More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4434 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4434  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 427 aa  890    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51650  putative integrase  96.96 
 
 		 426 aa  833    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000506916  hitchhiker  0.0000630791 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60140  xerD-like putative integrase  97.29 
 
 		 306 aa  529  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000287702  hitchhiker  0.00000000219898 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4530  phage integrase family site specific recombinase  60.5 
 
 		 449 aa  528  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36590  phage integrase  60.42 
 
 		 415 aa  495  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.706618  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1421  Phage integrase  57.1 
 
 		 468 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.602834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4797  phage integrase  40.26 
 
 		 308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3686  putative phage integrase  36.36 
 
 		 322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0710  integrase family protein  36.13 
 
 		 324 aa  196  6e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4048  integrase family protein  35.74 
 
 		 343 aa  189  7e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.900099 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3356  phage integrase family protein  35.28 
 
 		 352 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4117  integrase family protein  33.45 
 
 		 337 aa  170  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.944065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0401  integrase family protein  33.78 
 
 		 337 aa  169  7e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.663201  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0001  integrase  30.27 
 
 		 265 aa  151  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0743  phage integrase family site specific recombinase  39.56 
 
 		 102 aa  82  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0626  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.36 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  25.1 
 
 		 297 aa  72.8  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1698  integrase family protein  24.91 
 
 		 314 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  27.33 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4150  integrase family protein  27.78 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04122  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.54 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0393  tyrosine recombinase XerC  25.93 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0380  tyrosine recombinase XerC  26.71 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0010  tyrosine recombinase XerC  22.43 
 
 		 299 aa  62  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  32.24 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4306  integrase/recombinase XerC  26.09 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0098  integrase family protein  23.02 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0142  integrase family protein  22.54 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2794  integrase family protein  22.35 
 
 		 304 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.160655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0967  phage integrase family protein  26.13 
 
 		 324 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  29.56 
 
 		 302 aa  59.3  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  26.63 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  27.27 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  29.22 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0318  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.59 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0394  tyrosine recombinase XerC  25.16 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3631  tyrosine recombinase XerC  25.16 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0393  tyrosine recombinase XerC  25.16 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3247  integrase/recombinase XerC  23.48 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  26.42 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3971  tyrosine recombinase XerC  26.42 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  27.59 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3894  tyrosine recombinase XerC  26.42 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533729 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0234  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.09 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69710  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.67 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.737312  normal  0.478185 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  26.42 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3993  tyrosine recombinase XerC  26.42 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4087  tyrosine recombinase XerC  26.42 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0169707 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1220  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.57 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6131  integrase family protein  29.45 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0370  phage integrase family protein  23.95 
 
 		 304 aa  57  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3398  integrase  22.22 
 
 		 293 aa  57  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.292469  normal  0.438437 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0184  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.44 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.72736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1297  phage integrase family protein  21.12 
 
 		 295 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  27.33 
 
 		 332 aa  56.2  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3928  integrase family protein  24.6 
 
 		 290 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  27.65 
 
 		 332 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4524  Phage integrase  30.54 
 
 		 310 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1201  phage integrase  28.21 
 
 		 301 aa  55.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0529826  normal  0.150621 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0738  integrase/recombinase  24.16 
 
 		 340 aa  56.2  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0325  tyrosine recombinase XerC  28.12 
 
 		 297 aa  55.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  21.12 
 
 		 301 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0574  integrase family protein  20.46 
 
 		 295 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  21.78 
 
 		 299 aa  55.5  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2241  integrase family protein  27.01 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.640527  hitchhiker  0.000757999 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4277  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.61 
 
 		 300 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  24.39 
 
 		 298 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  24.1 
 
 		 309 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3973  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.16 
 
 		 311 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.556004  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4336  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.61 
 
 		 300 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1179  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.74 
 
 		 450 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000142279  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0447  tyrosine recombinase XerC  25.62 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.36 
 
 		 298 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  25.47 
 
 		 299 aa  55.5  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  25.61 
 
 		 328 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4229  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.61 
 
 		 300 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.61 
 
 		 300 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.225708  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4159  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.61 
 
 		 300 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.937296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3108  integrase family protein  23.02 
 
 		 292 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512092  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0143  integrase IntI1 for transposon Tn21  26.4 
 
 		 337 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1915  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.42 
 
 		 345 aa  54.7  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  hitchhiker  0.00138491 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4009  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.27 
 
 		 303 aa  54.7  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  22.03 
 
 		 338 aa  54.7  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0120  integrase/recombinase  26.4 
 
 		 337 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.400978 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  23.66 
 
 		 300 aa  54.7  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1196  tyrosine recombinase XerD  26.79 
 
 		 309 aa  54.7  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0670859  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.27 
 
 		 303 aa  54.7  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.279091  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0067  integrase/recombinase  26.4 
 
 		 337 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.325485 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1366  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.74 
 
 		 450 aa  54.7  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000415693  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  26.14 
 
 		 295 aa  55.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0359  tyrosine recombinase XerD  27.67 
 
 		 290 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00723526 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0507  tyrosine recombinase XerD  24.54 
 
 		 339 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0543  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.27 
 
 		 303 aa  54.7  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0238  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.17 
 
 		 306 aa  54.7  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0625179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  26.75 
 
 		 310 aa  54.3  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  25.45 
 
 		 303 aa  54.3  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  25.1 
 
 		 301 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  25.93 
 
 		 304 aa  54.3  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2841  phage integrase family site specific recombinase  22.55 
 
 		 292 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.424466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.78 
 
 		 298 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>