208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1424 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  281  2.0000000000000002e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  76.26 
 
 
139 aa  222  1e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  71.94 
 
 
142 aa  221  2e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  40 
 
 
164 aa  101  3e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  39.13 
 
 
153 aa  100  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  44.53 
 
 
294 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  40.32 
 
 
135 aa  98.6  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0910  protein of unknown function UPF0066  42.62 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000186983  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2206  hypothetical protein  38.62 
 
 
157 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.953877  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4671  hypothetical protein  39.23 
 
 
131 aa  94.4  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  38.35 
 
 
160 aa  94  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3119  hypothetical protein  37.93 
 
 
157 aa  94  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.322422  hitchhiker  0.0000104071 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  38.41 
 
 
150 aa  94  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  36.17 
 
 
167 aa  93.6  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  42.19 
 
 
161 aa  93.2  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2008  hypothetical protein  40 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.120607  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1388  hypothetical protein  39.57 
 
 
133 aa  92.4  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108578  hitchhiker  0.00000533919 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2068  hypothetical protein  39.31 
 
 
157 aa  92  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2007  hypothetical protein  40 
 
 
157 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2224  hypothetical protein  39.31 
 
 
157 aa  92  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  41.32 
 
 
265 aa  91.7  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  37.86 
 
 
163 aa  91.7  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4260  hypothetical protein  39.69 
 
 
166 aa  90.5  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905923  normal  0.100966 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2254  hypothetical protein  38.13 
 
 
159 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0608346  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1328  hypothetical protein  43.52 
 
 
180 aa  90.1  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00949818  decreased coverage  0.00397758 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2336  hypothetical protein  38.46 
 
 
157 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.23741  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  42.42 
 
 
145 aa  89.7  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  45.13 
 
 
143 aa  89  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2049  hypothetical protein  35.92 
 
 
157 aa  89  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141829  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  45.13 
 
 
143 aa  89  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  35.46 
 
 
183 aa  88.2  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  41.01 
 
 
147 aa  88.2  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1275  hypothetical protein  40.5 
 
 
160 aa  87.4  6e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.147453 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  40.32 
 
 
147 aa  86.3  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  46.39 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2252  hypothetical protein  43.93 
 
 
157 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.89628e-27 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  38.46 
 
 
240 aa  85.1  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  45.54 
 
 
162 aa  84.3  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1630  hypothetical protein  32.41 
 
 
157 aa  84.3  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00729863  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  37.69 
 
 
235 aa  84  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  40.83 
 
 
272 aa  83.6  9e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  40.44 
 
 
237 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  39.69 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  38.46 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  35.04 
 
 
271 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1700  hypothetical protein  38.84 
 
 
160 aa  82.8  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.03303 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  37.69 
 
 
239 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0545  protein of unknown function UPF0066  33.33 
 
 
154 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  37.5 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  37.98 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  46.53 
 
 
155 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  37.69 
 
 
231 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1466  hypothetical protein  46.15 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00269022  normal  0.108849 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  41.67 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  38.03 
 
 
241 aa  81.3  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  41.44 
 
 
151 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  31.91 
 
 
181 aa  80.9  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1550  protein of unknown function UPF0066  32.62 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  37.69 
 
 
230 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  34.65 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  33.57 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  41.67 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  37.98 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  37.69 
 
 
231 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  41.05 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  43.09 
 
 
138 aa  79  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0563  hypothetical protein  45.83 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0507088  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1722  hypothetical protein  38.02 
 
 
160 aa  78.2  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.579056 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  35.16 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  39.02 
 
 
175 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  35.61 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0426  hypothetical protein  37.19 
 
 
162 aa  77  0.00000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.088537  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2812  hypothetical protein  39.1 
 
 
251 aa  77  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  37.21 
 
 
230 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  37.21 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  32.61 
 
 
167 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0423  hypothetical protein  42.27 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.237616  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0464  hypothetical protein  43.81 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  46.67 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0993  hypothetical protein  38.21 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  35.56 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1048  protein of unknown function UPF0066  38.21 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177831  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1839  protein of unknown function UPF0066  34.62 
 
 
129 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000981628  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  36.59 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  45.56 
 
 
196 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3047  hypothetical protein  38.1 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0402  hypothetical protein  40.91 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  42 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  44.44 
 
 
182 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2266  protein of unknown function UPF0066  38.3 
 
 
167 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.864742  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  34.78 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  38.84 
 
 
165 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3087  hypothetical protein  34.55 
 
 
160 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2841  hypothetical protein  43.16 
 
 
248 aa  73.6  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  41 
 
 
162 aa  73.6  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0217  class II aldolase/adducin family protein  35.25 
 
 
323 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311562  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2542  hypothetical protein  39.82 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00464055  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1277  hypothetical protein  45.16 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.241962  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  41.12 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3346  hypothetical protein  43.4 
 
 
238 aa  72  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00404428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>