193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2129 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_2129  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 442 aa  906    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0018  MscS mechanosensitive ion channel  56.71 
 
 		 416 aa  488  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0968  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  56.89 
 
 		 403 aa  474  1e-132  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0457255  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1801  hypothetical protein  55.27 
 
 		 444 aa  419  1e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1733  MscS mechanosensitive ion channel  55.27 
 
 		 444 aa  418  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0330  MscS Mechanosensitive ion channel  52.56 
 
 		 423 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.755034 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4533  MscS mechanosensitive ion channel  49.49 
 
 		 433 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3828  MscS mechanosensitive ion channel  55.59 
 
 		 433 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280894  normal  0.277572 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4040  MscS mechanosensitive ion channel  49.23 
 
 		 433 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1377  MscS mechanosensitive ion channel  48.14 
 
 		 433 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.563971  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1574  mechanosensitive ion channel family protein  48.98 
 
 		 436 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.332059  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3803  MscS mechanosensitive ion channel  47.67 
 
 		 430 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398748 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3267  MscS Mechanosensitive ion channel  47.38 
 
 		 459 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1436  MscS mechanosensitive ion channel  52.74 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3919  MscS mechanosensitive ion channel  47.88 
 
 		 426 aa  382  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1659  hypothetical protein  48.6 
 
 		 442 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.372862  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19230  hypothetical protein  48.09 
 
 		 442 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4067  MscS mechanosensitive ion channel  48.52 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1305  MscS mechanosensitive ion channel  49.24 
 
 		 433 aa  365  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.409264 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4004  MscS mechanosensitive ion channel  47.76 
 
 		 453 aa  361  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.2264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1267  MscS mechanosensitive ion channel  44.77 
 
 		 416 aa  360  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4466  MscS mechanosensitive ion channel  46.74 
 
 		 413 aa  358  8e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5728  MscS mechanosensitive ion channel  44.96 
 
 		 413 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.934424 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4577  MscS mechanosensitive ion channel  44.96 
 
 		 413 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3791  MscS mechanosensitive ion channel  44.96 
 
 		 464 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3632  putative small-conductance mechanosensitive channel  44.07 
 
 		 393 aa  348  1e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0118  MscS mechanosensitive ion channel  44.5 
 
 		 422 aa  345  1e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0327583  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3752  MscS mechanosensitive ion channel  45.54 
 
 		 416 aa  342  7e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582407 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0086  MscS mechanosensitive ion channel  44.1 
 
 		 426 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.845728  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1801  MscS mechanosensitive ion channel  43.95 
 
 		 437 aa  339  5e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1640  MscS mechanosensitive ion channel  45.92 
 
 		 406 aa  339  5e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.868645  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4237  MscS mechanosensitive ion channel  44.02 
 
 		 421 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0117  MscS mechanosensitive ion channel  44.02 
 
 		 421 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0121  MscS Mechanosensitive ion channel  44.02 
 
 		 421 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0122  MscS mechanosensitive ion channel  44.02 
 
 		 421 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0117  MscS mechanosensitive ion channel  43.85 
 
 		 422 aa  334  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0112  MscS mechanosensitive ion channel  43.85 
 
 		 422 aa  334  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.99072 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0117  MscS mechanosensitive ion channel  44.1 
 
 		 422 aa  334  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222536 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2643  hypothetical protein  44.68 
 
 		 412 aa  334  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2763  MscS mechanosensitive ion channel  41.93 
 
 		 421 aa  332  9e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0614  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel  44.02 
 
 		 415 aa  330  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0670  small conductance mechanosensitive ion channel transporter  44.02 
 
 		 415 aa  330  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.74208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0680  small conductance mechanosensitive ion channel family transporter  44.02 
 
 		 415 aa  330  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0595  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  44.19 
 
 		 415 aa  329  7e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3052  MscS Mechanosensitive ion channel  43.93 
 
 		 415 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0621  small conductance mechanosensitive ion channel transporter  44.02 
 
 		 415 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.841631 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3069  MscS mechanosensitive ion channel  43.93 
 
 		 415 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.588458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0624  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  43.93 
 
 		 415 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.248163  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00538  predicted mechanosensitive channel  43.93 
 
 		 415 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4834  MscS mechanosensitive ion channel  41.53 
 
 		 421 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1821  MscS mechanosensitive ion channel  44.03 
 
