148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1713 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1713  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 432 aa  803    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300423  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2492  major facilitator transporter  53.63 
 
 		 438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0783563  normal  0.106757 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3828  major facilitator transporter  50.62 
 
 		 421 aa  312  5.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1147  major facilitator superfamily MFS_1  48.51 
 
 		 436 aa  300  4e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114141  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4264  major facilitator transporter  53.55 
 
 		 420 aa  296  4e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0538931  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31240  putative nrbE-like protein  49.14 
 
 		 436 aa  295  7e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011963  unclonable  4.15969e-22 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2242  major facilitator superfamily MFS_1  53.31 
 
 		 444 aa  294  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.370083  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5159  major facilitator transporter  47.5 
 
 		 434 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5611  major facilitator transporter  49.05 
 
 		 440 aa  285  8e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4728  major facilitator superfamily MFS_1  51.67 
 
 		 444 aa  279  6e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.632201 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1582  MFS Ni2+ efflux pump NreB  47.44 
 
 		 440 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0336  major facilitator transporter  44.85 
 
 		 441 aa  273  6e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5140  major facilitator superfamily MFS_1  49.62 
 
 		 439 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0730511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1768  major facilitator transporter  47.44 
 
 		 440 aa  270  4e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4285  major facilitator superfamily MFS_1  54.62 
 
 		 444 aa  264  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181984  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2968  major facilitator transporter  47.57 
 
 		 442 aa  260  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.433406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3139  major facilitator superfamily MFS_1  48.76 
 
 		 453 aa  258  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6144  MFS family nickel efflux transporter protein NreB  48.07 
 
 		 408 aa  256  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0895  major facilitator superfamily MFS_1  51.1 
 
 		 457 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3358  major facilitator superfamily MFS_1  46.96 
 
 		 456 aa  247  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3189  major facilitator transporter  46.51 
 
 		 442 aa  247  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704959 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1884  major facilitator superfamily MFS_1  51.63 
 
 		 444 aa  239  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3044  major facilitator transporter  39.23 
 
 		 464 aa  200  3.9999999999999996e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3464  hypothetical protein  38.65 
 
 		 394 aa  187  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.269124  normal  0.0966327 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2363  putative NreB protein  42.96 
 
 		 307 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.602638  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0479  major facilitator superfamily MFS_1  32.59 
 
 		 427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.742618 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  33.19 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 429 aa  63.2  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  24.65 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1278  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 		 450 aa  58.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  29.43 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  30.04 
 
 		 448 aa  56.6  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  21.86 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  27.69 
 
 		 408 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  28.62 
 
 		 445 aa  54.7  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  26.76 
 
 		 405 aa  55.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 426 aa  54.7  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  25 
 
 		 405 aa  54.3  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  25.74 
 
 		 408 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1016  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 393 aa  53.9  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.807332  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  19.66 
 
 		 423 aa  53.9  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  28.57 
 
 		 414 aa  53.5  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 		 432 aa  53.5  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2780  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 		 423 aa  53.5  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.018642 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2756  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 420 aa  53.5  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.366084  normal  0.663227 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  19.32 
 
 		 404 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  25.25 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  25.25 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 499 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 448 aa  52.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  19.52 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  19.32 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 434 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  19.52 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 450 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 		 431 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  28.16 
 
 		 413 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  32.59 
 
 		 449 aa  50.8  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  19.02 
 
 		 404 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 428 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  24.49 
 
 		 408 aa  50.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  21.59 
 
 		 397 aa  50.4  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  24.87 
 
 		 408 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 415 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 423 aa  50.1  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0387  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 416 aa  50.1  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  24.6 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42320  major facilitator transpoter  32.62 
 
 		 535 aa  49.7  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.956299  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 524 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  24.75 
 
 		 408 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4415  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 449 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  23.59 
 
 		 474 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 413 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  23.32 
 
 		 439 aa  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1155  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 		 399 aa  47.8  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.128986 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4127  major facilitator superfamily protein  25.5 
 
 		 415 aa  47.8  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 		 407 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2261  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 		 399 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0224254  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  21.24 
 
 		 441 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  23.79 
 
 		 407 aa  47.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  22.18 
 
 		 441 aa  47.4  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  22.64 
 
 		 406 aa  47  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  22.65 
 
 		 446 aa  47  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 457 aa  47  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2678  MFS family major facilitator transporter  28.07 
 
 		 410 aa  47  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  29.79 
 
 		 431 aa  47  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3075  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 423 aa  46.6  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 413 aa  46.6  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  20.51 
 
 		 1833 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  24.46 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 446 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 		 418 aa  46.6  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2432  permease  26.32 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0771594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2393  permease; macrolide-efflux protein  26.32 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.366369  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2649  permease  26.32 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.765576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>