26.8 
 
 		 494 aa  46.6  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0961  hypothetical protein  23.67 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3531  hypothetical protein  31.71 
 
 		 276 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1719  TM helix repeat-containing protein  30.61 
 
 		 335 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.082128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41590  putative cytoplasmic membrane protein  31.71 
 
 		 274 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1329  TM helix repeat-containing protein  31.79 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00100917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1787  TM helix repeat-containing protein  30.61 
 
 		 335 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1740  TM helix protein  30.61 
 
 		 335 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16810  hypothetical protein  26.92 
 
 		 257 aa  42.4  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.403378 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>