237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3535 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3535  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
684 aa  1367    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1537  putative PAS/PAC sensor protein  64.58 
 
 
636 aa  853    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0043  putative PAS/PAC sensor protein  32.14 
 
 
1216 aa  191  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 
873 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2128  putative PAS/PAC sensor protein  30.34 
 
 
1059 aa  180  5.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 
1045 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 
1195 aa  153  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.66 
 
 
700 aa  147  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4116  putative PAS/PAC sensor protein  31.33 
 
 
982 aa  147  5e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.147835  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3311  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.44 
 
 
1300 aa  146  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.703453  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0202  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.88 
 
 
1054 aa  145  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0920  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
655 aa  140  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.301008  decreased coverage  0.000022653 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 
642 aa  133  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 
529 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2725  diguanylate cyclase  39.05 
 
 
479 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.443683  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2916  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.52 
 
 
691 aa  118  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.8 
 
 
821 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 
921 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.627886  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 
778 aa  114  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.260825 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 
817 aa  114  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2062  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
951 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.275424  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1043  sensory box histidine kinase  33.2 
 
 
767 aa  112  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.382651  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1670  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 
632 aa  111  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1643  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.79 
 
 
633 aa  111  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.231435  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 
1042 aa  110  7.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.755924 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3007  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  42.98 
 
 
507 aa  109  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.738719  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0348  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  38.73 
 
 
700 aa  108  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4276  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
779 aa  107  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2827  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
1064 aa  107  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 
639 aa  105  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2147  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  32.96 
 
 
712 aa  105  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4345  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  43.14 
 
 
890 aa  104  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5665  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 
525 aa  104  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.98 
 
 
838 aa  103  8e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1012  putative PAS/PAC sensor protein  31.9 
 
 
1154 aa  103  9e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0819572  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.37 
 
 
758 aa  102  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2025  putative PAS/PAC sensor protein  42.86 
 
 
930 aa  102  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.76545  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
1383 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.36 
 
 
1088 aa  100  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1346  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35.94 
 
 
947 aa  99.8  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0683  putative PAS/PAC sensor protein  27.35 
 
 
750 aa  97.8  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987157  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.45 
 
 
1415 aa  97.4  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0428  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.12 
 
 
989 aa  97.4  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4262  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.26 
 
 
861 aa  95.9  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1716  PAS sensor protein  37.14 
 
 
327 aa  95.1  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00344833  decreased coverage  0.0000813906 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4988  putative PAS/PAC sensor protein  40.62 
 
 
866 aa  95.5  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.952168  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0098  putative PAS/PAC sensor protein  41.67 
 
 
865 aa  94.7  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0698116  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
1426 aa  94.4  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
875 aa  94.4  6e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2813  putative PAS/PAC sensor protein  31.17 
 
 
991 aa  94  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.69 
 
 
1431 aa  93.2  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4974  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  30.07 
 
 
877 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.07 
 
 
1478 aa  92  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
786 aa  91.3  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2009  putative PAS/PAC sensor protein  40.19 
 
 
932 aa  90.9  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240269  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.62 
 
 
1184 aa  89.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  26.4 
 
 
1427 aa  89.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3382  putative PAS/PAC sensor protein  28.96 
 
 
952 aa  89  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1252  putative PAS/PAC sensor protein  38.46 
 
 
730 aa  88.6  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0315  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 
672 aa  87.4  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 
1807 aa  86.7  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.869779  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  43.27 
 
 
685 aa  86.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 
889 aa  86.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0071  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.38 
 
 
697 aa  85.9  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5365  sensor histidine kinase  33.96 
 
 
672 aa  85.9  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00212715  hitchhiker  0.0000000443209 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3270  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 
796 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.498059 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5749  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.71 
 
 
562 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.718044  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0307  sensor histidine kinase (sporulation kinase), C-terminal region  32.08 
 
 
677 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0303  sensor histidine kinase; sporulation kinase  32.08 
 
 
677 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00332628  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5581  sensor histidine kinase  33.02 
 
 
672 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 
1267 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0947  putative PAS/PAC sensor protein  37.61 
 
 
956 aa  83.2  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.360212  normal  0.074138 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1274  PAS sensor protein  30.56 
 
 
429 aa  82.8  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
734 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.656612  hitchhiker  0.0000890263 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0367  sensor histidine kinase  31.13 
 
 
672 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0150  putative PAS/PAC sensor protein  31.31 
 
 
1969 aa  82  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0427  sensor histidine kinase, putative  30.19 
 
 
676 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0590994  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4237  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 
843 aa  80.1  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.28007  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0750  putative PAS/PAC sensor protein  38.61 
 
 
546 aa  80.5  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.0245877 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0128  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  31.31 
 
 
728 aa  79.3  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  27.66 
 
 
1589 aa  79.7  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0281  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  26.35 
 
 
836 aa  79.7  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0813035  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4080  putative PAS/PAC sensor protein  27.05 
 
 
1081 aa  79.3  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2976  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
732 aa  78.2  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.98148  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3482  putative PAS/PAC sensor protein  31.79 
 
 
994 aa  77.4  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 
1052 aa  75.9  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 
603 aa  76.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  27.33 
 
 
1065 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2150  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 
595 aa  74.3  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 
621 aa  73.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.68 
 
 
1419 aa  72  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 
618 aa  71.2  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0184  histidine kinase  24.78 
 
 
511 aa  70.9  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31584  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2933  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 
806 aa  70.1  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.907124  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  36.45 
 
 
377 aa  69.3  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1862  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.47 
 
 
869 aa  69.3  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.557725  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5113  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  30.46 
 
 
1071 aa  69.3  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00592248 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.68 
 
 
957 aa  68.6  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.22 
 
 
657 aa  67.4  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.514383  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.89 
 
 
759 aa  67  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>