More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0817 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_08721  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  85 
 
 
440 aa  772    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07721  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  78.86 
 
 
439 aa  721    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.725202  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0817  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  100 
 
 
440 aa  891    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.47807  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08691  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  86.59 
 
 
440 aa  767    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09481  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  55.53 
 
 
448 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.056748  hitchhiker  0.0000260646 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0218  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  54.7 
 
 
444 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.163513  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08501  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  54.46 
 
 
444 aa  472  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185666 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14381  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  47.5 
 
 
436 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1557  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.95 
 
 
450 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0276963  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1530  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.95 
 
 
450 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  20.36 
 
 
492 aa  83.6  0.000000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0630  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  25.66 
 
 
330 aa  82  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  24.81 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1535  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.48 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0547  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.05 
 
 
324 aa  79.7  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000394367  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  21.64 
 
 
327 aa  79  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.09 
 
 
338 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  25.24 
 
 
334 aa  77.8  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25 
 
 
450 aa  76.6  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2904  vanillate O-demethylase, oxygenase subunit  22.39 
 
 
354 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3567  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.04 
 
 
344 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  25.08 
 
 
315 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  22.26 
 
 
353 aa  75.9  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2708  Rieske [2Fe-2S] region  22.31 
 
 
354 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104354  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35581  predicted protein  27.12 
 
 
386 aa  75.5  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000902697  normal  0.474336 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.13 
 
 
358 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64800  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  21.62 
 
 
351 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0565633  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1908  Rieske (2Fe-2S) protein  22.03 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.127579  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2184  vanillate O-demethylase oxygenase, iron-sulfur subunit  21.74 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1303  Rieske (2Fe-2S) region  21.75 
 
 
443 aa  74.3  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.418357  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2958  pheophorbide a oxygenase  22.32 
 
 
442 aa  74.3  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0467803  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5946  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.23 
 
 
341 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.930147 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0963  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  24.56 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  25.1 
 
 
366 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1649  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.17 
 
 
370 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1676  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.17 
 
 
349 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.945696  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  21.04 
 
 
359 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5124  vanillate monooxygenase  21.34 
 
 
359 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14115  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5628  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  20.78 
 
 
351 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  20.96 
 
 
342 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  21.56 
 
 
347 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2688  Rieske (2Fe-2S) protein  25.93 
 
 
352 aa  71.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3396  vanillate monooxygenase  23.15 
 
 
348 aa  71.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00111775  normal  0.0140003 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4139  Vanillate monooxygenase  22.3 
 
 
347 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105569  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  20.73 
 
 
359 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3124  Rieske (2Fe-2S) region  20.73 
 
 
359 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439622  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3793  pheophorbide a oxygenase  20.44 
 
 
443 aa  71.2  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.726  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  22.73 
 
 
354 aa  69.7  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3264  vanillate monooxygenase  24.37 
 
 
350 aa  69.3  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112363 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2979  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.75 
 
 
367 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4591  vanillate monooxygenase  20.73 
 
 
373 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  21.92 
 
 
380 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3409  vanillate monooxygenase  26.26 
 
 
347 aa  68.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1103  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.42 
 
 
362 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5678  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.11 
 
 
408 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000120872  normal  0.0293014 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5901  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.11 
 
 
408 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00683325  hitchhiker  0.00740172 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  23.73 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  21.32 
 
 
355 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0535  Rieske (2Fe-2S) region  20 
 
 
460 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  23.16 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1543  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.4 
 
 
519 aa  67.4  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.453445  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1549  vanillate monooxygenase  23.89 
 
 
359 aa  67.4  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0130812 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3116  Pheophorbide a oxygenase  19.07 
 
 
442 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1867  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26.92 
 
 
388 aa  67  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.687816 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6021  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.63 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174244  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2359  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.16 
 
 
410 aa  67  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.128163  normal  0.731078 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5949  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.81 
 
 
342 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.193657 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1130  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.84 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0812255  normal  0.937672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.83 
 
 
332 aa  66.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  21.76 
 
 
353 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5548  putative Phthalate 4,5-dioxygenase subunit alpha  21.46 
 
 
439 aa  66.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0844  Rieske (2Fe-2S) region  23.61 
 
 
349 aa  66.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  21.84 
 
 
364 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  22.43 
 
 
367 aa  65.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.05 
 
 
352 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.05 
 
 
352 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3784  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.39 
 
 
342 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3532  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.32 
 
 
446 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048657  normal  0.0515471 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4244  Rieske (2Fe-2S) domain protein  22.29 
 
 
352 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0481  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  23.16 
 
 
353 aa  65.1  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0971818  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  23.05 
 
 
352 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.78 
 
 
349 aa  65.1  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.725754  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6309  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.6 
 
 
341 aa  64.7  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1485  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  22.34 
 
 
343 aa  65.1  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5800  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  22.66 
 
 
354 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198597 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.84 
 
 
372 aa  64.3  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3736  Rieske (2Fe-2S) domain protein  22.49 
 
 
355 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554225  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2687  Rieske (2Fe-2S) protein  22.49 
 
 
356 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2027  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  22.49 
 
 
355 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0787  Rieske (2Fe-2S) protein  22.34 
 
 
351 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0864  cell death suppressor protein Lls1-like  23.16 
 
 
438 aa  63.5  0.000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.658605  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.41 
 
 
374 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4257  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.26 
 
 
349 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1448  Rieske (2Fe-2S) protein  23.33 
 
 
359 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2918  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.99 
 
 
337 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2170  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  22.01 
 
 
355 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.461217  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  22.6 
 
 
367 aa  63.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2686  Rieske (2Fe-2S) protein  21.9 
 
 
376 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6982  phthalate 4,5-dioxygenase  21.94 
 
 
438 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4992  Rieske (2Fe-2S) region  26.79 
 
 
366 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>