More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2344 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2344  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 570 aa  1154    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.809256 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3838  MscS Mechanosensitive ion channel  44.99 
 
 		 563 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3888  MscS Mechanosensitive ion channel  43.33 
 
 		 563 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.203429 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0742  MscS Mechanosensitive ion channel  47.86 
 
 		 563 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0771  MscS Mechanosensitive ion channel  47.86 
 
 		 563 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.034825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0508  MscS Mechanosensitive ion channel  43.79 
 
 		 566 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1723  mechanosensitive ion channel family protein  39.01 
 
 		 545 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0997  MscS Mechanosensitive ion channel  40.75 
 
 		 579 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00010123  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3258  MscS mechanosensitive ion channel  41.75 
 
 		 600 aa  414  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0680122  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2865  MscS Mechanosensitive ion channel  38.13 
 
 		 545 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4074  MscS mechanosensitive ion channel  35.65 
 
 		 572 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3231  MscS Mechanosensitive ion channel  37.93 
 
 		 545 aa  364  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.371413 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1169  MscS Mechanosensitive ion channel  37.36 
 
 		 556 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2961  MscS Mechanosensitive ion channel  38.87 
 
 		 593 aa  352  8e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.80043  hitchhiker  0.0000000094968 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2427  MscS mechanosensitive ion channel  35.96 
 
 		 550 aa  348  1e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3676  MscS Mechanosensitive ion channel  35.76 
 
 		 524 aa  347  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4449  MscS Mechanosensitive ion channel  39.71 
 
 		 546 aa  333  6e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1278  small-conductance mechanosensitive channel-like  42.43 
 
 		 520 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0806  MscS mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 		 549 aa  289  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4585  MscS mechanosensitive ion channel  32.92 
 
 		 571 aa  280  6e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1474  MscS Mechanosensitive ion channel  30.31 
 
 		 559 aa  253  6e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793179  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1050  MscS mechanosensitive ion channel  37.61 
 
 		 481 aa  230  5e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0364  MscS Mechanosensitive ion channel  28.97 
 
 		 538 aa  207  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000549474  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1646  MscS mechanosensitive ion channel  32.05 
 
 		 557 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0897  MscS Mechanosensitive ion channel  29.12 
 
 		 545 aa  201  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4631  MscS mechanosensitive ion channel  27.33 
 
 		 581 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2741  MscS mechanosensitive ion channel  25.59 
 
 		 545 aa  190  7e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3012  MscS mechanosensitive ion channel  26.75 
 
 		 545 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1572  MscS Mechanosensitive ion channel  26.82 
 
 		 548 aa  185  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00917582 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3049  MscS mechanosensitive ion channel  25.65 
 
 		 542 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2521  MscS mechanosensitive ion channel  36.09 
 
 		 230 aa  164  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.871653  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  25.34 
 
 		 310 aa  92.8  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  26.58 
 
 		 289 aa  90.5  7e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1803  MscS Mechanosensitive ion channel  23.33 
 
 		 595 aa  90.1  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  0.895337 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4892  MscS Mechanosensitive ion channel  23.09 
 
 		 560 aa  88.6  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  30.05 
 
 		 299 aa  87  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1074  MscS mechanosensitive ion channel  25.21 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0868741  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  25.47 
 
 		 1120 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  25.47 
 
 		 1120 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  25.47 
 
 		 1120 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  25.47 
 
 		 1120 aa  85.1  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  25.47 
 
 		 1120 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  25.47 
 
 		 1120 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  25.47 
 
 		 1120 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  25.47 
 
 		 1118 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  25.47 
 
 		 1120 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1934  mechanosensitive ion channel family protein  25.91 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117079  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  29.67 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  21.98 
 
 		 550 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  25.79 
 
 		 435 aa  82.8  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  24.52 
 
 		 1120 aa  81.6  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  24.52 
 
 		 1120 aa  81.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  31.96 
 
 		 269 aa  82  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  24.52 
 
 		 1120 aa  81.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1734  MscS mechanosensitive ion channel  25.45 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  30.1 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  25.94 
 
 		 1118 aa  81.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2162  periplasmic binding protein; mechanosensitive ion channel component  25.73 
 
 		 794 aa  81.3  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  25.94 
 
 		 1120 aa  81.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  25.94 
 
 		 1120 aa  81.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  25.94 
 
 		 1118 aa  81.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  25.94 
 
 		 1118 aa  81.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  27.82 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2829  MscS mechanosensitive ion channel  25.74 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  27.54 
 
 		 1144 aa  80.5  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  27.52 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  26.29 
 
 		 291 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  28.23 
 
 		 393 aa  79.7  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  23.75 
 
 		 1133 aa  78.6  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  31.16 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  23.2 
 
 		 636 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2355  MscS mechanosensitive ion channel  27.33 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549147  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  26.02 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  28.33 
 
 		 867 aa  76.6  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  24.69 
 
 		 1115 aa  76.6  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2895  helix-turn-helix, AraC type  25.48 
 
 		 264 aa  77  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0170548 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  24.73 
 
 		 275 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  24.73 
 
 		 275 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  24.28 
 
 		 275 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  29.9 
 
 		 874 aa  75.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  23.4 
 
 		 636 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1130  potassium efflux protein KefA  26.92 
 
 		 1130 aa  75.1  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000811569 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1013  potassium efflux protein KefA  25.13 
 
 		 1128 aa  75.1  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  25.83 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1187  MscS Mechanosensitive ion channel  27.46 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0250538  hitchhiker  0.00000123969 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  28.77 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  27.87 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  23.19 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  20.82 
 
 		 685 aa  73.9  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  27.78 
 
 		 825 aa  72.8  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  21.78 
 
 		 1117 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  24.59 
 
 		 1111 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0091  MscS Mechanosensitive ion channel  30.49 
 
 		 297 aa  73.2  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  24.07 
 
 		 362 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6131  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  27.62 
 
 		 489 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  25 
 
 		 806 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  24.39 
 
 		 1117 aa  72.4  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5117  potassium efflux protein KefA  23.4 
 
 		 1102 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0399  potassium efflux protein KefA  24.1 
 
 		 1102 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3222  MscS mechanosensitive ion channel  28.9 
 
 		 866 aa  72.4  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>