146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_25920 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009048  PICST_25920  predicted protein  100 
 
 
424 aa  839    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0604247  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34965  predicted protein  33.67 
 
 
194 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.89638 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06030  protein-nucleus import-related protein, putative  31.01 
 
 
563 aa  113  7.000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03739  RNP domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12300)  29.44 
 
 
484 aa  107  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.169883  normal 
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_51303  predicted protein  30.35 
 
 
222 aa  100  7e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27365  predicted protein  26.35 
 
 
288 aa  98.2  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.60406  normal  0.0267412 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03800  telomere maintenance protein, putative  55.56 
 
 
951 aa  87.8  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03800  telomere maintenance protein, putative  55.56 
 
 
931 aa  87.8  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.141925  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86797  predicted protein  24.4 
 
 
838 aa  79.7  0.00000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.128443 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04865  nucleolin protein Nsr1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07710)  28.22 
 
 
524 aa  71.6  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.046271 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90501  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein) (PABP) (ARS consensus binding protein ACBP-67) (Polyadenylate tail-binding protein)  25.32 
 
 
632 aa  72.4  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.528167  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37626  nuclear localization sequence binding protein  26 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20740  predicted protein  22.07 
 
 
837 aa  66.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.478562  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  23 
 
 
572 aa  64.7  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00917  RNA splicing factor (Pad-1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15810)  25.79 
 
 
552 aa  63.5  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.373895 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01160  polyadenylate-binding protein, putative  22.04 
 
 
673 aa  62.8  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  27.27 
 
 
441 aa  61.6  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03427  RNA binding protein Rnp24, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05840)  26.42 
 
 
357 aa  61.6  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.820047  normal  0.0382541 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04978  pre-RNA splicing factor Srp2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10100)  26.29 
 
 
296 aa  60.1  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.740628  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44442  predicted protein  22.61 
 
 
269 aa  57.8  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00448439  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06110  rRNA primary transcript binding protein, putative  20.77 
 
 
769 aa  57.4  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04000  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein)(PABP)(Polyadenylate tail-binding protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B630]  23.99 
 
 
732 aa  57  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.175791 
 
 
-
 
NC_006686  CND01910  conserved hypothetical protein  36.99 
 
 
253 aa  56.6  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  39.36 
 
 
115 aa  56.2  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10574  pre-mRNA splicing factor (Prp24), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01820)  25.76 
 
 
1290 aa  53.9  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314247  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_7426  predicted protein  39.47 
 
 
81 aa  53.9  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.639579  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  35.96 
 
 
116 aa  53.5  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  34.62 
 
 
90 aa  53.1  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  41.56 
 
 
146 aa  53.1  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21039  predicted protein  26.34 
 
 
246 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10164  nuclear and cytoplasmic polyadenylated RNA-binding protein pub1 (AFU_orthologue; AFUA_1G12000)  21.28 
 
 
477 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02730  mRNA binding protein, putative  24.34 
 
 
274 aa  51.6  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  41.67 
 
 
143 aa  52.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_710  predicted protein  35.53 
 
 
874 aa  52  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000103935  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01517  nucleic acid-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05260)  24.61 
 
 
450 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000597445  normal  0.366843 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03072  RNA binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09620)  38.03 
 
 
856 aa  51.2  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.285465 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04060  conserved hypothetical protein  24.19 
 
 
615 aa  51.2  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.639663  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  38.75 
 
 
137 aa  50.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  32.05 
 
 
88 aa  50.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42828  predicted protein  33.33 
 
 
499 aa  50.4  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90702  RNA recognition motif-containing protein  25.26 
 
 
694 aa  50.1  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
104 aa  50.1  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0356  RNA recognition motif-containing protein  40.51 
 
 
103 aa  50.1  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0992503  normal  0.0823842 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  37.18 
 
 
86 aa  50.1  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12693  predicted protein  26.92 
 
 
151 aa  50.1  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689101  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  31.46 
 
 
102 aa  49.7  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  39.73 
 
 
97 aa  49.7  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  32.88 
 
 
96 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  34.29 
 
 
90 aa  49.7  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04330  ribosome biogenesis (Nop4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06250)  23.11 
 
 
724 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383665  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  32.65 
 
 
105 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
155 aa  48.5  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
149 aa  48.9  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39616  predicted protein  25.11 
 
 
269 aa  48.9  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.312591 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_8451  predicted protein  32 
 
 
76 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0309329  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15612  predicted protein  24.38 
 
 
303 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  37.14 
 
 
114 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  35.71 
 
 
90 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06256  peptidyl prolyl cis-trans isomerase Cyclophilin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12990)  29.2 
 
 
153 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218762  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  31.53 
 
 
99 aa  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01920  hypothetical protein  34.62 
 
 
999 aa  47.8  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.446711  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  30.12 
 
 
97 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  30.77 
 
 
90 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45495  predicted protein  33.78 
 
 
155 aa  48.1  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561334  normal  0.923833 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  32.05 
 
 
196 aa  47.8  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  33.33 
 
 
90 aa  47.4  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  35.53 
 
 
122 aa  47.8  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  37.5 
 
 
162 aa  47.4  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0637  RNP-1 like RNA-binding protein  38.16 
 
 
160 aa  47  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  31.17 
 
 
87 aa  47  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10848  ribonucleoprotein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05810)  23.33 
 
 
340 aa  46.6  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0088  RNA recognition motif-containing protein  37.14 
 
 
99 aa  46.6  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68431  predicted protein  22.8 
 
 
481 aa  46.6  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.326918  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34381  predicted protein  25.58 
 
 
319 aa  46.6  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.693095  normal  0.168449 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  35.44 
 
 
119 aa  46.2  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  36.25 
 
 
151 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  36.36 
 
 
82 aa  46.6  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  32.47 
 
 
90 aa  46.2  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33658  predicted protein  26.9 
 
 
380 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.216905  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0093  RNP-1 like RNA-binding protein  35.71 
 
 
90 aa  46.2  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0401  RNP-1 like RNA-binding protein  37.14 
 
 
92 aa  45.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000557638  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00130  polyadenylation factor 64 kDa subunit, putative  36.36 
 
 
455 aa  45.8  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.232022  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  32.89 
 
 
99 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  35 
 
 
134 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2673  RNP-1 like RNA-binding protein  34.29 
 
 
90 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  31.58 
 
 
101 aa  45.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  35 
 
 
132 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  35 
 
 
152 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  30.77 
 
 
202 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4357  RNP-1 like RNA-binding protein  34.12 
 
 
97 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2332  RNP-1 like RNA-binding protein  33.73 
 
 
108 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.200874 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51283  predicted protein  21.61 
 
 
328 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
157 aa  45.8  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  32.47 
 
 
90 aa  45.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07935  conserved hypothetical protein  34.67 
 
 
320 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05110  RNA binding protein, putative  36.25 
 
 
364 aa  45.1  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23959  predicted protein  22.74 
 
 
605 aa  44.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
95 aa  45.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  36.25 
 
 
176 aa  45.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84007  predicted protein  34.18 
 
 
439 aa  44.7  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>