52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_74319 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_10060  glycogen debranching enzyme Gdb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02140)  49.14 
 
 		 1537 aa  1456    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.633222 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03090  Glycogen debranching enzyme, putative  41.81 
 
 		 1593 aa  1199    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74319  glycogen debranching enzyme  100 
 
 		 1526 aa  3167    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1820  glycogen debranching enzyme  25.54 
 
 		 655 aa  110  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3653  glycogen debranching enzyme-related protein (4-alpha-glucanotransferase)  24.89 
 
 		 659 aa  109  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.507852  normal  0.0295807 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7095  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.38 
 
 		 662 aa  109  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0213  putative glycogen debranching protein  26.03 
 
 		 660 aa  108  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08610  glycogen debranching enzyme, putative  24.57 
 
 		 661 aa  107  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0115  glycogen debranching enzyme, putative  24.24 
 
 		 659 aa  106  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2402  glycogen debranching enzyme  26.5 
 
 		 641 aa  106  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2645  putative glycogen debranching enzyme, type  24.95 
 
 		 672 aa  106  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2288  glycogen debranching enzyme  25.33 
 
 		 663 aa  105  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3810  glycogen debranching enzyme  26.2 
 
 		 661 aa  100  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.38466 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0439  glycogen debranching protein  24.61 
 
 		 660 aa  98.2  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2540  glycogen debranching enzyme  24.68 
 
 		 678 aa  97.1  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000573314 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1369  glycogen debranching enzyme  24.6 
 
 		 659 aa  96.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3944  glycogen debranching enzyme  26.11 
 
 		 663 aa  96.7  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00146651  normal  0.690389 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0298  glycogen debranching enzyme, putative  26.67 
 
 		 668 aa  96.7  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4305  glycogen debranching enzyme  25.44 
 
 		 674 aa  95.5  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.398353  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3665  glycogen debranching enzyme  23.25 
 
 		 675 aa  95.5  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115982  normal  0.315429 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2331  glycogen debranching protein  24.3 
 
 		 672 aa  94  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2025  glycogen debranching protein  24.87 
 
 		 686 aa  93.2  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.242432  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1826  glycogen debranching protein  25.8 
 
 		 672 aa  91.3  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0277805  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3413  glycogen debranching enzyme  24.1 
 
 		 657 aa  89.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2589  glycogen debranching enzyme, putative  24.23 
 
 		 712 aa  89.4  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2703  glycogen debranching enzyme  24.1 
 
 		 657 aa  89.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4614  glycogen debranching enzyme  24.74 
 
 		 687 aa  89.4  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0143177  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1681  glycogen debranching enzyme  23.59 
 
 		 678 aa  87.4  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1265  glycogen debranching enzyme, putative  23.6 
 
 		 657 aa  87  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2343  glycogen debranching enzyme  23.19 
 
 		 651 aa  84.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5206  glycogen debranching enzyme  23.63 
 
 		 662 aa  84.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110165 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1575  glycogen debranching protein  23.4 
 
 		 681 aa  81.6  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.866543 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0471  glycogen debranching enzyme  23.04 
 
 		 720 aa  81.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0780556  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3231  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.75 
 
 		 659 aa  79.7  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1421  glycogen debranching enzyme, putative  23.52 
 
 		 611 aa  79.3  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.569288  normal  0.0701501 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1969  glycogen debranching enzyme  25.47 
 
 		 614 aa  72.8  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2522  glycogen debranching enzyme  25 
 
 		 652 aa  72  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0950686  normal  0.047351 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3715  glycogen debranching enzyme  20.68 
 
 		 692 aa  68.6  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3772  glycogen debranching enzyme  22.04 
 
 		 693 aa  67.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3855  glycogen debranching enzyme  22.04 
 
 		 693 aa  67.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196981  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  43.06 
 
 		 610 aa  64.7  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2939  alpha amylase catalytic region  32.76 
 
 		 1124 aa  63.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998182 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2834  alpha amylase catalytic region  32.76 
 
 		 1124 aa  62.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2712  alpha amylase catalytic region  31.9 
 
 		 1124 aa  62  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.576573  normal  0.0633095 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.9 
 
 		 1433 aa  55.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6808  alpha amylase catalytic region  30.17 
 
 		 1122 aa  55.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0740602  normal  0.515818 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1599  alpha amylase catalytic region  32.99 
 
 		 1126 aa  55.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.863275  hitchhiker  0.00182412 
 
 
-
 
NC_002950  PG1681  glycogen debranching protein  25.74 
 
 		 658 aa  53.9  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.304262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7547  alpha amylase catalytic region  29.31 
 
 		 1122 aa  53.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250555  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2605  alpha amylase family protein  26.67 
 
 		 420 aa  52.4  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242593  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1954  alpha amylase, catalytic region  33.64 
 
 		 433 aa  47.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0985292  normal  0.0257857 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0888  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.07 
 
 		 656 aa  47  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.376161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>