140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3831 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3831  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
398 aa  715    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.135932  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6167  major facilitator superfamily MFS_1  36.13 
 
 
410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.041316  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5224  major facilitator superfamily transporter  37.56 
 
 
408 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.469666  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1566  major facilitator superfamily MFS_1  37.46 
 
 
414 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1534  major facilitator transporter  35.46 
 
 
423 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1369  major facilitator superfamily transporter  34.53 
 
 
361 aa  125  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4197  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 
413 aa  125  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256507  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30120  Major Facilitator Superfamily transporter  34.44 
 
 
423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31350  Major Facilitator Superfamily transporter  35.17 
 
 
421 aa  109  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0590  major facilitator superfamily MFS_1  32.67 
 
 
416 aa  102  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3828  major facilitator superfamily MFS_1  36.8 
 
 
378 aa  99.4  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48828  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1190  major facilitator transporter  27.2 
 
 
389 aa  78.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  28.86 
 
 
414 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3232  major facilitator transporter  29.15 
 
 
397 aa  72  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3364  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30 
 
 
407 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0557826  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3159  mutlidrug resistance protein, putative  28.57 
 
 
414 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00434761  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3025  major facilitator transporter  29.22 
 
 
409 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121662  normal  0.170467 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1336  major facilitator transporter  28.11 
 
 
389 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4729  major facilitator transporter  30.12 
 
 
403 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4815  major facilitator superfamily transporter  30.12 
 
 
403 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5114  major facilitator transporter  30.12 
 
 
403 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0089  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 
408 aa  64.3  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  28.35 
 
 
410 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  28.35 
 
 
410 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19580  arabinose efflux permease family protein  29.52 
 
 
530 aa  63.2  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557425  normal  0.0603451 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2895  major facilitator transporter  28.76 
 
 
435 aa  63.2  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0026  major facilitator transporter  32.2 
 
 
379 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.371223  normal  0.0147554 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1662  major facilitator transporter  29.61 
 
 
395 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195999  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0303  major facilitator superfamily MFS_1  34.59 
 
 
394 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189721  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0276  major facilitator superfamily MFS_1  36.09 
 
 
387 aa  59.7  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4134  major facilitator transporter  29.36 
 
 
415 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4285  major facilitator transporter  26.85 
 
 
410 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0309  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 
412 aa  57.4  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.104359 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  37.8 
 
 
414 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  37.01 
 
 
414 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5888  major facilitator transporter  28.9 
 
 
401 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3379  major facilitator superfamily MFS_1  33.73 
 
 
415 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230728  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3199  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 
432 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20260  major facilitator superfamily MFS 1  28.32 
 
 
402 aa  54.3  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.259749  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  21.8 
 
 
438 aa  53.5  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  22.12 
 
 
407 aa  52.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  27.23 
 
 
410 aa  52.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  36.59 
 
 
421 aa  52.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0537  major facilitator transporter  42.47 
 
 
395 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582222  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 
395 aa  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0250  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 
400 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.254389  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3094  major facilitator family transporter  41.1 
 
 
385 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.948927  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  22.12 
 
 
407 aa  50.8  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0780  major facilitator family transporter  41.1 
 
 
490 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.114821  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0499  major facilitator family transporter  41.1 
 
 
478 aa  50.8  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.788244  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0062  major facilitator family transporter  41.1 
 
 
395 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.906812  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1528  major facilitator family transporter  41.1 
 
 
395 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0595  major facilitator family transporter  41.1 
 
 
385 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0610  major facilitator family transporter  41.1 
 
 
385 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2956  major facilitator family transporter  41.1 
 
 
385 aa  50.8  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  30.22 
 
 
432 aa  50.4  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5329  major facilitator superfamily transporter  31.02 
 
 
398 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 
397 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2121  major facilitator transporter  25.75 
 
 
435 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2164  major facilitator transporter  41.43 
 
 
395 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2778  major facilitator transporter  41.43 
 
 
395 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2789  major facilitator transporter  41.43 
 
 
385 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0637  major facilitator family transporter  36 
 
 
400 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2838  major facilitator transporter  41.43 
 
 
395 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298937  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3142  major facilitator family transporter  36 
 
 
397 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.409466  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2696  major facilitator transporter  41.43 
 
 
385 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.236302 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0786  major facilitator superfamily MFS_1  36 
 
 
400 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2740  major facilitator superfamily MFS_1  36 
 
 
397 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.129461  hitchhiker  0.0000000221992 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0421  putative multidrug-efflux transporter transmembrane protein  29.6 
 
 
387 aa  48.9  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107977  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0482  major facilitator transporter  29.96 
 
 
407 aa  48.9  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  32.52 
 
 
406 aa  48.5  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1450  major facilitator transporter  28.67 
 
 
400 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0010  multidrug-efflux transporter  27.91 
 
 
430 aa  47.8  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6572  major facilitator transporter  41.43 
 
 
395 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2563  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 
412 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000522079 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0420  major facilitator superfamily MFS_1  36.56 
 
 
460 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6108  major facilitator transporter  41.43 
 
 
395 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1301  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 
377 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3308  major facilitator superfamily MFS_1  37.78 
 
 
401 aa  47.4  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0575835  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  32.38 
 
 
403 aa  47  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0818  major facilitator transporter  39.62 
 
 
429 aa  47  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2768  major facilitator transporter  33.33 
 
 
399 aa  46.6  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  36.64 
 
 
405 aa  46.6  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02584  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G01180)  33.68 
 
 
524 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  33.33 
 
 
437 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3532  major facilitator superfamily MFS_1  34.92 
 
 
404 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0340  major facilitator transporter  38.36 
 
 
385 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03594  multidrug efflux system protein  31.18 
 
 
391 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4257  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 
391 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001081  multidrug resistance protein D  33.33 
 
 
394 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  27.94 
 
 
471 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0900  sugar transporter  30.91 
 
 
518 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1277  major facilitator superfamily transporter  33.14 
 
 
433 aa  45.1  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0421  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 
381 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000714938  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 
451 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 
398 aa  45.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3924  multidrug efflux system protein MdtL  31.18 
 
 
391 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4219  multidrug efflux system protein MdtL  31.18 
 
 
391 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4284  multidrug efflux system protein MdtL  31.18 
 
 
391 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4077  multidrug efflux system protein MdtL  31.18 
 
 
391 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>