 		 447 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.626552  decreased coverage  0.00243652 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0658  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family  43.93 
 
 		 415 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0471  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family  43.93 
 
 		 415 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0595  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  43.93 
 
 		 415 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.734376  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0736  transporter small conductance mechanosensitive ion channel  43.77 
 
 		 415 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4442  MscS mechanosensitive ion channel  42.78 
 
 		 420 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0121  small-conductance mechanosensitive channel  43.04 
 
 		 392 aa  325  1e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1064  MscS mechanosensitive ion channel  42.97 
 
 		 414 aa  322  6e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.734734 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0634  hypothetical protein  43.08 
 
 		 437 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0771  MscS Mechanosensitive ion channel  40.92 
 
 		 428 aa  320  3e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3295  MscS Mechanosensitive ion channel  42.06 
 
 		 424 aa  319  5e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1014  MscS Mechanosensitive ion channel  43.13 
 
 		 424 aa  319  5e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3951  MscS mechanosensitive ion channel  45.28 
 
 		 422 aa  317  3e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1692  MscS Mechanosensitive ion channel  42.97 
 
 		 403 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000105564 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4158  MscS mechanosensitive ion channel  41.51 
 
 		 419 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6004  MscS mechanosensitive ion channel  44.03 
 
 		 417 aa  306  4.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1048  MscS mechanosensitive ion channel  43.08 
 
 		 421 aa  306  5.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.23131 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1534  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  42.67 
 
 		 414 aa  306  6e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1729  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  42.67 
 
 		 414 aa  305  8.000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.454596  hitchhiker  0.0000587449 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1641  MscS mechanosensitive ion channel  42.67 
 
 		 414 aa  305  8.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4829  mechanosensitive ion channel  39.34 
 
 		 417 aa  299  6e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4057  MscS mechanosensitive ion channel  43.49 
 
 		 414 aa  295  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0774  MscS Mechanosensitive ion channel  41.62 
 
 		 428 aa  295  2e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03630  mechanosensitive ion channel  36.78 
 
 		 476 aa  294  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1739  MscS mechanosensitive ion channel  40.73 
 
 		 395 aa  291  2e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0321  MscS mechanosensitive ion channel  47.08 
 
 		 424 aa  289  9e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.870771  normal  0.0509238 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2323  mechanosensitive ion channel family protein  39.95 
 
 		 406 aa  285  1.0000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02197  hypothetical protein  34.83 
 
 		 490 aa  281  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0882  MscS mechanosensitive ion channel  39.08 
 
 		 420 aa  276  4e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10263  putative transmembrane transport protein  38.83 
 
 		 428 aa  261  2e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.109786  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2846  MscS mechanosensitive ion channel  35.58 
 
 		 419 aa  260  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.784545  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6222  MscS Mechanosensitive ion channel  34.74 
 
 		 404 aa  250  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1331  MscS mechanosensitive ion channel  29.81 
 
 		 541 aa  145  1e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.434406  hitchhiker  0.00000000000183262 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2594  MscS mechanosensitive ion channel  22.25 
 
 		 388 aa  66.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1529  MscS Mechanosensitive ion channel  28.93 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  22.37 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13183  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  23.81 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01752  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  26.92 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249612  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1737  mechanosensitive ion channel family protein  22.89 
 
 		 624 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0942  MscS Mechanosensitive ion channel  24.88 
 
 		 377 aa  57  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000347454  n/a   
 
 
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NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4521  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.958869 
 
 
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NC_009719  Plav_0883  MscS mechanosensitive ion channel  21.51 
 
 		 380 aa  56.2  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199191 
 
 
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NC_008347  Mmar10_0910  MscS mechanosensitive ion channel  20.61 
 
 		 400 aa  55.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505459  normal  0.0192096 
 
 
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NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  22.7 
 
 		 380 aa  53.9  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  26.85 
 
 		 414 aa  53.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
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NC_011149  SeAg_B1488  MscS family inner membrane protein YnaI  21.99 
 
 		 343 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.445516  n/a   
 
 
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NC_007520  Tcr_1295  MscS mechanosensitive ion channel  21.9 
 
 		 391 aa  52.8  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_1791  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  21.67 
 
 		 343 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011083  SeHA_C1848  MscS family hypothetical protein  22.14 
 
 		 343 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.512359  normal  1 
 
 
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