86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3429 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3429  hypothetical protein  100 
 
 		 802 aa  1570    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2219  GTPase  52.77 
 
 		 673 aa  598  1e-169  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2559  putative ABC transporter  46.28 
 
 		 542 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7361  putative ABC transporter  44.4 
 
 		 547 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1326  hypothetical protein  43.2 
 
 		 568 aa  362  2e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1519  putative ABC transporter  38.86 
 
 		 525 aa  275  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1571  putative ABC transporter  39.44 
 
 		 525 aa  274  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1548  putative ABC transporter  39.44 
 
 		 525 aa  274  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  40.87 
 
 		 539 aa  268  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1367  putative ABC transporter  41.75 
 
 		 555 aa  264  4.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8870  putative ABC transporter  35.74 
 
 		 590 aa  260  7e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0939636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0080  GTP-binding protein HSR1-related protein  43.5 
 
 		 532 aa  252  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170633  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24690  GTPase of unknown function  42.44 
 
 		 539 aa  246  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6041  normal  0.0378138 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  40.93 
 
 		 537 aa  241  5e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2640  GTP-binding protein HSR1-related protein  42.76 
 
 		 550 aa  239  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133942  normal  0.721182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6775  putative ABC transporter  35.21 
 
 		 589 aa  225  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08880  predicted GTPase  37.08 
 
 		 564 aa  221  3.9999999999999997e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.0562111 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1091  putative ABC transporter  37.81 
 
 		 585 aa  221  5e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.631509  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  50.2 
 
 		 524 aa  211  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  39.33 
 
 		 542 aa  211  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3265  putative ABC transporter  49.17 
 
 		 532 aa  203  9e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2644  ATP-binding membrane protein  48.19 
 
 		 453 aa  201  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08700  hypothetical protein  35.12 
 
 		 586 aa  191  4e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0929  hypothetical protein  41.25 
 
 		 518 aa  191  5.999999999999999e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1087  putative ABC transporter  45.6 
 
 		 523 aa  190  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0151577  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24730  predicted GTPase  48.46 
 
 		 517 aa  188  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0664672  normal  0.0671171 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0933  hypothetical protein  31.93 
 
 		 578 aa  179  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24310  hypothetical protein  36.34 
 
 		 568 aa  177  8e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  44.49 
 
 		 552 aa  176  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2260  putative ABC transporter  35.08 
 
 		 571 aa  78.2  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000139745 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1394  hypothetical protein  29.67 
 
 		 543 aa  77.4  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  33.61 
 
 		 566 aa  74.3  0.000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  31.47 
 
 		 619 aa  73.9  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  31.58 
 
 		 564 aa  72  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1324  hypothetical protein  32.22 
 
 		 569 aa  71.2  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  28.62 
 
 		 687 aa  69.3  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24740  hypothetical protein  33.9 
 
 		 551 aa  69.3  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.043803  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  33.19 
 
 		 571 aa  68.6  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3430  putative ABC transporter  34.87 
 
 		 631 aa  68.6  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790282  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1353  putative ABC transporter  30.5 
 
 		 667 aa  67.4  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00435841  hitchhiker  0.000139423 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  33.93 
 
 		 551 aa  66.2  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2641  putative ABC transporter  32.44 
 
 		 669 aa  66.6  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.779452 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  31.98 
 
 		 540 aa  65.9  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  32.2 
 
 		 602 aa  62.8  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  32.34 
 
 		 584 aa  61.2  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  32.73 
 
 		 566 aa  59.7  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0932  hypothetical protein  28.57 
 
 		 650 aa  57.8  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2645  putative transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 526 aa  55.5  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  25.44 
 
 		 546 aa  53.9  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  28.32 
 
 		 291 aa  53.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3997  hypothetical protein  25.65 
 
 		 642 aa  52.4  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0079  putative ABC transporter  33.51 
 
 		 565 aa  52  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.459634  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  28.57 
 
 		 440 aa  52.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  24.88 
 
 		 674 aa  52  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0298  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  26.83 
 
 		 235 aa  51.2  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0965  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  27.09 
 
 		 267 aa  50.8  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1736  putative ABC transporter  35.83 
 
 		 556 aa  50.1  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1024  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  27.09 
 
 		 267 aa  50.8  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  26.74 
 
 		 1164 aa  50.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1366  putative ABC transporter  33.55 
 
 		 572 aa  50.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  28.98 
 
 		 548 aa  49.7  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3738  hypothetical protein  31.62 
 
 		 618 aa  49.7  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  25.12 
 
 		 585 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  27.22 
 
 		 564 aa  47.8  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1572  putative ABC transporter  38.46 
 
 		 586 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  28.26 
 
 		 566 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1549  putative ABC transporter  38.46 
 
 		 586 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1520  putative ABC transporter  38.46 
 
 		 576 aa  47.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1360  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  25.62 
 
 		 241 aa  46.2  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.225445  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1990  putative GTP-binding protein  28.64 
 
 		 414 aa  46.6  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.0213321 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0280  GTP-binding protein Era  26.73 
 
 		 301 aa  45.8  0.003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0082  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.21 
 
 		 358 aa  46.2  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02571  putative GTP-binding protein, transport associated  28.19 
 
 		 558 aa  45.8  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0816  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  26.11 
 
 		 216 aa  45.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.720609  normal  0.865249 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5013  GTP-binding proten HflX  26.8 
 
 		 404 aa  45.4  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0596854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0639  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  26.87 
 
 		 214 aa  45.4  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.390142  normal  0.33789 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1221  hypothetical protein  30.33 
 
 		 417 aa  45.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00041238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2602  GTP-binding protein, HSR1-related  29.7 
 
 		 386 aa  45.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415025  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3240  hypothetical protein  25.78 
 
 		 537 aa  45.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41085  normal  0.440891 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1090  hypothetical protein  31.68 
 
 		 737 aa  45.1  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0361  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  24.27 
 
 		 217 aa  45.1  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0360198  normal  0.388953 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  24.73 
 
 		 585 aa  44.7  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3402  putative GTPase  27.57 
 
 		 294 aa  44.7  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4797  putative GTPase  27.57 
 
 		 294 aa  44.7  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1104  GTP-binding protein HflX  25.59 
 
 		 458 aa  44.3  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  24.17 
 
 		 615 aa  44.3  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>