More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43105 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_43105  predicted protein  100 
 
 		 455 aa  925    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3188  predicted protein  38.97 
 
 		 290 aa  203  6e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0020  small GTP-binding protein  25.75 
 
 		 347 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0708  small GTP-binding protein  25.75 
 
 		 346 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1755  small GTP-binding protein  25.25 
 
 		 346 aa  121  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0148  small GTP-binding protein  25.25 
 
 		 346 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0331774  normal  0.033756 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0093  small GTP-binding protein  25.34 
 
 		 317 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.333043  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05865  nucleolar GTP-binding protein (Nog1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11510)  26.28 
 
 		 656 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.181849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75790  predicted protein  24.48 
 
 		 640 aa  111  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.113893  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1306  small GTP-binding protein  28.38 
 
 		 355 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.294825  normal  0.393807 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2208  small GTP-binding protein  30.34 
 
 		 345 aa  110  5e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.739861 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0641  hypothetical protein  26.18 
 
 		 340 aa  110  6e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0391  small GTP-binding protein  26.73 
 
 		 334 aa  107  4e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1159  GTP-binding protein HSR1-related  28.92 
 
 		 322 aa  105  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0918  small GTP-binding protein  30.92 
 
 		 351 aa  105  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.259421  normal  0.0321262 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0752  small GTP-binding protein  30.07 
 
 		 344 aa  103  6e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.741374 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35887  predicted protein  26.79 
 
 		 664 aa  103  8e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2010  small GTP-binding protein  28.27 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2164  GTP-binding protein  25.46 
 
 		 333 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.311194  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3556  GTP-binding protein HSR1-related protein  28.86 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01880  nucleolar GTP-binding protein 1, putative  27.38 
 
 		 666 aa  101  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2297  GTP-binding protein HSR1-related  27.54 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.754733 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1923  small GTP-binding protein  28.65 
 
 		 326 aa  98.2  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0546  GTP-binding protein HSR1-related  27 
 
 		 329 aa  98.2  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1571  GTP-binding protein HSR1-related protein  32.6 
 
 		 331 aa  96.3  9e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1570  small GTP-binding protein  32.56 
 
 		 354 aa  93.6  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30365  predicted protein  28.63 
 
 		 677 aa  91.3  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.660335  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0801  small GTP-binding protein  25.37 
 
 		 338 aa  90.9  4e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.911521  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1688  small GTP-binding protein  24.44 
 
 		 332 aa  89.7  9e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2103  small GTP-binding protein  25.51 
 
 		 330 aa  89.7  9e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1887  GTP-binding protein  34.5 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1975  small GTP-binding protein  30.95 
 
 		 331 aa  88.6  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2933  GTP-binding protein, HSR1-related  30.73 
 
 		 324 aa  87.8  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000336633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0267  nucleolar GTP-binding 1  34.78 
 
 		 306 aa  88.2  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.809465  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4144  GTP-binding protein Obg/CgtA  27.59 
 
 		 368 aa  62.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0728  GTP-binding protein Obg/CgtA  26.47 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.199071 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  27.5 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.33 
 
 		 463 aa  57.4  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  31.46 
 
 		 435 aa  57  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  31.46 
 
 		 435 aa  57  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0866  GTPase ObgE  27.62 
 
 		 350 aa  56.2  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  26.51 
 
 		 439 aa  56.2  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  26.7 
 
 		 426 aa  54.7  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  25.6 
 
 		 427 aa  54.7  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  28.7 
 
 		 395 aa  55.1  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  27.36 
 
 		 397 aa  54.3  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0642  GTPase ObgE  52.94 
 
 		 336 aa  53.9  0.000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  26.47 
 
 		 337 aa  53.9  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13035  predicted protein  29.38 
 
 		 305 aa  53.9  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0163002  normal  0.451283 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  30.06 
 
 		 358 aa  53.9  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2218  GTPase ObgE  27.43 
 
 		 433 aa  53.5  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.63 
 
 		 435 aa  53.5  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  27.44 
 
 		 434 aa  53.5  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1582  GTPase ObgE  38.96 
 
 		 357 aa  53.1  0.000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2855  GTPase ObgE  27.72 
 
 		 395 aa  53.1  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000349951  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  26.24 
 
 		 337 aa  52.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  41.43 
 
 		 357 aa  53.1  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10246  predicted protein  30.25 
 
 		 293 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.120545 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0895  GTP-binding protein Obg/CgtA  28.12 
 
 		 453 aa  52.4  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000142797  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  25.59 
 
 		 482 aa  52.4  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4334  GTPase ObgE  28.91 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00027074  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001671  GTP-binding protein Obg  27.23 
 
 		 391 aa  52.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000343056  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1523  GTPase ObgE  29.41 
 
 		 411 aa  52.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  28.5 
 
 		 415 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0676  GTPase ObgE  59.52 
 
 		 347 aa  52  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0758  GTPase ObgE  29.41 
 
 		 476 aa  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.639245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00015  GTPase ObgE  40.51 
 
 		 350 aa  51.2  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178881  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44627  predicted protein  30 
 
 		 652 aa  51.2  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  26.7 
 
 		 425 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1072  GTPase  24.72 
 
 		 436 aa  51.2  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.561302  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4265  GTP-binding protein Obg/CgtA  26.86 
 
 		 454 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256023  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  27.27 
 
 		 439 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0185  GTPase ObgE  50.98 
 
 		 347 aa  50.8  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00802  GTPase ObgE  26.87 
 
 		 391 aa  50.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4236  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.03 
 
 		 396 aa  50.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000643018  hitchhiker  0.00000182471 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  26.92 
 
 		 425 aa  50.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1817  GTPase ObgE  57.14 
 
 		 354 aa  50.1  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.389419  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  24.59 
 
 		 424 aa  50.1  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3472  GTPase ObgE  59.52 
 
 		 363 aa  50.1  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.004996  normal  0.428622 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1121  GTPase ObgE  46.43 
 
 		 350 aa  50.1  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.261529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2285  GTPase ObgE  25.23 
 
 		 338 aa  50.1  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.397881  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0131  GTPase ObgE  49.02 
 
 		 356 aa  50.1  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0091  GTPase ObgE  49.02 
 
 		 350 aa  50.1  0.00009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333267  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0532  GTPase ObgE  25.45 
 
 		 433 aa  50.1  0.00009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0114887  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1536  GTPase ObgE  57.14 
 
 		 344 aa  50.1  0.00009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  27.37 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  57.14 
 
 		 345 aa  49.7  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1222  Obg family GTPase CgtA  27.03 
 
 		 560 aa  49.7  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000289684 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1681  GTPase ObgE  25.99 
 
 		 339 aa  49.7  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00207916  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1726  GTPase ObgE  54.76 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  52.38 
 
 		 402 aa  49.7  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0498  GTPase ObgE  25.99 
 
 		 339 aa  49.7  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000072734  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0020  GTPase ObgE  26.79 
 
 		 365 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  46.55 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  54.76 
 
 		 405 aa  48.9  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1414  GTPase ObgE  44.64 
 
 		 369 aa  48.9  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  26.76 
 
 		 353 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1601  GTPase ObgE  54.76 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000135042  hitchhiker  0.000110073 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  54.76 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0283  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.54 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>