53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1308 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_1308  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  441  1e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2078  TM helix protein  28.18 
 
 		 276 aa  89.7  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2159  TM helix protein  27.92 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.760211  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1406  TM helix protein  27.68 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0345535  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2021  TM helix repeat-containing protein  28.57 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1981  TM helix repeat-containing protein  23.5 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2090  TM helix repeat-containing protein  27.49 
 
 		 274 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00247017  normal  0.258692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4747  TM helix repeat-containing protein  25.12 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00173258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23310  Mechanosensitive ion channel protein  26.13 
 
 		 274 aa  65.1  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1259  CmpX protein  25.7 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2091  hypothetical protein  23.18 
 
 		 582 aa  62  0.000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.395964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2407  TM helix protein  23.72 
 
 		 565 aa  61.6  0.000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2965  hypothetical protein  25.27 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0961  hypothetical protein  25.25 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1775  TM helix protein  27.17 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0500  TM helix protein  22.55 
 
 		 547 aa  57  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.587519  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1605  TM helix repeat-containing protein  25.88 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00681338  decreased coverage  0.000000000154997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1598  TM helix repeat-containing protein  25.88 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0082628  hitchhiker  0.00441813 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2252  TM helix repeat-containing protein  24.65 
 
 		 525 aa  56.2  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3653  TM helix repeat-containing protein  25.88 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0445182  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2087  TM helix repeat-containing protein  25.88 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.245727  normal  0.0375248 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1614  TM helix repeat-containing protein  23.71 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.232731  normal  0.487938 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0638  hypothetical protein  27.67 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05319  hypothetical protein  20.09 
 
 		 487 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.243091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3307  hypothetical protein  19.72 
 
 		 487 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16810  hypothetical protein  25 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.403378 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2928  TM helix protein  19.72 
 
 		 487 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606719  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0127  TM helix repeat-containing protein  19.72 
 
 		 487 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0125  TM helix repeat-containing protein  19.72 
 
 		 487 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0141  TM helix repeat-containing protein  19.72 
 
 		 487 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2297  hypothetical protein  26.29 
 
 		 274 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000644862  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0127  TM helix repeat-containing protein  19.27 
 
 		 487 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0117  TM helix repeat-containing protein  19.27 
 
 		 487 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2095  TM helix protein  25.71 
 
 		 274 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0461104  hitchhiker  0.00386478 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0449  hypothetical protein  20.99 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0220  hypothetical protein  21.6 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1441  conserved TM helix repeat-containing protein  21.5 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3213  TM helix protein  20.7 
 
 		 486 aa  45.4  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.529906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1787  TM helix protein  22.71 
 
 		 494 aa  43.5  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0146  hypothetical protein  20.32 
 
 		 487 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.279624  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3041  hypothetical protein  20.32 
 
 		 487 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4016  hypothetical protein  20.32 
 
 		 503 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3944  hypothetical protein  20.32 
 
 		 503 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1560  hypothetical protein  20.32 
 
 		 503 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3329  hypothetical protein  20.32 
 
 		 503 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1708  TM helix protein  23.83 
 
 		 261 aa  43.5  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0232168  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2978  hypothetical protein  20.32 
 
 		 487 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0482  hypothetical protein  18.54 
 
 		 236 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1346  hypothetical protein  26.53 
 
 		 220 aa  42.7  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.161879 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0477  hypothetical protein  18.78 
 
 		 236 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0967701  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1751  TM helix repeat-containing protein  23.31 
 
 		 287 aa  42.4  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.232886 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3286  hypothetical protein  20 
 
 		 487 aa  42.4  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0455  TM helix repeat-containing protein  22.06 
 
 		 229 aa  42  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>