176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_12270 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  500  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  92.89 
 
 		 253 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4845  hypothetical protein  65.22 
 
 		 253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  66.01 
 
 		 253 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4667  hypothetical protein  66.01 
 
 		 253 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  66.01 
 
 		 253 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  63.24 
 
 		 256 aa  300  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4955  hypothetical protein  64.82 
 
 		 259 aa  295  4e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4809  hypothetical protein  62.45 
 
 		 256 aa  291  8e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4350  hypothetical protein  62.85 
 
 		 256 aa  287  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.571973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  62.83 
 
 		 253 aa  271  9e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  48.04 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  36.48 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  37.75 
 
 		 251 aa  129  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0451  hypothetical protein  37.73 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0851165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  39.68 
 
 		 262 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  45.45 
 
 		 252 aa  121  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  37.44 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0343  hypothetical protein  39.77 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132846  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2924  hypothetical protein  38.43 
 
 		 271 aa  116  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.825508 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  43.68 
 
 		 215 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1132  hypothetical protein  42.22 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1968  hypothetical protein  39.18 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1670  hypothetical protein  38.6 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  30.04 
 
 		 251 aa  102  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2935  hypothetical protein  35.86 
 
 		 266 aa  102  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  40.11 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  33.7 
 
 		 272 aa  91.3  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  32.08 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  33.33 
 
 		 266 aa  86.7  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  33.06 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  34.18 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  26.17 
 
 		 242 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  35.91 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  34.45 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  30.65 
 
 		 263 aa  78.6  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  33.15 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  34.02 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  33.15 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  33.51 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  28.51 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  35.33 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  31.96 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  33.52 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0549  protein of unknown function DUF218  33.78 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  29.1 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  34.08 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  24.4 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  32.5 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  26.14 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  28.98 
 
 		 244 aa  62  0.000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  27.56 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3776  hypothetical protein  35.9 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892211  normal  0.779131 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1908  hypothetical protein  34.27 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1731  hypothetical protein  34.27 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138234  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  40.46 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2372  hypothetical protein  30.54 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  37.4 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  26.91 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  26.83 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1753  hypothetical protein  33.15 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1073  hypothetical protein  33.15 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1516  hypothetical protein  33.15 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.746081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0183  hypothetical protein  33.15 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00678491  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  29.02 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  37.1 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  30.65 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  33.33 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0242  hypothetical protein  31.9 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  26.48 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0625  protein of unknown function DUF218  35.14 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050402  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  38.39 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  31.14 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  25.79 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4400  hypothetical protein  35.42 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846693  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3336  hypothetical protein  38.55 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  29.46 
 
 		 265 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1471  hypothetical protein  30.88 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135208  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1765  hypothetical protein  30.11 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.0749745 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00180  transmembrane  28.74 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384115  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1009  hypothetical protein  28.72 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  37.5 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1490  hypothetical protein  28.72 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  35.33 
 
 		 281 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1466  hypothetical protein  28.72 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  32.97 
 
 		 268 aa  53.9  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  29.78 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4631  hypothetical protein  27.03 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.189106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2730  protein of unknown function DUF218  37.5 
 
 		 279 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111496 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0146  lipoprotein transmembrane  32.04 
 
 		 251 aa  53.1  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2048  hypothetical protein  30.36 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000229439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  31.35 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  36.36 
 
 		 336 aa  52.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  34.81 
 
 		 275 aa  52  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  28.57 
 
 		 278 aa  52  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0706  hypothetical protein  28.33 
 
 		 255 aa  52  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0558  hypothetical protein  40.13 
 
 		 153 aa  51.2  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2830  putative lipoprotein transmembrane  27.54 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.160067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4675  hypothetical protein  34.5 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139137  normal  0.101849 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  32.43 
 
 		 268 aa  51.2  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>