More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3298 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_3298  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 257 aa  500  1e-140  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  84.82 
 
 		 257 aa  418  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2484  ABC-2 type transporter  66.29 
 
 		 263 aa  315  4e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0327  ABC-2 type transporter  63.98 
 
 		 251 aa  289  3e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.461338  normal  0.0259517 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2803  ABC-2 type transporter  62.45 
 
 		 252 aa  276  2e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  30.59 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  28.77 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  30.04 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  27.87 
 
 		 413 aa  76.3  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  27.5 
 
 		 360 aa  75.1  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  27.5 
 
 		 339 aa  74.3  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  27.5 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  26.91 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.63 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.7 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 278 aa  67  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  30.85 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  26.46 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  31.79 
 
 		 371 aa  65.9  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  26 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  26.07 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3044  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.375207 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.98 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  29.63 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.1 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1576  hypothetical protein  31.85 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4202  ABC-2 type transporter  28.71 
 
 		 258 aa  62  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 		 281 aa  62  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1448  ABC-2 type transporter  28.5 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0318973  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  26.13 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  31.82 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  25 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2615  ABC-2 type transporter  28.4 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.747872  hitchhiker  0.00151672 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1667  ABC-2 type transporter  27.32 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0141124  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  31.16 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  25.76 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.2 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1227  ABC-2 type transporter  26.4 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.52 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  24.55 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.34 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  26.75 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7430  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.38 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.21 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  27.07 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  28.08 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  28.99 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  26.03 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.61 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  26.88 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6512  ABC-2 type transporter  27.38 
 
 		 359 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  27.39 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  26.81 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2221  ABC-2 type transporter  29.89 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0188043 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.21 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  29.75 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  24.2 
 
 		 371 aa  56.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  29.8 
 
 		 374 aa  55.8  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3036  ABC-2 type transporter  26.92 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  29.11 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  26.57 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  25.37 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5656  ABC-2 type transporter  27.38 
 
 		 359 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6021  ABC-2 type transporter  27.38 
 
 		 359 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.679719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2645  ABC-2 type transporter  26.92 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  29.8 
 
 		 356 aa  55.8  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6131  ABC-2 type transporter  27.71 
 
 		 358 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862302  normal  0.0100987 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  24.28 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2468  ABC-2 type transporter  24.04 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  22.27 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  26.75 
 
 		 327 aa  55.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  25.51 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0243  hypothetical protein  30.19 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.021198  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  25.91 
 
 		 267 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2825  ABC-2 type transporter  28.39 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  18.27 
 
 		 388 aa  54.7  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  25.94 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1302  ABC-2 type transporter  27.15 
 
 		 372 aa  54.3  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  27.98 
 
 		 372 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  23.35 
 
 		 356 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  30.29 
 
 		 368 aa  53.5  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  24 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 		 304 aa  53.5  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.78 
 
 		 249 aa  53.9  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  25.39 
 
 		 375 aa  53.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  28.06 
 
 		 286 aa  52.8  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0800  hypothetical protein  21.7 
 
 		 251 aa  52.8  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.200073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 		 366 aa  52.8  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0827  putative transmembrane protein  26.58 
 
 		 251 aa  52.8  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0022  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 251 aa  52.8  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1781  ABC transporter, inner membrane subunit  27.81 
 
 		 365 aa  52.8  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  27.35 
 
 		 272 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  25.61 
 
 		 285 aa  52.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  35.82 
 
 		 367 aa  52.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>