More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00636 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  100 
 
 
325 aa  647    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  91.08 
 
 
387 aa  593  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  77.85 
 
 
390 aa  514  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  76.62 
 
 
388 aa  507  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  61.54 
 
 
389 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  46.53 
 
 
369 aa  257  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  45.21 
 
 
369 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  45.55 
 
 
405 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  43.05 
 
 
360 aa  218  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  52.76 
 
 
345 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  34.97 
 
 
370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  36.13 
 
 
367 aa  178  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  33.55 
 
 
363 aa  177  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  39.3 
 
 
326 aa  166  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  32.48 
 
 
355 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  35.83 
 
 
391 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  40.33 
 
 
327 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  38.54 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  41.61 
 
 
329 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  41.61 
 
 
329 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  40.22 
 
 
348 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  38.5 
 
 
239 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  35.53 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  33.61 
 
 
401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  34.8 
 
 
366 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  39.36 
 
 
336 aa  140  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  35.44 
 
 
324 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  36.76 
 
 
323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  36.76 
 
 
323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  38.89 
 
 
327 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  38.89 
 
 
327 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  37.96 
 
 
332 aa  139  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  33.01 
 
 
327 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  38.92 
 
 
328 aa  138  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  33.75 
 
 
352 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  36.89 
 
 
328 aa  136  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  39.51 
 
 
308 aa  135  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  36.45 
 
 
320 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  36.57 
 
 
322 aa  132  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  36.04 
 
 
328 aa  132  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  38.73 
 
 
326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  38.65 
 
 
321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  35.23 
 
 
332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  37.44 
 
 
336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  35.23 
 
 
332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  39.68 
 
 
336 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  33.17 
 
 
338 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  39.77 
 
 
336 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  31.28 
 
 
328 aa  129  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  37.56 
 
 
335 aa  129  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  35.18 
 
 
332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  33.66 
 
 
335 aa  127  3e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  34.12 
 
 
322 aa  127  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  35.43 
 
 
335 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  37.06 
 
 
325 aa  126  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  39.89 
 
 
330 aa  126  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  34.29 
 
 
335 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  36.22 
 
 
336 aa  125  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  35.88 
 
 
328 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  31.45 
 
 
388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  38.32 
 
 
468 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  38.6 
 
 
459 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  40.37 
 
 
425 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  37.95 
 
 
451 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  37.72 
 
 
477 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  39.73 
 
 
426 aa  116  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  42.47 
 
 
419 aa  112  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  40 
 
 
428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  40 
 
 
493 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  36.75 
 
 
419 aa  109  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  33.73 
 
 
430 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  43.98 
 
 
613 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4143  ATPase central domain-containing protein  36.36 
 
 
243 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802818  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  44.59 
 
 
639 aa  103  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  39.74 
 
 
425 aa  102  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0925  ATPase central domain-containing protein  32.62 
 
 
371 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1021  ATPase central domain-containing protein  32.09 
 
 
371 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  37.59 
 
 
424 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.86 
 
 
662 aa  100  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  40.41 
 
 
814 aa  100  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1197  ATPase central domain-containing protein  32.26 
 
 
371 aa  100  4e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.862014  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  35.68 
 
 
427 aa  99.4  7e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  39.73 
 
 
829 aa  99.4  8e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  39.73 
 
 
806 aa  99  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  40.96 
 
 
601 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1660  ATPase central domain-containing protein  32.09 
 
 
371 aa  97.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  39.73 
 
 
810 aa  97.4  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  32.49 
 
 
464 aa  97.4  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38 
 
 
625 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.47 
 
 
685 aa  96.7  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  38.36 
 
 
804 aa  96.3  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05588  intermembrane space AAA protease IAP-1 (AFU_orthologue; AFUA_4G11530)  31.58 
 
 
784 aa  95.9  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.24 
 
 
718 aa  95.9  9e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4836  Microtubule-severing ATPase  37.37 
 
 
641 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  33.99 
 
 
607 aa  94.7  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1314  FtsH-2 peptidase  32.62 
 
 
623 aa  94.4  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997053  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.67 
 
 
737 aa  94.4  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.05 
 
 
735 aa  94.4  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.74 
 
 
644 aa  94.4  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0456572 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.67 
 
 
737 aa  94.4  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>