94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4634 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4634  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  643    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  97.35 
 
 		 302 aa  600  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  90.4 
 
 		 300 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  86.05 
 
 		 302 aa  531  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  66.32 
 
 		 317 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  55.78 
 
 		 336 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  56.67 
 
 		 473 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  55.78 
 
 		 417 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  55.45 
 
 		 336 aa  335  7e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  55.45 
 
 		 336 aa  335  7e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  55.45 
 
 		 336 aa  335  7e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  55.45 
 
 		 336 aa  335  7e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2192  alpha/beta hydrolase  55.45 
 
 		 346 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5902  alpha/beta hydrolase  55.12 
 
 		 346 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169357  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2175  alpha/beta hydrolase  55.12 
 
 		 346 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306533  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5485  Alpha/beta hydrolase  55.45 
 
 		 346 aa  319  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2214  alpha/beta hydrolase  55.41 
 
 		 357 aa  316  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2091  alpha/beta hydrolase  55.59 
 
 		 352 aa  315  6e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1095  alpha/beta hydrolase fold  55.1 
 
 		 348 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1918  alpha/beta hydrolase  53.8 
 
 		 325 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1457  alpha/beta hydrolase  52.33 
 
 		 303 aa  296  4e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0569  alpha/beta hydrolase  54 
 
 		 325 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1984  alpha/beta hydrolase  49.82 
 
 		 327 aa  255  8e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  48.94 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21420  predicted alpha/beta hydrolase  41.84 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0815  putative hydrolase  42.58 
 
 		 298 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  39.79 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0596  putative hydrolase  40 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  39.44 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  39.86 
 
 		 305 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3931  alpha/beta hydrolase-like  39.16 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269531  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4435  alpha/beta hydrolase-like protein  39.16 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1341  putative hydrolase  38.43 
 
 		 300 aa  162  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40820  putative hydrolase  35.51 
 
 		 291 aa  162  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3462  putative hydrolase  36.99 
 
 		 291 aa  162  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1527  alpha/beta hydrolase-like  38.03 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2079  hypothetical protein  37.2 
 
 		 301 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0575  putative hydrolase  40.38 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4709  alpha/beta hydrolase-like protein  37.68 
 
 		 295 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0396894  decreased coverage  0.00396778 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3632  alpha/beta hydrolase-like protein  37.68 
 
 		 295 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01912  hypothetical protein  33.69 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0438  hypothetical protein  36.36 
 
 		 312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  33.77 
 
 		 462 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1265  hypothetical protein  35.55 
 
 		 293 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00885366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  35.55 
 
 		 293 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0605  hypothetical protein  35.55 
 
 		 293 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3029  hypothetical protein  35.55 
 
 		 295 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0548  hypothetical protein  35.55 
 
 		 293 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1460  alpha/beta fold family hydrolase  35.55 
 
 		 293 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48210  putative hydrolase  34.23 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000506825  normal  0.0564296 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2795  hypothetical protein  34.77 
 
 		 293 aa  126  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0611315  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4058  alpha/beta hydrolase-like protein  32.73 
 
 		 292 aa  126  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1273  hypothetical protein  32.07 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0496483  hitchhiker  0.00827301 
 
 
-
 
NC_004310  BR0288  hypothetical protein  33.79 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0808  hypothetical protein  28.97 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0301  hypothetical protein  33.79 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1464  hypothetical protein  28.74 
 
 		 328 aa  116  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0686  hypothetical protein  30.31 
 
 		 286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0130174 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0427  alpha/beta hydrolase fold  32.22 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3610  Alpha/beta hydrolase  30.28 
 
 		 289 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2873  alpha/beta hydrolase  30.8 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.723814  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2212  hypothetical protein  26.34 
 
 		 297 aa  109  6e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.140894 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1897  alpha/beta hydrolase-like protein  26.24 
 
 		 321 aa  105  9e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.249943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1964  hypothetical protein  30.45 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0677628  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00524  alpha/beta hydrolase-like protein  27 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 334 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0520  hypothetical protein  27.82 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1450  alpha/beta hydrolase  53.06 
 
 		 104 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0797  putative hydrolase  29.89 
 
 		 330 aa  90.1  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 317 aa  86.3  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47510  putative hydrolase  32.3 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1678  hypothetical protein  31.15 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  31.19 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3343  alpha/beta hydrolase-like protein  30.04 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2996  alpha/beta hydrolase-like protein  29.39 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1672  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324929  normal  0.537045 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2606  alpha/beta hydrolase  30 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3544  alpha/beta hydrolase fold  30.97 
 
 		 317 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1504  hypothetical protein  26.12 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0349086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  32.58 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2931  hypothetical protein  30.91 
 
 		 316 aa  47  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2086  hypothetical protein  25.27 
 
 		 329 aa  47  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.671906  normal  0.0731474 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09450  hypothetical protein  29.91 
 
 		 348 aa  47  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.513646  normal  0.860642 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3535  esterase/lipase  27.47 
 
 		 336 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2622  alpha/beta hydrolase fold  34.82 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal  0.924395 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0878  hypothetical protein  26.35 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000343609  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41650  putative esterase  27.11 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  29.65 
 
 		 302 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  31.34 
 
 		 290 aa  43.5  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1601  alpha/beta fold family hydrolase  23.7 
 
 		 342 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925882  hitchhiker  0.00000000109421 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2528  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 		 327 aa  42.7  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1948  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 473 aa  42.7  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  34.26 
 
 		 311 aa  42.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2622  hypothetical protein  32 
 
 		 312 aa  42.4  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>