196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0392 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0392  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 174 aa  358  2e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00035  putative 50S ribosomal protein L10  51.72 
 
 		 177 aa  181  6e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0424  50S ribosomal protein L10  48.28 
 
 		 171 aa  169  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000721465  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0847  ribosomal protein L10  43.68 
 
 		 173 aa  160  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3451  ribosomal protein L10  44 
 
 		 176 aa  149  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00335052  normal  0.0391621 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1941  50S ribosomal protein L10  47.17 
 
 		 167 aa  148  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136408  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4479  ribosomal protein L10  40.91 
 
 		 177 aa  143  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3171  50S ribosomal protein L10  43.04 
 
 		 167 aa  133  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1708  ribosomal protein L10  43.67 
 
 		 177 aa  129  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0962108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1398  50S ribosomal protein L10  38.33 
 
 		 181 aa  125  3e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1106  ribosomal protein L10  37.93 
 
 		 176 aa  121  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0567771  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  29.21 
 
 		 181 aa  77  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  30.29 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0355  50S ribosomal protein L10  35.4 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000413063  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0640  50S ribosomal protein L10  32.37 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.590803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  27.91 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2676  ribosomal protein L10  30.46 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000001837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1174  50S ribosomal protein L10  29.87 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000920712  normal  0.67375 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0194  50S ribosomal protein L10  31.43 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000548969  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2681  50S ribosomal protein L10  38.46 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132453  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0231  50S ribosomal protein L10  30.81 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103356  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  26.62 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  29.87 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  31.78 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  31.78 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  28.57 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0300  ribosomal protein L10  28.41 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000817286  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1964  50S ribosomal protein L10  29.48 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  28 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  25.95 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0504  50S ribosomal protein L10  23.46 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000340487  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  27.85 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  27.61 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  25.71 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  27.85 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  28.67 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  27.81 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  27.92 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  27.85 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4557  50S ribosomal protein L10  27.59 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.669843  decreased coverage  0.0090203 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  25.71 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  28.41 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  28.4 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  29.17 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0617  ribosomal protein L10  26.9 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.532211  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  28.08 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  26.49 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  26.49 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  29.75 
 
 		 174 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  26.49 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  26.49 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  26.49 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  26.49 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  26.49 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  24.71 
 
 		 172 aa  53.9  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  26.49 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2178  ribosomal protein L10  27.33 
 
 		 175 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.905696 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  27.43 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4018  ribosomal protein L10  27.68 
 
 		 174 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  26.49 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  27.04 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  24.68 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  24.53 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0478  50S ribosomal protein L10  26.9 
 
 		 195 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00597987  hitchhiker  0.00527924 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  27.43 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0445  50S ribosomal protein L10  26.9 
 
 		 166 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.470652  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0475  50S ribosomal protein L10  26.9 
 
 		 166 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0745  50S ribosomal protein L10  25.7 
 
 		 171 aa  52.4  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00501407 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  27.4 
 
 		 168 aa  52.4  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3869  50S ribosomal protein L10  34.92 
 
 		 182 aa  52.4  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  21.94 
 
 		 166 aa  52  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  25.83 
 
 		 166 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06150  50S ribosomal protein L10  26.03 
 
 		 166 aa  51.2  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1018  50S ribosomal protein L10  24.86 
 
 		 178 aa  51.2  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251564 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  27.85 
 
 		 174 aa  50.8  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3918  50S ribosomal protein L10  26.71 
 
 		 166 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  27.33 
 
 		 168 aa  50.8  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  27.33 
 
 		 168 aa  50.8  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  25.86 
 
 		 177 aa  50.8  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4758  50S ribosomal protein L10  26.21 
 
 		 166 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00494482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  31.29 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0317  50S ribosomal protein L10  30.19 
 
 		 173 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0060406  hitchhiker  0.00087235 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5088  50S ribosomal protein L10  26.21 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000128873  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2994  50S ribosomal protein L10  24.71 
 
 		 173 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  28.16 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0286  50S ribosomal protein L10  31.29 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000520195  hitchhiker  0.00386218 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2951  ribosomal protein L10  28.46 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0265827  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2423  50S ribosomal protein L10  28.57 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  28.57 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0396  50S ribosomal protein L10  27.42 
 
 		 173 aa  48.9  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252363  hitchhiker  0.00709296 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0632  50S ribosomal protein L10  24.86 
 
 		 175 aa  49.3  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  27.4 
 
 		 173 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0596  50S ribosomal protein L10  24.85 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0140503  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1667  50S ribosomal protein L10  29.58 
 
 		 173 aa  48.9  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  27.89 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4678  50S ribosomal protein L10  28.76 
 
 		 182 aa  48.5  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000989378  decreased coverage  0.00291158 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  30.16 
 
 		 174 aa  48.9  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  27.33 
 
 		 173 aa  48.5  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  26.25 
 
 		 166 aa  48.5  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>