129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2632 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2632  TM helix repeat-containing protein  100 
 
 		 273 aa  525  1e-148  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.225391  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1708  TM helix protein  46.77 
 
 		 261 aa  203  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0232168  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2078  TM helix protein  27.78 
 
 		 276 aa  97.8  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0638  hypothetical protein  33.33 
 
 		 278 aa  87  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4747  TM helix repeat-containing protein  25 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00173258  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0961  hypothetical protein  25.2 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2965  hypothetical protein  32.11 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23310  Mechanosensitive ion channel protein  31.35 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2095  TM helix protein  30.65 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0461104  hitchhiker  0.00386478 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1598  TM helix repeat-containing protein  31.03 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0082628  hitchhiker  0.00441813 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2297  hypothetical protein  31.42 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000644862  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1981  TM helix repeat-containing protein  29.44 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2159  TM helix protein  30.19 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.760211  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16810  hypothetical protein  29.21 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.403378 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2087  TM helix repeat-containing protein  30.65 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.245727  normal  0.0375248 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2090  TM helix repeat-containing protein  29.49 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00247017  normal  0.258692 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3653  TM helix repeat-containing protein  30.65 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0445182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0909  TM helix repeat-containing protein  27.54 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41590  putative cytoplasmic membrane protein  29.63 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3531  hypothetical protein  29.63 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1329  TM helix repeat-containing protein  31.11 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00100917  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1605  TM helix repeat-containing protein  30.27 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00681338  decreased coverage  0.000000000154997 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3200  hypothetical protein  32.99 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.384687  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1406  TM helix protein  25.82 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0345535  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3099  hypothetical protein  32.99 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.526593  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1247  transmembrane protein  34.19 
 
 		 435 aa  58.9  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.072199  normal  0.308743 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1719  TM helix repeat-containing protein  28.65 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.082128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1614  TM helix repeat-containing protein  27.03 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.232731  normal  0.487938 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  27.61 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1740  TM helix protein  28.65 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1245  ion channel protein  31.21 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1787  TM helix repeat-containing protein  28.65 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3144  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 444 aa  57  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2021  TM helix repeat-containing protein  32.11 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1222  MscS mechanosensitive ion channel  29.22 
 
 		 451 aa  57  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.110808  normal  0.111103 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2389  MscS mechanosensitive ion channel  31.48 
 
 		 429 aa  55.8  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2527  MscS mechanosensitive ion channel  33.9 
 
 		 427 aa  55.5  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0449  hypothetical protein  25.95 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1775  TM helix protein  28.74 
 
 		 274 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3066  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 452 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0482  hypothetical protein  27.44 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2555  MscS mechanosensitive ion channel  32.46 
 
 		 460 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0220  hypothetical protein  27.86 
 
 		 241 aa  53.9  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1751  TM helix repeat-containing protein  27.1 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.232886 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1441  mechanosensitive ion channel  25.79 
 
 		 262 aa  53.9  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2238  mechanosensitive ion channel family protein  32.46 
 
 		 449 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1129  mechanosensitive ion channel family protein  32.46 
 
 		 449 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0774  mechanosensitive ion channel family protein  32.46 
 
 		 450 aa  53.5  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0300  hypothetical protein  24.9 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0317825  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2654  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  32.46 
 
 		 450 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1029  mechanosensitive ion channel family protein  32.46 
 
 		 450 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.165892  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0971  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  32.46 
 
 		 450 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0975  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  32.46 
 
 		 450 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2108  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  32.46 
 
 		 450 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2426  MscS mechanosensitive ion channel  32.46 
 
 		 460 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610338  hitchhiker  0.0000133571 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1259  CmpX protein  28.57 
 
 		 221 aa  52.4  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1737  TM helix repeat-containing protein  26.8 
 
 		 287 aa  52.8  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.5984  decreased coverage  0.000938993 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  32.32 
 
 		 796 aa  51.6  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2273  MscS mechanosensitive ion channel  28.86 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1684  TM helix repeat-containing protein  23.39 
 
 		 499 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0477  hypothetical protein  26.83 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0967701  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  24.54 
 
 		 277 aa  51.6  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2247  hypothetical protein  28.4 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.208343 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3000  hypothetical protein  33.33 
 
 		 240 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0811  small-conductance mechanosensitive channel protein  33.93 
 
 		 451 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0541  MscS mechanosensitive ion channel  24.49 
 
 		 273 aa  50.8  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3155  MscS Mechanosensitive ion channel  33.93 
 
 		 451 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00105623  normal  0.0641339 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0812  small-conductance mechanosensitive channel  25.3 
 
 		 274 aa  50.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1787  TM helix protein  27.23 
 
 		 494 aa  49.7  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5533  TM helix repeat-containing protein  24.57 
 
 		 272 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  0.837846 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0578  MscS mechanosensitive ion channel  32.71 
 
 		 451 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.605561  normal  0.183245 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2091  hypothetical protein  22.55 
 
 		 582 aa  48.9  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.395964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  31.86 
 
 		 840 aa  48.9  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3684  MscS mechanosensitive ion channel  26.22 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3828  Conserved TM helix repeat-containing protein  25.29 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.222399 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2252  TM helix repeat-containing protein  24.78 
 
 		 525 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0104  mechanosensitive ion channel family protein  27.04 
 
 		 309 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0517  hypothetical protein  30.3 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.328951  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0307  MscS mechanosensitive ion channel  28.7 
 
 		 435 aa  47.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.381926  normal  0.0553472 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2407  TM helix protein  20.95 
 
 		 565 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1729  MscS Mechanosensitive ion channel  26.63 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.356127  hitchhiker  0.00130809 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2465  hypothetical protein  26.85 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1308  hypothetical protein  22.33 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  35 
 
 		 435 aa  47  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2316  mechanosensitive ion channel family protein  28.89 
 
 		 773 aa  47  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1699  MscS mechanosensitive ion channel  27.88 
 
 		 456 aa  46.6  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.254155  normal  0.22429 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5911  TM helix repeat-containing protein  25.2 
 
 		 279 aa  46.2  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  27.93 
 
 		 261 aa  46.2  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2451  hypothetical protein  32.65 
 
 		 447 aa  45.8  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1298  MscS Mechanosensitive ion channel  25.84 
 
 		 262 aa  45.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.861763  normal  0.526246 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  32.19 
 
 		 321 aa  45.8  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0015  MscS mechanosensitive ion channel  31.03 
 
 		 287 aa  45.8  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  34.02 
 
 		 637 aa  45.4  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4090  MscS mechanosensitive ion channel  25.86 
 
 		 349 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00500  MscS Mechanosensitive ion channel  24.68 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3509  MscS mechanosensitive ion channel  24.39 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.126996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0443  MscS mechanosensitive ion channel  24.39 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0334  TM helix repeat-containing protein  25.35 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.172175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  30.34 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01752  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  27.95 
 
 		 328 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>