218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_01591 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  73.29 
 
 
475 aa  712    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  81.06 
 
 
464 aa  793    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  73.51 
 
 
475 aa  713    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  69.54 
 
 
479 aa  675    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  78.48 
 
 
472 aa  766    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  78.26 
 
 
472 aa  765    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  80.04 
 
 
465 aa  793    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  74.79 
 
 
474 aa  760    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  74.83 
 
 
479 aa  726    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  72.85 
 
 
459 aa  708    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  79.48 
 
 
466 aa  795    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  78.01 
 
 
473 aa  787    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  81.06 
 
 
462 aa  793    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  79.57 
 
 
472 aa  775    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  100 
 
 
472 aa  976    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  80.26 
 
 
466 aa  795    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  74.12 
 
 
471 aa  723    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  65.34 
 
 
477 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  54.39 
 
 
589 aa  540  9.999999999999999e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  55.72 
 
 
599 aa  535  1e-151  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  54.91 
 
 
624 aa  534  1e-150  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  56.47 
 
 
552 aa  528  1e-149  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  40.52 
 
 
453 aa  351  2e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  39.13 
 
 
453 aa  346  5e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  38.96 
 
 
453 aa  345  8.999999999999999e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  38.63 
 
 
463 aa  343  4e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  39 
 
 
453 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  38.91 
 
 
455 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  38.48 
 
 
453 aa  332  6e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  38.26 
 
 
453 aa  331  1e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  37.34 
 
 
460 aa  304  3.0000000000000004e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  37.78 
 
 
461 aa  292  9e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1176  Carotene 7,8-desaturase  36.94 
 
 
462 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.180076  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1173  zeta-carotene desaturase  36.04 
 
 
461 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000320899  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0877  Carotene 7,8-desaturase  36.44 
 
 
460 aa  279  9e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0378337  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1181  Carotene 7,8-desaturase  36.26 
 
 
459 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000113252  normal  0.0145788 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1283  carotene 7,8-desaturase  35.65 
 
 
462 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.859886  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  33.81 
 
 
489 aa  270  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  33.26 
 
 
483 aa  263  6e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  33.33 
 
 
484 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  32.38 
 
 
490 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  32.38 
 
 
490 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  32.92 
 
 
484 aa  256  5e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  33.61 
 
 
479 aa  252  8.000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  32.52 
 
 
499 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  31.95 
 
 
479 aa  250  4e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  33.06 
 
 
482 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  33.47 
 
 
478 aa  249  8e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  32.52 
 
 
486 aa  249  9e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  31.49 
 
 
484 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  31.44 
 
 
488 aa  247  3e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  31.17 
 
 
488 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  32.32 
 
 
486 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1512  zeta-carotene desaturase  31.68 
 
 
481 aa  231  2e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.311968  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26211  zeta-carotene desaturase  31.93 
 
 
490 aa  228  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  30.12 
 
 
591 aa  214  1.9999999999999998e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  26.42 
 
 
451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3204  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.23 
 
 
477 aa  131  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.55236  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1747  carotene 7,8-desaturase  26.79 
 
 
481 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.16 
 
 
439 aa  119  9e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  26.19 
 
 
503 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  24.62 
 
 
500 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  24.13 
 
 
448 aa  110  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  24.08 
 
 
520 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  22.34 
 
 
452 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  22.34 
 
 
452 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  22.34 
 
 
452 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5715  amine oxidase  26.77 
 
 
562 aa  94.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0865614  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2707  amine oxidase  26.19 
 
 
410 aa  85.9  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0288942  hitchhiker  0.00000819833 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4193  squalene-associated FAD-dependent desaturase  21.18 
 
 
447 aa  84.3  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0821  amine oxidase  22.94 
 
 
569 aa  81.3  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.147648  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5179  amine oxidase  22.34 
 
 
417 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5680  amine oxidase  22.34 
 
 
417 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799558  hitchhiker  0.00195148 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4555  squalene-associated FAD-dependent desaturase  22.2 
 
 
417 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.160695 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4952  amine oxidase  22.01 
 
 
417 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15769  normal  0.0932773 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5505  squalene-associated FAD-dependent desaturase  22.01 
 
 
417 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342763  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  30.59 
 
 
647 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  23.41 
 
 
438 aa  77  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  29.92 
 
 
647 aa  77  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33779  predicted protein  24.62 
 
 
578 aa  76.6  0.0000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6666  squalene-associated FAD-dependent desaturase  24.22 
 
 
440 aa  76.6  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393983  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0088  hypothetical protein  22.47 
 
 
448 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.220394  normal  0.164147 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0018  amine oxidase  21.46 
 
 
417 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  27.71 
 
 
435 aa  75.1  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  24.05 
 
 
425 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0179  hypothetical protein  21.63 
 
 
448 aa  74.3  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3962  Polyprenyl synthetase  23.79 
 
 
989 aa  73.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.190104  normal  0.617204 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1093  zeta-carotene desaturase-like  22.55 
 
 
544 aa  73.2  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.802606  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  22.98 
 
 
506 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  27.09 
 
 
645 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  22.98 
 
 
506 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  23.22 
 
 
506 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  26.36 
 
 
647 aa  69.7  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6348  squalene-associated FAD-dependent desaturase  22.93 
 
 
424 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0839028  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  20.25 
 
 
447 aa  67.4  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1695  amine oxidase  22.82 
 
 
486 aa  67  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.916682  hitchhiker  0.0000276291 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3174  squalene-associated FAD-dependent desaturase  20.97 
 
 
417 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.724661  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15806  pds-like3, phytoene desaturase-like protein  23.82 
 
 
506 aa  65.9  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.488175  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3813  amine oxidase  26.4 
 
 
523 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5205  amine oxidase  22.82 
 
 
565 aa  65.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>