196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1460 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1460  major facilitator transporter  100 
 
 		 393 aa  754    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3074  major facilitator superfamily protein  37.31 
 
 		 413 aa  195  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8490  major facilitator superfamily permease  36.68 
 
 		 396 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249724  normal  0.30566 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1083  major facilitator superfamily MFS_1  37.37 
 
 		 400 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8344  major facilitator superfamily MFS_1  34.6 
 
 		 412 aa  149  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  31.05 
 
 		 417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3369  major facilitator superfamily MFS_1  32.16 
 
 		 436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000736287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 385 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  30.12 
 
 		 397 aa  107  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 397 aa  104  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  30.29 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2952  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 		 379 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  28.44 
 
 		 378 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3782  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 383 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 387 aa  97.4  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 381 aa  97.1  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 		 413 aa  95.9  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 404 aa  95.1  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 386 aa  94.4  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  28.31 
 
 		 398 aa  93.2  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3589  transporter, putative  27.18 
 
 		 383 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3360  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 383 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0738289  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 385 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 		 392 aa  90.1  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3400  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 400 aa  90.1  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 385 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 385 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 		 387 aa  89  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 396 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 		 397 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 		 377 aa  88.2  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 384 aa  86.3  8e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 		 388 aa  86.3  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 392 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 403 aa  84  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6960  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 387 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0434  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 441 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1001  hypothetical protein  25.24 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.705543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  26.35 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0904  inner membrane protein YbjJ  25.24 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  26.03 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0940  inner membrane protein YbjJ  25.56 
 
 		 403 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0490  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 		 383 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1020  inner membrane protein YbjJ  25.24 
 
 		 403 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  26.03 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 388 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  25.71 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0503  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12450  Major Facilitator Superfamily transporter  28.86 
 
 		 428 aa  80.1  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0744182  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1528  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.441356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6301  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.801327 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 419 aa  79.7  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 		 396 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3060  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154269  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0972  inner membrane protein YbjJ  25.24 
 
 		 403 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.929819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0114  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 403 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4139  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 400 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.896136  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  28.74 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2797  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.569839  normal  0.408376 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 		 427 aa  77  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  26.43 
 
 		 447 aa  76.6  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  26.23 
 
 		 383 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5400  major facilitator superfamily permease  26.68 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  0.864795 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2534  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.441567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  24.53 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0565  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 443 aa  73.9  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.308939  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2714  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.773773  hitchhiker  0.00188089 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  25.19 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  26.5 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  27 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3581  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 		 435 aa  73.2  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0049  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 		 480 aa  72.8  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200181  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1885  putative integral membrane protein  27.99 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3724  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.830199  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0585  putative transport transmembrane protein  28.8 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4324  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 403 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  24.71 
 
 		 425 aa  72  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0704  integral membrane protein  26.14 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.64582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3571  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000688855  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  27.39 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1180  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.260259  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1100  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>