50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04558 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04558  xylanase  100 
 
 		 406 aa  827    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.992142  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2134  Glucuronoarabinoxylan endo-1,4-beta-xylanase  58.15 
 
 		 413 aa  493  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.300272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  42.38 
 
 		 681 aa  295  7e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  39.09 
 
 		 630 aa  294  2e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  38.15 
 
 		 1217 aa  280  3e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  39.8 
 
 		 629 aa  280  3e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  31.4 
 
 		 532 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  27.22 
 
 		 688 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  27.35 
 
 		 726 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  26.64 
 
 		 648 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  27.95 
 
 		 603 aa  97.1  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2067  glycoside hydrolase family protein  26.6 
 
 		 480 aa  95.9  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0826948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6736  glycoside hydrolase family 30  25.94 
 
 		 485 aa  94  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.338177 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1566  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  24.24 
 
 		 474 aa  87.4  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1106  glycoside hydrolase family protein  27.84 
 
 		 488 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0729101  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1563  glycoside hydrolase family protein  23.76 
 
 		 487 aa  84.3  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361336  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  28.07 
 
 		 627 aa  83.6  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1287  glucosylceramidase  27.04 
 
 		 476 aa  82.4  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0097  Glucosylceramidase  22.8 
 
 		 446 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2261  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  26.53 
 
 		 514 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103038  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  25.06 
 
 		 695 aa  81.3  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6735  glycoside hydrolase family 30  23.84 
 
 		 485 aa  80.1  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0296  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  24.52 
 
 		 484 aa  79.3  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4153  glucosylceramidase  24.11 
 
 		 472 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450582  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3362  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  26.98 
 
 		 497 aa  77.4  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  28.06 
 
 		 647 aa  77.4  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04190  glycoside hydrolase family 30  23.57 
 
 		 445 aa  77  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  25.16 
 
 		 603 aa  76.3  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0858  glycoside hydrolase family protein  21.23 
 
 		 445 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5601  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  24.56 
 
 		 505 aa  73.2  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1268  glucosylceramidase  24.1 
 
 		 475 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1562  glycoside hydrolase family protein  26.07 
 
 		 487 aa  72  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2994  glucosylceramidase  28.63 
 
 		 481 aa  72  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389806  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3590  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  22.46 
 
 		 486 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00155681  hitchhiker  0.000521994 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0445  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  21.72 
 
 		 501 aa  68.9  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3714  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  42.5 
 
 		 666 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4557  O-Glycosyl hydrolase-like protein  24.15 
 
 		 494 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00623956  normal  0.0160771 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2880  hypothetical protein  32.95 
 
 		 537 aa  61.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  38.1 
 
 		 982 aa  60.1  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  27.75 
 
 		 634 aa  59.7  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1516  glycoside hydrolase family 30  26.22 
 
 		 481 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5017  glycoside hydrolase family 30  24.38 
 
 		 484 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000784671  normal  0.283576 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1960  hypothetical protein  23.46 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.148725  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4708  O-Glycosyl hydrolase family 30  26.7 
 
 		 447 aa  56.2  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.319201  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3404  glycoside hydrolase family protein  20.1 
 
 		 441 aa  56.2  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.316905  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1833  O-glycosyl hydrolase  24.82 
 
 		 445 aa  54.3  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3872  hypothetical protein  24.6 
 
 		 538 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.875392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34530  O-glycosyl hydrolase  23.32 
 
 		 447 aa  51.6  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0928159  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1486  glycoside hydrolase family 30  23.23 
 
 		 544 aa  50.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  22.79 
 
 		 982 aa  47.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>