201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4312 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4312  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 199 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50610  short chain dehydrogenase  92.46 
 
 		 223 aa  377  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0391945 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1238  short chain dehydrogenase  69.7 
 
 		 199 aa  296  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0313  short chain dehydrogenase  61.62 
 
 		 199 aa  259  2e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0297  short chain dehydrogenase  61.62 
 
 		 199 aa  259  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0613  short chain dehydrogenase  61.93 
 
 		 201 aa  259  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0886445 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4284  short chain dehydrogenase  61.42 
 
 		 201 aa  257  7e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.206363 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4448  short chain dehydrogenase  61.93 
 
 		 201 aa  256  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3138  short chain dehydrogenase  57.07 
 
 		 200 aa  238  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0927  short chain dehydrogenase  53 
 
 		 200 aa  226  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.115438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1664  short chain dehydrogenase  54.04 
 
 		 199 aa  224  8e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3331  short chain dehydrogenase  57 
 
 		 201 aa  222  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3200  short chain dehydrogenase  54.27 
 
 		 217 aa  220  9e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5629  short chain dehydrogenase  55.28 
 
 		 198 aa  215  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0657  short chain dehydrogenase  49.75 
 
 		 202 aa  214  7e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.769936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3526  short chain dehydrogenase  54.65 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0150103 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4883  short chain dehydrogenase  48 
 
 		 202 aa  195  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5475  short chain dehydrogenase  48 
 
 		 202 aa  193  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5387  short chain dehydrogenase  48 
 
 		 202 aa  193  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.255767 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05280  short chain dehydrogenase  44.44 
 
 		 200 aa  191  5e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2493  short chain dehydrogenase  50.26 
 
 		 200 aa  191  9e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1726  short chain dehydrogenase  49.74 
 
 		 200 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3793  short chain dehydrogenase  44.95 
 
 		 207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06295  short chain dehydrogenase  42.71 
 
 		 200 aa  180  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3670  short chain dehydrogenase  45.45 
 
 		 208 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2512  short chain dehydrogenase  44.95 
 
 		 199 aa  174  9e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.296656  normal  0.253878 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0789  short chain dehydrogenase  43 
 
 		 205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3613  short chain dehydrogenase  44.28 
 
 		 199 aa  168  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl362  short chain dehydrogenase  40.1 
 
 		 202 aa  160  9e-39  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.68833e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2619  short chain dehydrogenase  43.3 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1873  short chain dehydrogenase  43.3 
 
 		 201 aa  158  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2520  short chain dehydrogenase  39.09 
 
 		 199 aa  156  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0216463  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1736  short chain dehydrogenase  43.3 
 
 		 201 aa  154  8e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.157452 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1778  short chain dehydrogenase  43.65 
 
 		 202 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4306  short chain dehydrogenase  35.35 
 
 		 197 aa  135  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6188  short chain dehydrogenase  38.07 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0802  short chain dehydrogenase  28.49 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2324  short chain dehydrogenase  31.21 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2087  short chain dehydrogenase  30.06 
 
 		 245 aa  64.7  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.319948  normal  0.613238 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06495  oxidoreductase  28.5 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0985  short chain dehydrogenase  34.4 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1467  short chain dehydrogenase  34.4 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1445  short chain dehydrogenase  34.4 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1392  short chain dehydrogenase  28.98 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1352  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297804  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0938  Short-chain alcohol dehydrogenase  29.07 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746042  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2913  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.46 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5398  short chain dehydrogenase  28.26 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal  0.960589 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1106  short chain dehydrogenase  30.65 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.256004  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1880  short chain dehydrogenase  30.65 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386097  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1548  short chain dehydrogenase  30.65 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0211  short chain dehydrogenase  30.65 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0327074  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1701  short chain dehydrogenase  30.65 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.553815  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1727  short chain dehydrogenase  30.65 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0953  short chain dehydrogenase  30.65 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2606  short chain dehydrogenase  30.65 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.99 
 
 		 274 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3870  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.59 
 
 		 259 aa  54.7  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.45 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72840  putative short-chain dehydrogenase  28.02 
 
 		 252 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28 
 
 		 262 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.45 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6322  putative short-chain dehydrogenase  28.02 
 
 		 252 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2086  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.93 
 
 		 245 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00879174  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.67 
 
 		 256 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.165575  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.67 
 
 		 256 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  28.26 
 
 		 286 aa  53.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.67 
 
 		 256 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 		 246 aa  52.4  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4285  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.83 
 
 		 249 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.08 
 
 		 250 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.839106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2225  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.82 
 
 		 267 aa  52  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.94 
 
 		 284 aa  52  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.361211  hitchhiker  0.00000740353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.22 
 
 		 250 aa  51.2  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3511  short chain dehydrogenase  26.36 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4230  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.22 
 
 		 248 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36870  putative short-chain dehydrogenase  29.71 
 
 		 286 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3873  C factor cell-cell signaling protein  21.68 
 
 		 235 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2783  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.67 
 
 		 245 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0466  C factor cell-cell signaling protein  20.8 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.01 
 
 		 241 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.15 
 
 		 286 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2972  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.67 
 
 		 245 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.19 
 
 		 256 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.13 
 
 		 286 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.86 
 
 		 258 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal  0.023925 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0457  C factor cell-cell signaling protein  20.35 
 
 		 235 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2779  short chain dehydrogenase  23.56 
 
 		 238 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000967722 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1592  short chain dehydrogenase  26.19 
 
 		 236 aa  48.5  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.512946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 		 251 aa  48.1  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.694744  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.39 
 
 		 238 aa  48.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290784  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.33 
 
 		 271 aa  48.1  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0847  short chain dehydrogenase/reductase family protein  23.48 
 
 		 234 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.87 
 
 		 258 aa  47.4  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.465274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.22 
 
 		 267 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10628  short chain dehydrogenase  22.62 
 
 		 239 aa  47.4  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.10817  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6170  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.97 
 
 		 268 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.343653 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>