More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0786 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0786  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 400 aa  777    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3142  major facilitator family transporter  98.99 
 
 		 397 aa  759    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.409466  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2740  major facilitator superfamily MFS_1  99.24 
 
 		 397 aa  761    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.129461  hitchhiker  0.0000000221992 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0637  major facilitator family transporter  100 
 
 		 400 aa  777    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4519  major facilitator transporter  42.7 
 
 		 464 aa  266  5e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal  0.140313 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0655  major facilitator family transporter  42.98 
 
 		 464 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  41.41 
 
 		 457 aa  255  8e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0496  inner membrane transport protein YajR  40.85 
 
 		 454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5050  general substrate transporter  40.33 
 
 		 465 aa  254  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0475  inner membrane transport protein YajR  41.27 
 
 		 454 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0538  inner membrane transport protein YajR  41.01 
 
 		 454 aa  252  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0483  inner membrane transport protein YajR  41.01 
 
 		 454 aa  252  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0477  inner membrane transport protein YajR  40.74 
 
 		 454 aa  252  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2294  major facilitator family transporter  43.82 
 
 		 458 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0484  major facilitator family transporter  42.75 
 
 		 464 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0517  major facilitator transporter  42.51 
 
 		 464 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0921044 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  38.42 
 
 		 462 aa  249  8e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00375  predicted transporter  39.78 
 
 		 454 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0894  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 453 aa  248  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0463  major facilitator transporter  39.78 
 
 		 454 aa  248  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4719  major facilitator transporter  41.87 
 
 		 464 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.210959 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00379  hypothetical protein  39.78 
 
 		 454 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0499  major facilitator transporter  39.78 
 
 		 454 aa  248  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0459  major facilitator transporter  39.78 
 
 		 454 aa  248  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0513  major facilitator transporter  42.27 
 
 		 464 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3182  major facilitator superfamily MFS_1  39.51 
 
 		 454 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.565255  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0511  transporter, major facilitator family  39.51 
 
 		 454 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.905004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3206  major facilitator transporter  39.51 
 
 		 454 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000090157 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0349  transporter, major facilitator family  39.51 
 
 		 454 aa  246  6e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06530  major facilitator family transporter  42.42 
 
 		 462 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0804742  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2691  major facilitator family transporter  43.16 
 
 		 454 aa  243  5e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0232907  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3390  major facilitator transporter  38.27 
 
 		 455 aa  240  2.9999999999999997e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  39.19 
 
 		 454 aa  236  4e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2425  major facilitator transporter  37.24 
 
 		 458 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3066  major facilitator transporter  36.97 
 
 		 456 aa  236  7e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3246  major facilitator transporter  36.97 
 
 		 454 aa  236  7e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3103  major facilitator transporter  36.97 
 
 		 454 aa  236  7e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.973708  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3274  major facilitator superfamily MFS_1  38.92 
 
 		 454 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2887  major facilitator superfamily MFS_1  39.78 
 
 		 455 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09195  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 462 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0308711  normal  0.679663 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0867  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 454 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551059  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3877  major facilitator transporter  42.78 
 
 		 464 aa  231  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1085  major facilitator transporter  39.77 
 
 		 454 aa  232  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2141  major facilitator superfamily MFS_1  41.79 
 
 		 462 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.154122 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  39.47 
 
 		 472 aa  227  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0422  hypothetical protein  36.45 
 
 		 455 aa  226  4e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0398  hypothetical protein  35.96 
 
 		 455 aa  226  4e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0482  major facilitator transporter  41.1 
 
 		 407 aa  225  9e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0421  putative multidrug-efflux transporter transmembrane protein  40.37 
 
 		 387 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107977  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0371  major facilitator family transporter  37.53 
 
 		 458 aa  222  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000034034  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1822  transporter, MFS superfamily  37.53 
 
 		 458 aa  221  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000342182  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0995  DNA polymerase III, alpha subunit  39.19 
 
