241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3244 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3244  peptidase M23B  100 
 
 		 211 aa  395  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.6882  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1203  peptidase M23B  56.3 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.609657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1314  peptidase M23B  52.83 
 
 		 164 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1528  Peptidase M23  52.63 
 
 		 139 aa  120  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0244521 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1973  peptidase M23B  48.12 
 
 		 161 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1992  peptidase M23B  48.12 
 
 		 161 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2038  peptidase M23B  48.12 
 
 		 161 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1366  peptidase M23B  49.18 
 
 		 173 aa  111  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0643294  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12905  hypothetical protein  47.59 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00765288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3582  peptidase M23B  50 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1859  peptidase, M23/M37 family  55.3 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.986198  hitchhiker  0.00477913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1160  peptidase M23B  54.2 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3992  Peptidase M23  54.62 
 
 		 175 aa  109  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2208  peptidase M23B  49.26 
 
 		 162 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0988  Peptidase M23  51.88 
 
 		 174 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  0.110335 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1543  peptidase M23B  47.01 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0675  hypothetical protein  52.24 
 
 		 362 aa  105  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4134  peptidase M23B  44.65 
 
 		 162 aa  101  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2508  Peptidase M23  52.63 
 
 		 191 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.326949 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09880  metalloendopeptidase-like membrane protein  49.63 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2103  Peptidase M23  48.2 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29214  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1657  Peptidase M23  44.79 
 
 		 169 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1383  Peptidase M23  42.57 
 
 		 193 aa  98.6  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000013113 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3114  Peptidase M23  53.03 
 
 		 170 aa  91.3  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00153698  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0950  peptidase, M23 family  36.64 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10110  metalloendopeptidase-like membrane protein  44.44 
 
 		 238 aa  90.9  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1003  Peptidase M23  40.87 
 
 		 170 aa  90.5  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.760596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1412  peptidase M23B  51.85 
 
 		 177 aa  89.4  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.21699 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1179  Peptidase M23  46.81 
 
 		 193 aa  89  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.949137  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0396  M23/M37 family membrane peptidase  38.93 
 
 		 195 aa  86.7  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00347919  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5912  Peptidase M23  44.14 
 
 		 331 aa  85.9  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00345275  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1483  Peptidase M23  45.11 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.22964  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11180  metalloendopeptidase-like membrane protein  40.13 
 
 		 271 aa  82  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00950153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  36.36 
 
 		 299 aa  62  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  34.55 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  37.27 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  35.45 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  36.36 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  34.55 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  36.36 
 
 		 299 aa  58.5  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  36.36 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  36.36 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  35.45 
 
 		 299 aa  58.5  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  37 
 
 		 299 aa  57  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0434  Peptidase M23  36.36 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000575635  unclonable  0.00000000000255737 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0408  peptidase M23B  36.36 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000502252  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0420  peptidase M23B  36.36 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0052215  unclonable  0.00000446989 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0409  peptidase M23B  36.36 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000277  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  33.33 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4455  M23/M37 peptidase domain-containing protein  29.36 
 
 		 298 aa  53.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  33.78 
 
 		 469 aa  53.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2708  Peptidase M23  33 
 
 		 455 aa  52.8  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  41.18 
 
 		 404 aa  52.4  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  32.86 
 
 		 284 aa  52  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  36.47 
 
 		 314 aa  50.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0826  Peptidase M23  36.36 
 
 		 281 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  40.78 
 
 		 270 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  39.05 
 
 		 423 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  33.96 
 
 		 292 aa  50.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  35.96 
 
 		 384 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  40.82 
 
 		 375 aa  50.8  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0798  Peptidase M23  36.36 
 
 		 281 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  31.19 
 
 		 480 aa  50.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  31.06 
 
 		 286 aa  50.1  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2376  peptidase M23B  38.95 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0194718  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  33.9 
 
 		 402 aa  49.3  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  36.79 
 
 		 482 aa  49.3  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  38.32 
 
 		 328 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  34.91 
 
 		 468 aa  49.3  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  31.2 
 
 		 300 aa  48.9  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1837  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  33.13 
 
 		 252 aa  48.5  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.396478  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  35.71 
 
 		 265 aa  48.5  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  34.23 
 
 		 301 aa  48.5  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3955  peptidase M23B  38.38 
 
 		 457 aa  48.5  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053083  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3617  peptidase M23B  38.38 
 
 		 457 aa  48.5  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0923859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  40.74 
 
 		 445 aa  48.1  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  37.86 
 
 		 317 aa  48.1  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1843  Peptidase M23  44 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000204635 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  36.36 
 
 		 482 aa  47.8  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.35 
 
 		 326 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  35.29 
 
 		 288 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  30.47 
 
 		 320 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  34.34 
 
 		 503 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  27.2 
 
 		 290 aa  47.4  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  35 
 
 		 334 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  34.34 
 
 		 475 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  31.25 
 
 		 295 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  31.25 
 
 		 295 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  39.29 
 
 		 271 aa  46.6  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  28.3 
 
 		 282 aa  46.6  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  35.56 
 
 		 269 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  31.31 
 
 		 517 aa  45.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1826  peptidase M23B  28.93 
 
 		 333 aa  46.2  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0261154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0299  peptidase M23B  30.39 
 
 		 249 aa  46.2  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000319427 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  30 
 
 		 283 aa  45.8  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  35.34 
 
 		 413 aa  45.8  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  30.1 
 
 		 312 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0305  peptidase M23  33.33 
 
 		 294 aa  45.8  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0127827  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  33.08 
 
 		 455 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  32 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>