200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0798 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0798  outer membrane efflux protein  100 
 
 
436 aa  888    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.98637  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0823  Outer membrane efflux protein  26.94 
 
 
432 aa  130  6e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0383439  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1020  putative outer membrane protein TolC  26.49 
 
 
423 aa  125  1e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.808388  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.31 
 
 
464 aa  125  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_002978  WD0068  outer membrane protein TolC, putative  26.38 
 
 
407 aa  120  6e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.896077  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.54 
 
 
494 aa  100  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.56 
 
 
480 aa  99.8  9e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1798  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.26 
 
 
538 aa  99.4  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99988  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.11 
 
 
478 aa  99.4  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.57 
 
 
522 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.56 
 
 
456 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1907  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.74 
 
 
472 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3004  putative outer TolC membrane protein  21.96 
 
 
469 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.833992 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1434  type I secretion outer membrane protein, TolC  24.43 
 
 
490 aa  91.3  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.44207  normal  0.675589 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.17 
 
 
463 aa  90.5  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.75 
 
 
489 aa  89.7  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.73 
 
 
497 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001579  agglutination protein  26.09 
 
 
437 aa  89  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582339  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  20.73 
 
 
488 aa  89  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.59 
 
 
463 aa  87.4  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2894  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.22 
 
 
460 aa  87.8  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386257  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2013  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.55 
 
 
472 aa  87  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226354  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0652  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.4 
 
 
428 aa  87  6e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000458305  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  23.26 
 
 
452 aa  86.7  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  22.26 
 
 
472 aa  85.9  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  20.89 
 
 
461 aa  85.9  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.31 
 
 
518 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  22.92 
 
 
456 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5239  type I secretion outer membrane protein, TolC family  20.43 
 
 
488 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.19 
 
 
487 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1003  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.24 
 
 
462 aa  84.3  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0381  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24 
 
 
445 aa  84.3  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230254  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.18 
 
 
464 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.19 
 
 
463 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0744  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.28 
 
 
449 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.291612  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2262  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.86 
 
 
497 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148702  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.42 
 
 
553 aa  80.1  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2583  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.1 
 
 
497 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  23.21 
 
 
436 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.64 
 
 
497 aa  78.2  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1978  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.49 
 
 
456 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143142  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0186  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.95 
 
 
485 aa  77.4  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1569  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.33 
 
 
461 aa  76.6  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.151598  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.96 
 
 
455 aa  75.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.34 
 
 
489 aa  75.5  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3231  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.05 
 
 
483 aa  75.1  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3453  putative tolC outer membrane protein  21.07 
 
 
438 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  23.71 
 
 
436 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3985  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.03 
 
 
473 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3908  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.03 
 
 
473 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4320  agglutination protein  25.89 
 
 
471 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.71 
 
 
472 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3257  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.32 
 
 
462 aa  70.1  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.30122  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1345  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.82 
 
 
455 aa  70.1  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4007  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.4 
 
 
472 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0433  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  23.1 
 
 
469 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462048  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1746  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.66 
 
 
446 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4205  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.94 
 
 
431 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  26.1 
 
 
738 aa  68.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20050  putative outer membrane protein  25.31 
 
 
451 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.7908  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003406  agglutination protein  24.01 
 
 
423 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  26.05 
 
 
469 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4008  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.13 
 
 
562 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0381  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.24 
 
 
471 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3645  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.24 
 
 
471 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48090  alkaline protease secretion outer membrane protein AprF precursor  21.94 
 
 
481 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0152412 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0379  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.92 
 
 
471 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0685  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.71 
 
 
405 aa  67.8  0.0000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000118649  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1878  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.37 
 
 
475 aa  67.4  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.660542  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  24.26 
 
 
445 aa  67  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0204  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.57 
 
 
441 aa  65.9  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02372  hypothetical protein  23.75 
 
 
425 aa  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0474  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.24 
 
 
470 aa  65.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0171025  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0546  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.17 
 
 
444 aa  65.9  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3594  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.72 
 
 
471 aa  65.1  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1726  secretion protein  25.31 
 
 
451 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.379002  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4144  alkaline protease secretion protein AprF  21.19 
 
 
477 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0485622  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2098  putative outer membrane protein tolC  24.48 
 
 
456 aa  63.9  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2711  Type I secretion outer membrane protein TolC  23.61 
 
 
493 aa  63.9  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.53 
 
 
461 aa  63.9  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1282  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.72 
 
 
465 aa  63.9  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1991  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.54 
 
 
473 aa  63.9  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.533391  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0019  outer membrane efflux protein  22.87 
 
 
440 aa  60.8  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0567  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.38 
 
 
483 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1781  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.08 
 
 
517 aa  61.2  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0863506  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  20.5 
 
 
456 aa  60.1  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  23.81 
 
 
425 aa  60.1  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0365  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.79 
 
 
475 aa  58.9  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2069  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.62 
 
 
452 aa  59.3  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1407  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.77 
 
 
451 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1022  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.87 
 
 
489 aa  59.7  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15714  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1642  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.59 
 
 
446 aa  59.7  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3328  ABC transporter, permease protein  21.04 
 
 
456 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262756  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0790  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.02 
 
 
440 aa  58.5  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000109355  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1494  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.52 
 
 
450 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1415  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.84 
 
 
472 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000596226  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.12 
 
 
450 aa  57.8  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2156  outer membrane export factor  22.44 
 
 
452 aa  57.4  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4142  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.47 
 
 
472 aa  57.4  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00647616  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0585  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.1 
 
 
456 aa  57  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.449084  normal  0.127961 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>