 		 471 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000812271  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0922  major facilitator family transporter  35.38 
 
 		 454 aa  220  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2228  major facilitator transporter  36.44 
 
 		 461 aa  216  4e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.568651  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0276  major facilitator superfamily MFS_1  40.91 
 
 		 387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0271  major facilitator transporter  36.31 
 
 		 469 aa  213  3.9999999999999995e-54  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  decreased coverage  0.00524997  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0449  major facilitator transporter  41.82 
 
 		 460 aa  212  7e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.780134  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2164  major facilitator transporter  37.77 
 
 		 395 aa  212  9e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2778  major facilitator transporter  37.77 
 
 		 395 aa  212  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0747  major facilitator superfamily transporter  40.43 
 
 		 456 aa  212  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.726619  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2789  major facilitator transporter  37.77 
 
 		 385 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36999 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4029  transporter, putative  37.74 
 
 		 455 aa  210  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3711  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 455 aa  210  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000134514  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0303  major facilitator superfamily MFS_1  40.64 
 
 		 394 aa  210  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0515  transporter, putative  37.63 
 
 		 455 aa  209  5e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.97153  normal  0.615177 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2838  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 395 aa  209  7e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298937  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2696  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 385 aa  209  9e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.236302 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6108  major facilitator transporter  37.43 
 
 		 395 aa  208  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1684  sugar efflux MFS family transporter  37.33 
 
 		 454 aa  206  5e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6572  major facilitator transporter  37.14 
 
 		 395 aa  206  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1959  major facilitator transporter  35.85 
 
 		 454 aa  205  1e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00498964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0639  major facilitator transporter  35.69 
 
 		 455 aa  205  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00996628  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3308  major facilitator superfamily MFS_1  40.11 
 
 		 401 aa  204  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0575835  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3773  major facilitator transporter  39.48 
 
 		 416 aa  204  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3591  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 455 aa  204  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000319402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0340  major facilitator transporter  36.49 
 
 		 385 aa  203  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0570  major facilitator transporter  37.77 
 
 		 455 aa  203  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000142598  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0580  major facilitator transporter  35.97 
 
 		 455 aa  203  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000944901  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0555  major facilitator transporter  35.97 
 
 		 455 aa  203  5e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000065492  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0586  major facilitator superfamily MFS_1  35.97 
 
 		 455 aa  203  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000030167  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3754  major facilitator transporter  35.97 
 
 		 455 aa  203  5e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000139158  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0437  major facilitator transporter  37.46 
 
 		 453 aa  202  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.630168 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3410  major facilitator superfamily MFS_1  41.09 
 
 		 393 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.357174  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0639  major facilitator transporter  36.24 
 
 		 455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000191567  hitchhiker  0.0000048698 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0314  major facilitator transporter  37.35 
 
 		 418 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4248  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 452 aa  200  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.718043  unclonable  0.0000000000020202 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0818  major facilitator transporter  38.86 
 
 		 429 aa  199  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3420  major facilitator transporter  36.24 
 
 		 455 aa  199  6e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000601324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0532  major facilitator transporter  36.24 
 
 		 455 aa  199  9e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000851019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0537  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 395 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4026  major facilitator transporter  36.78 
 
 		 455 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000155639  hitchhiker  0.000000003027 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3314  major facilitator transporter  35.77 
 
 		 455 aa  197  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000092062  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0610  major facilitator superfamily MFS_1  36.68 
 
 		 395 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495333  normal  0.0469856 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4065  major facilitator superfamily transporter  41.09 
 
 		 393 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2747  major facilitator transporter  39.94 
 
 		 406 aa  194  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0499  major facilitator family transporter  37.9 
 
 		 478 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.788244  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4107  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  36.59 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1993  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 454 aa  191  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000256386  decreased coverage  0.0000979309 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0610  major facilitator family transporter  37.61 
 
 		 385 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3094  major facilitator family transporter  37.61 
 
 		 385 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.948927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>