292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0378 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 		 686 aa  1421    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  96.12 
 
 		 698 aa  1343    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  83.48 
 
 		 689 aa  1175    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  37.63 
 
 		 671 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  37.32 
 
 		 652 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  30.71 
 
 		 657 aa  177  7e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  28.88 
 
 		 452 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3927  DNA-cytosine methyltransferase  29.83 
 
 		 500 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  28.06 
 
 		 373 aa  159  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36050  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.35 
 
 		 501 aa  158  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2742  DNA methylase  28.57 
 
 		 492 aa  157  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.52 
 
 		 357 aa  154  7e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  28.54 
 
 		 508 aa  153  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  29.68 
 
 		 468 aa  151  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  32 
 
 		 415 aa  151  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  31.23 
 
 		 418 aa  150  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  31.23 
 
 		 418 aa  150  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  30.31 
 
 		 474 aa  146  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  29.1 
 
 		 489 aa  145  2e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  29.76 
 
 		 388 aa  145  3e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  27.82 
 
 		 424 aa  144  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.4 
 
 		 431 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  29.03 
 
 		 360 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  27.03 
 
 		 395 aa  140  8.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  28.15 
 
 		 421 aa  139  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  26.46 
 
 		 434 aa  132  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  28.25 
 
 		 440 aa  131  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  28.25 
 
 		 440 aa  131  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  29.83 
 
 		 385 aa  130  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2562  DNA-cytosine methyltransferase  28.38 
 
 		 423 aa  127  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  26.82 
 
 		 342 aa  127  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  27.73 
 
 		 389 aa  126  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.78 
 
 		 387 aa  126  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  28.43 
 
 		 431 aa  125  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  27.53 
 
 		 464 aa  125  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  25.26 
 
 		 313 aa  125  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  26.24 
 
 		 488 aa  124  9e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  25.99 
 
 		 406 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  25.95 
 
 		 371 aa  123  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2858  DNA-cytosine methyltransferase  25.43 
 
 		 502 aa  122  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.568201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.54 
 
 		 405 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  25.43 
 
 		 450 aa  121  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  25.17 
 
 		 438 aa  120  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.75 
 
 		 415 aa  120  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  25.48 
 
 		 399 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  25.91 
 
 		 361 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  25.42 
 
 		 370 aa  118  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  24.22 
 
 		 423 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  27.58 
 
 		 310 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  24.61 
 
 		 465 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  34.23 
 
 		 334 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  25.74 
 
 		 443 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  24.04 
 
 		 423 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.65 
 
 		 375 aa  114  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  27.54 
 
 		 440 aa  114  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0281  modification methylase (cytosine-specific methyltransferase  24.88 
 
 		 520 aa  114  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  27.43 
 
 		 358 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  26.94 
 
 		 361 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  25.74 
 
 		 398 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1413  DNA-cytosine methyltransferase  26.82 
 
 		 420 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.582499  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  26.78 
 
 		 375 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3077  DNA-cytosine methyltransferase  26.04 
 
 		 517 aa  112  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.485404  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  27.54 
 
 		 415 aa  111  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  26.48 
 
 		 340 aa  111  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  24.59 
 
 		 362 aa  109  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1494  DNA-cytosine methyltransferase  30.05 
 
 		 423 aa  110  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  27.03 
 
 		 390 aa  109  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  27.62 
 
 		 374 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  25.37 
 
 		 368 aa  108  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0891  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.61 
 
 		 397 aa  107  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  26.19 
 
 		 362 aa  106  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2521  modification methylase DdeI  26.7 
 
 		 518 aa  106  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  27.99 
 
 		 377 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  28.74 
 
 		 381 aa  105  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  26.9 
 
 		 434 aa  104  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  25.36 
 
 		 364 aa  103  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  30.64 
 
 		 412 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  26.72 
 
 		 365 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0429  DNA-cytosine methyltransferase  24.84 
 
 		 462 aa  102  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.584191  normal  0.0384106 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  28.06 
 
 		 323 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1018  DNA-cytosine methyltransferase  23.96 
 
 		 446 aa  101  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000487753  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  31.48 
 
 		 308 aa  101  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0160  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  24.63 
 
 		 404 aa  101  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4096  DNA-cytosine methyltransferase  24.02 
 
 		 535 aa  99.8  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  25.44 
 
 		 379 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.76 
 
 		 362 aa  99.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  27.37 
 
 		 355 aa  99  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  25.18 
 
 		 409 aa  99  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.38 
 
 		 359 aa  99  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  24.02 
 
 		 438 aa  99  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2232  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.22 
 
 		 405 aa  98.6  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.996757  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.31 
 
 		 350 aa  98.2  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000225645 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  27.22 
 
 		 365 aa  97.8  6e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0606  DNA-cytosine methyltransferase  24.18 
 
 		 355 aa  97.8  6e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  24.13 
 
 		 328 aa  97.8  6e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  25.8 
 
 		 402 aa  97.8  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  26.2 
 
 		 358 aa  97.4  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2061  DNA-cytosine methyltransferase  23.53 
 
 		 511 aa  97.4  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290598 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  27.4 
 
 		 632 aa  97.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  25.89 
 
 		 358 aa  97.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>