More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1115 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1115  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
162 aa  335  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0741755  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4310  heat shock protein Hsp20  55.15 
 
 
166 aa  178  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4550  heat shock protein Hsp20  55.15 
 
 
166 aa  178  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2118  heat shock protein Hsp20  51.83 
 
 
166 aa  175  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4118  heat shock protein Hsp20  53.33 
 
 
172 aa  169  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.513744 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4635  heat shock protein Hsp20  49.7 
 
 
169 aa  166  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5194  heat shock protein Hsp20  49.11 
 
 
169 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987038  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2940  heat shock protein Hsp20  50.6 
 
 
168 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2212  heat shock protein Hsp20  51.81 
 
 
171 aa  163  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2355  heat shock protein Hsp20  53.7 
 
 
165 aa  159  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3146  heat shock protein Hsp20  48.5 
 
 
167 aa  158  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.754957 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2462  heat shock protein Hsp20  46.47 
 
 
168 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0466294  normal  0.178308 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2802  heat shock protein Hsp20  49.09 
 
 
167 aa  157  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.20157 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0383  heat shock protein Hsp20  48.48 
 
 
166 aa  155  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170778  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3241  heat shock protein Hsp20  47.53 
 
 
166 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.406826  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3680  heat shock protein Hsp20  48.8 
 
 
185 aa  152  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.626967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3724  heat shock protein Hsp20  48.8 
 
 
185 aa  152  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2384  heat shock protein Hsp20  47.88 
 
 
164 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2074  heat shock protein Hsp20  44.44 
 
 
173 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.308358 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4461  heat shock protein Hsp20  43.79 
 
 
163 aa  131  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2132  heat shock protein Hsp20  42.17 
 
 
164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.585874 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4859  heat shock protein Hsp20  48.51 
 
 
204 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3903  heat shock protein Hsp20  50.75 
 
 
194 aa  120  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.534424 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1917  heat shock protein Hsp20  41.36 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86534  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3412  small HspC2 heat shock protein  40.88 
 
 
189 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.260583  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1171  heat shock protein Hsp20  40.88 
 
 
189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0629  heat shock protein Hsp20  40.25 
 
 
189 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.185609 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3394  heat shock protein Hsp20  39.13 
 
 
189 aa  106  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219016  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2287  heat shock protein Hsp20  37.78 
 
 
189 aa  105  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  39.44 
 
 
142 aa  104  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20170  heat shock protein Hsp20  40.38 
 
 
177 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.638214  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2860  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 
184 aa  101  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0389  heat shock protein Hsp20  35.93 
 
 
166 aa  99.8  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2276  heat shock protein Hsp20  41.1 
 
 
175 aa  99.4  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  39.86 
 
 
147 aa  98.6  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  39.86 
 
 
147 aa  98.2  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  41.48 
 
 
176 aa  96.3  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0924  heat shock protein  39.63 
 
 
180 aa  95.1  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3527  putative HspC2 heat shock protein  40 
 
 
173 aa  95.1  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0481  heat shock protein Hsp20  40.74 
 
 
150 aa  94  8e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.411475 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  42.65 
 
 
147 aa  93.6  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1366  heat shock protein Hsp20  36.16 
 
 
176 aa  92.8  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.74874  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4819  heat shock protein Hsp20  38.62 
 
 
146 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.414421 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4528  heat shock protein Hsp20  40.67 
 
 
181 aa  92.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.550609  normal  0.0462291 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4395  heat shock protein Hsp20  40.67 
 
 
181 aa  92.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481666  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0296  heat shock protein Hsp20  37.59 
 
 
156 aa  91.7  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  40.41 
 
 
146 aa  90.9  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  40.41 
 
 
146 aa  90.9  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1170  heat shock protein Hsp20  52.81 
 
 
170 aa  89.7  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6892  heat shock protein Hsp20  45.71 
 
 
157 aa  87.8  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25770  heat shock Hsp20 protein  38.15 
 
 
198 aa  87.8  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0445  heat shock protein Hsp20  36.94 
 
 
150 aa  87.4  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3234  HSP20 family protein  36.31 
 
 
231 aa  87.4  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2578  putative heat shock protein  43.81 
 
 
185 aa  87  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2857  heat shock protein Hsp20  40.69 
 
 
158 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.274432  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0833  heat shock protein Hsp20  51.58 
 
 
169 aa  86.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2836  heat shock protein Hsp20  33.97 
 
 
197 aa  86.7  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00556978  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3580  molecular chaperone (small heat shock protein)  32.31 
 
 
141 aa  85.9  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2657  heat shock protein Hsp20  38.69 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.498697  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2460  heat shock protein Hsp20  35.67 
 
 
186 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0031555  normal  0.623789 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3498  heat shock protein Hsp20  34.94 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2731  heat shock protein Hsp20  49.48 
 
 
166 aa  86.3  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3805  heat shock protein Hsp20  34.94 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.564168 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  41.3 
 
 
148 aa  85.5  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0463  heat shock protein Hsp20  39.87 
 
 
166 aa  85.1  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3882  heat shock protein Hsp20  37.31 
 
 
158 aa  84.7  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.545217  normal  0.180827 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5491  heat shock protein Hsp20  44.76 
 
 
211 aa  84.7  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710483  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0052  heat shock protein Hsp20  44.44 
 
 
151 aa  84.3  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.319643  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  40.74 
 
 
147 aa  84.3  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3468  heat shock protein Hsp20  38.51 
 
 
148 aa  84  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.282569  normal  0.556723 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2635  heat shock protein Hsp20  38.51 
 
 
148 aa  84  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0580  heat shock protein Hsp20  34.53 
 
 
145 aa  84  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000199173  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0037  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
142 aa  84  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0102  heat shock protein Hsp20  33.82 
 
 
142 aa  84  9e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5914  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
144 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0664313  normal  0.562292 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3905  heat shock protein Hsp20  38.97 
 
 
147 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000984381  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1543  heat shock protein Hsp20  38.93 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000494204  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3582  heat shock protein Hsp20  38.18 
 
 
166 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1921  heat shock protein Hsp20  44.04 
 
 
167 aa  82  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  38.64 
 
 
147 aa  82  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3788  heat shock protein Hsp20  32.45 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2078  heat shock protein Hsp20  34.75 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6104  heat shock protein Hsp20  39.29 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2559  hypothetical protein  34.97 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6187  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.306682 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3113  heat shock protein Hsp20  40.98 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.800815  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2122  heat shock protein Hsp20  32.67 
 
 
180 aa  80.9  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.451471 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2414  hypothetical protein  34.97 
 
 
164 aa  80.5  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  38.64 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0865  heat shock protein Hsp20  36.96 
 
 
134 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.303654  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4023  heat shock protein Hsp20  33.82 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4061  heat shock protein Hsp20  33.82 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0686  heat shock protein HSP20  39.81 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  38.93 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1018  heat shock protein Hsp20  40.12 
 
 
177 aa  79.7  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2600  putative heat shock protein Hsp20  41.9 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207676  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2049  heat shock protein Hsp20  38.64 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000140473  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  41.27 
 
 
149 aa  80.1  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4819  heat shock protein Hsp20  32.89 
 
 
218 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4128  heat shock protein Hsp20  33.09 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226976  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>