More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_09320 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0878  ABC transporter ATP-binding protein  93.38 
 
 		 574 aa  860    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0730898  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09320  putative ATP-binding component of ABC transporter  100 
 
 		 574 aa  1072    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.955623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0844  ABC transporter component  65.18 
 
 		 569 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1824  ABC transporter ATP-binding protein  60.93 
 
 		 590 aa  536  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.145117  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0676  ABC efflux pump, fused inner membrane and ATPase subunits  57.93 
 
 		 594 aa  531  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.194816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3373  ABC transporter related  58.68 
 
 		 588 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195497  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4994  ABC transporter related  58.68 
 
 		 588 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00642068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5293  ABC transporter related  58.75 
 
 		 587 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.159321 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2154  ABC transporter  59.53 
 
 		 594 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.513956  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0791  putative ABC transporter, ATP-binding protein  59.53 
 
 		 594 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0881  putative ABC transporter, ATP-binding protein  59.53 
 
 		 594 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2824  ABC transporter related protein  38.28 
 
 		 571 aa  281  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.866997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4512  ABC transporter component  36.8 
 
 		 575 aa  277  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  38.04 
 
 		 596 aa  274  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1036  ABC transporter related protein  37.66 
 
 		 579 aa  256  8e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0188433  normal  0.0545959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4419  ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.15 
 
 		 581 aa  244  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  37.39 
 
 		 581 aa  243  6e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4045  ABC transporter related  33.57 
 
 		 582 aa  232  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2595  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  35.03 
 
 		 601 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.398767  normal  0.0147502 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  33.46 
 
 		 577 aa  228  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2339  ABC transporter component  34.59 
 
 		 582 aa  226  8e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.667532  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4444  ABC transporter related  34.56 
 
 		 577 aa  226  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2373  ABC transporter related protein  37.07 
 
 		 578 aa  211  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267302  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0818  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.33 
 
 		 573 aa  206  9e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00589129  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  31.58 
 
 		 600 aa  206  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  33.65 
 
 		 1138 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  28.14 
 
 		 581 aa  201  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  28.7 
 
 		 590 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  27.92 
 
 		 581 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  30.48 
 
 		 588 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1441  ABC transporter related  32.61 
 
 		 606 aa  196  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3018  ABC transporter related  36.32 
 
 		 595 aa  195  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  29.82 
 
 		 575 aa  195  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  34.48 
 
 		 600 aa  194  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  32.42 
 
 		 576 aa  192  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  30.22 
 
 		 638 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  33.56 
 
 		 579 aa  191  4e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  33.72 
 
 		 577 aa  190  5e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.66 
 
 		 581 aa  190  5e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  29.43 
 
 		 571 aa  190  7e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1491  ABC transporter related  31.49 
 
 		 584 aa  189  8e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11379  drug ABC transporter ATP-binding protein  31.48 
 
 		 579 aa  188  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73648 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  35.89 
 
 		 582 aa  188  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1331  ABC transporter related  28.3 
 
 		 609 aa  188  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134992  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.65 
 
 		 581 aa  187  3e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  25.21 
 
 		 580 aa  188  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  36.16 
 
 		 632 aa  188  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3043  ABC transporter related  37.24 
 
 		 598 aa  188  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  37.08 
 
 		 598 aa  188  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  35.64 
 
 		 575 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  44.02 
 
 		 593 aa  187  5e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  34.86 
 
 		 579 aa  187  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.51 
 
 		 585 aa  187  5e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  32.13 
 
 		 468 aa  187  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  33.71 
 
 		 588 aa  187  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  32.8 
 
 		 600 aa  186  7e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.7 
 
 		 574 aa  186  1.0000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7144  ABC transporter related  35.85 
 
 		 632 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0160  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.84 
 
 		 606 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  40.07 
 
 		 608 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2225  ABC transporter related  32.63 
 
 		 612 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164174  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  35.12 
 
 		 607 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  29.09 
 
 		 588 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1330  ABC transporter related  36.89 
 
 		 571 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.987639  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  34.3 
 
 		 574 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  33.16 
 
 		 598 aa  184  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2429  ABC transporter related  26.33 
 
 		 619 aa  184  5.0000000000000004e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.572705  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  36.41 
 
 		 640 aa  183  8.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0597  ABC transporter related  30.31 
 
 		 596 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  31.77 
 
 		 606 aa  183  9.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  32.09 
 
 		 610 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  29.86 
 
 		 619 aa  182  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0316  ABC transporter related  33.23 
 
 		 607 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  28.63 
 
 		 604 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  32.09 
 
 		 610 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2480  ABC transporter related  26.23 
 
 		 574 aa  182  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.7 
 
 		 579 aa  182  2e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  38.24 
 
 		 620 aa  182  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  36.34 
 
 		 642 aa  182  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0708  ABC transporter related  34.94 
 
 		 573 aa  182  2e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153727  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  38.78 
 
 		 636 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  34.22 
 
 		 644 aa  182  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  27.27 
 
 		 587 aa  181  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3402  ABC transporter related protein  38.51 
 
 		 622 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3356  ABC transporter related  30.43 
 
 		 594 aa  182  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0405132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3526  ABC transporter related  30.09 
 
 		 598 aa  182  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0628  ABC transporter, ATP-binding protein  28.15 
 
 		 573 aa  181  2.9999999999999997e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.484282  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3017  ABC transporter related protein  34.24 
 
 		 639 aa  181  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2006  ABC transporter related  32.79 
 
 		 575 aa  181  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.54 
 
 		 577 aa  180  4.999999999999999e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0837  ABC transporter related protein  32.58 
 
 		 603 aa  180  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.568302 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  31.93 
 
 		 610 aa  180  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3368  ABC transporter related  33.22 
 
 		 655 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00530466 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.2 
 
 		 581 aa  179  8e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1342  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.67 
 
 		 588 aa  180  8e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  30.71 
 
 		 578 aa  179  9e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  30.71 
 
 		 578 aa  179  9e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  36.93 
 
 		 627 aa  179  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1273  ABC-type transport system ATPase  37.29 
 
 		 622 aa  179  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.788537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  31.21 
 
 		 612 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>