More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3130 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3130  Ribonuclease H  100 
 
 		 244 aa  482  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00152106  normal  0.115536 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1405  Ribonuclease H  56.89 
 
 		 262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1476  Ribonuclease H  54.2 
 
 		 279 aa  196  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.11636  normal  0.0427628 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0991  Ribonuclease H  48.91 
 
 		 303 aa  192  6e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000212387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1173  Ribonuclease H  52.19 
 
 		 272 aa  187  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23690  ribonuclease HII  52.84 
 
 		 246 aa  185  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.777056  normal  0.21875 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2216  ribonuclease HII  48.95 
 
 		 260 aa  185  7e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000227744 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2534  Ribonuclease H  58.74 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.972855  normal  0.308126 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2476  ribonuclease HII  49.13 
 
 		 221 aa  179  4.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0918976  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11120  ribonuclease HII  52.63 
 
 		 252 aa  159  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0695158  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2145  ribonuclease HII  42.31 
 
 		 231 aa  155  6e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0734757  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9289  Ribonuclease H  43.05 
 
 		 222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3319  Ribonuclease H  39.73 
 
 		 232 aa  142  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.199835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10050  ribonuclease HII  44.59 
 
 		 272 aa  140  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1973  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0350  ribonuclease HII  39.83 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  33.03 
 
 		 242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1591  Ribonuclease H  38.36 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000306759  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  39.23 
 
 		 201 aa  128  8.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  37.1 
 
 		 218 aa  126  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  36.07 
 
 		 204 aa  125  8.000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  36.65 
 
 		 308 aa  125  9e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  38.16 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  37.33 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  37.38 
 
 		 198 aa  123  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  35.84 
 
 		 198 aa  121  8e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2705  ribonuclease H  39.57 
 
 		 253 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1791  Ribonuclease H  39.09 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  38.67 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  35.71 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  32.54 
 
 		 203 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07010  ribonuclease HII  37.39 
 
 		 262 aa  119  3e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000706526  normal  0.43338 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  39.13 
 
 		 199 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  37.2 
 
 		 248 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  37.39 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  37.68 
 
 		 217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  36.23 
 
 		 248 aa  119  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  37.33 
 
 		 240 aa  118  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  37.2 
 
 		 217 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  31.53 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  37.2 
 
 		 214 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  37.2 
 
 		 214 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0628  ribonuclease H  34.39 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  35.75 
 
 		 249 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  36.53 
 
 		 268 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  37.2 
 
 		 214 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  38.16 
 
 		 209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2478  ribonuclease HII  37.2 
 
 		 214 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0544675  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1541  ribonuclease HII  37.2 
 
 		 214 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0283248  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  33.18 
 
 		 277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  37.2 
 
 		 214 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1313  ribonuclease HII  37.2 
 
 		 214 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00162066  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  35.24 
 
 		 206 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3270  ribonuclease HII  37.2 
 
 		 214 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737319  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  36.21 
 
 		 227 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  34.96 
 
 		 208 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2041  ribonuclease HII  37.2 
 
 		 214 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00230414  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  36.07 
 
 		 212 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  36.07 
 
 		 212 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  33.82 
 
 		 202 aa  115  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  33.82 
 
 		 202 aa  115  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  33.03 
 
 		 255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  37.1 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  39.13 
 
 		 240 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  33.62 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  33.33 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  36.89 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09220  ribonuclease HII  42.92 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.224581  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2568  ribonuclease HII  37.2 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.446358  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2422  ribonuclease HII  37.2 
 
 		 214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000428257  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  31.96 
 
 		 211 aa  113  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1022  ribonuclease HII  34.63 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.663325  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  38.65 
 
 		 209 aa  113  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  35 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  38.65 
 
 		 209 aa  113  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  31.86 
 
 		 198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2041  ribonuclease HII  36.71 
 
 		 214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000010241  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  37.5 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  31.96 
 
 		 211 aa  112  6e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1623  ribonuclease HII  40.17 
 
 		 224 aa  112  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.237213 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  34.39 
 
 		 230 aa  112  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  37.02 
 
 		 191 aa  112  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  36.1 
 
 		 283 aa  111  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1368  Ribonuclease H  36.61 
 
 		 216 aa  111  9e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  34.55 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  37.62 
 
 		 232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1966  ribonuclease HII  39.61 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138669  normal  0.413568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1519  Ribonuclease H  38.99 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238626  hitchhiker  0.0075916 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  36.89 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  33.33 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  38.65 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  33.18 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  34.84 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  34.32 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  35.93 
 
 		 224 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  37.14 
 
 		 232 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0342  ribonuclease HII  33.02 
 
 		 184 aa  110  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0247134  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0542  ribonuclease HII, putative  29.72 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.597529  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0976  ribonuclease H  36.99 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  32.87 
 
 		 221 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  36.36 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0977063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>