More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_06091 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_06091  putative inner membrane protein translocase component YidC  100 
 
 
377 aa  754    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0805  putative inner membrane protein translocase component YidC  77.23 
 
 
382 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.792706  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16601  putative inner membrane protein translocase component YidC  76.96 
 
 
382 aa  612  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0685745  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1787  putative inner membrane protein translocase component YidC  76.58 
 
 
380 aa  597  1e-170  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.169669  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12731  putative inner membrane protein translocase component YidC  76.76 
 
 
383 aa  597  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00483232 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0577  putative inner membrane protein translocase component YidC  75.27 
 
 
376 aa  592  1e-168  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13871  putative inner membrane protein translocase component YidC  71.84 
 
 
380 aa  568  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0838115  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13791  putative inner membrane protein translocase component YidC  72.11 
 
 
380 aa  570  1e-161  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.429072  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1287  putative inner membrane protein translocase component YidC  71.84 
 
 
380 aa  565  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.495694  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13581  putative inner membrane protein translocase component YidC  70.98 
 
 
379 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.13065  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1617  putative inner membrane protein translocase component YidC  57.99 
 
 
392 aa  456  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.281889 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0687  YidC/Oxa1 family lipolytic protein  58.47 
 
 
383 aa  444  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.852164  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4710  putative inner membrane protein translocase component YidC  56.43 
 
 
382 aa  435  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.620699  normal  0.652481 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3435  putative inner membrane protein translocase component YidC  57.94 
 
 
380 aa  433  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98769  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0894  putative inner membrane protein translocase component YidC  57.78 
 
 
381 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4060  putative inner membrane protein translocase component YidC  55.82 
 
 
379 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4099  putative inner membrane protein translocase component YidC  55.82 
 
 
379 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5265  putative inner membrane protein translocase component YidC  50.77 
 
 
396 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.0483383 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.82 
 
 
544 aa  98.6  2e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  39.47 
 
 
628 aa  95.1  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0705  60 kDa inner membrane insertion protein  40.32 
 
 
268 aa  95.1  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00153536  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.46 
 
 
526 aa  94  4e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2561  60 kDa inner membrane insertion protein  44.25 
 
 
587 aa  94  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2521  protein translocase subunit yidC  41.67 
 
 
225 aa  93.6  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0677656  hitchhiker  0.0000441825 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2921  60 kDa inner membrane insertion protein  43.12 
 
 
583 aa  93.6  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000870087  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3326  60 kDa inner membrane insertion protein  42.11 
 
 
229 aa  93.2  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010032  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2335  60 kDa inner membrane insertion protein  42.86 
 
 
584 aa  93.2  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.30148 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14180  preprotein translocase subunit YidC  39.81 
 
 
257 aa  92.8  9e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.75 
 
 
530 aa  91.3  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  35.88 
 
 
539 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0976  60 kDa inner membrane insertion protein  44.09 
 
 
515 aa  89.7  8e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000560326  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0522  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.37 
 
 
787 aa  89.4  9e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2224  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.81 
 
 
565 aa  89  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.176857  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.38 
 
 
567 aa  89  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.9 
 
 
530 aa  88.6  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2030  Oxa1/60 kDa IMP family protein  35.4 
 
 
584 aa  89.4  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728079  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  45.54 
 
 
557 aa  89.4  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.94 
 
 
607 aa  89  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2322  60 kDa inner membrane insertion protein  45.45 
 
 
246 aa  88.6  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28520  preprotein translocase subunit YidC  38.89 
 
 
257 aa  89  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000336467  hitchhiker  0.00141204 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2314  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.81 
 
 
565 aa  89.4  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2521  60 kDa inner membrane insertion protein  39.82 
 
 
583 aa  88.2  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.39836  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.9 
 
 
528 aa  88.6  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.66 
 
 
555 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1196  60 kDa inner membrane insertion protein  45.45 
 
 
313 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000975332  decreased coverage  0.000283466 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.52 
 
 
554 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2761  60 kDa inner membrane insertion protein  39.45 
 
 
607 aa  88.6  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00156277  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.44 
 
 
595 aa  88.2  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0237  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.54 
 
 
596 aa  88.6  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.53 
 
 
575 aa  88.6  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.12 
 
 
578 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  35.88 
 
 
548 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.12 
 
 
578 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.52 
 
 
554 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.94 
 
 
610 aa  87.8  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.94 
 
 
610 aa  87.8  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.59 
 
 
584 aa  87.8  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0458  protein translocase subunit yidC  43.36 
 
 
592 aa  87.8  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.836766 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  43.43 
 
 
345 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.66 
 
 
553 aa  87.4  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2129  Oxa1/60 kDa IMP family protein  42.2 
 
 
585 aa  87.4  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00488382  normal  0.707448 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0136  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.46 
 
 
533 aa  87  4e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.170147  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.79 
 
 
541 aa  87.4  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2396  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.82 
 
 
582 aa  87  5e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2014  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  42.06 
 
 
621 aa  87  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.121616  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2932  60 kDa inner membrane insertion protein  46.73 
 
 
213 aa  87  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000772095  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  34.03 
 
 
553 aa  86.7  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2740  protein translocase subunit yidC  41.96 
 
 
579 aa  86.7  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.93 
 
 
555 aa  86.3  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0376  putative inner membrane protein translocase component YidC  38.94 
 
 
609 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388979  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0119  60 kDa inner membrane insertion protein  37.84 
 
 
209 aa  85.5  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2035  60 kDa inner membrane insertion protein  41.28 
 
 
336 aa  85.9  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23580  60 kDa inner membrane insertion protein  37.39 
 
 
217 aa  85.5  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00201404  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.21 
 
 
518 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.18 
 
 
581 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3121  60 kDa inner membrane insertion protein  40.19 
 
 
261 aa  85.1  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000331776  hitchhiker  0.0000000745371 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  40.95 
 
 
223 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  39.81 
 
 
552 aa  85.1  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.16 
 
 
557 aa  85.1  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.34 
 
 
517 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.17 
 
 
531 aa  85.5  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  38.02 
 
 
547 aa  84.3  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.35 
 
 
600 aa  84.3  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0817  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.29 
 
 
632 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  41.41 
 
 
330 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1631  60 kDa inner membrane insertion protein  41.59 
 
 
433 aa  84  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.22695  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2600  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  42.86 
 
 
567 aa  84  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.417089 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  39.66 
 
 
556 aa  84  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  40.87 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.9 
 
 
543 aa  83.6  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  41.35 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  40.87 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.9 
 
 
544 aa  83.6  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  40.87 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  40.87 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  40.87 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  40 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  40.87 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  37.04 
 
 
543 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  33.86 
 
 
536 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>