More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0167 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00182  DNA polymerase III subunit alpha  40.42 
 
 		 1160 aa  712    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3419  DNA polymerase III, alpha subunit  40.42 
 
 		 1160 aa  712    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1836  DNA polymerase III subunit alpha  39.52 
 
 		 1164 aa  691    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  39.32 
 
 		 1170 aa  644    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  41.42 
 
 		 1155 aa  713    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1606  DNA polymerase III subunit alpha  39.32 
 
 		 1174 aa  680    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4484  DNA polymerase III, alpha subunit  37.99 
 
 		 1186 aa  648    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.355677  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  39.64 
 
 		 1149 aa  655    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1286  DNA polymerase III, alpha subunit  40.4 
 
 		 1165 aa  688    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0780  DNA polymerase III, alpha subunit  49.41 
 
 		 1109 aa  1017    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.493984  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2205  DNA polymerase III subunit alpha  41.97 
 
 		 1173 aa  685    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.344019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1465  DNA polymerase III subunit alpha  39.94 
 
 		 1157 aa  674    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1570  DNA polymerase III subunit alpha  39.68 
 
 		 1186 aa  672    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.749203  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3949  DNA polymerase III subunit alpha  43.85 
 
 		 1163 aa  845    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  unclonable  0.0040384  normal  0.125075 
 
 
-
 
NC_004310  BR0825  DNA polymerase III subunit alpha  44.23 
 
 		 1163 aa  845    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1644  DNA polymerase III subunit alpha  40.54 
 
 		 1158 aa  689    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1549  DNA polymerase III, alpha subunit  39.18 
 
 		 1173 aa  691    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0722  DNA polymerase III subunit alpha  41.29 
 
 		 1160 aa  695    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.809003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0824  DNA polymerase III subunit alpha  39.48 
 
 		 1174 aa  664    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2252  DNA polymerase III, alpha subunit  39.56 
 
 		 1174 aa  683    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.353528  normal  0.94108 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1913  DNA polymerase III subunit alpha  39.48 
 
 		 1174 aa  664    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00377925  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1024  DNA polymerase III, alpha chain  41.69 
 
 		 1148 aa  679    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0991  DNA polymerase III, alpha chain  42.11 
 
 		 1148 aa  682    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1358  DNA polymerase III subunit alpha  39.44 
 
 		 1173 aa  694    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0559  DNA polymerase III, alpha subunit  36.6 
 
 		 1156 aa  640    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.77827 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3236  DNA polymerase III subunit alpha  43.66 
 
 		 1163 aa  841    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.040942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2534  DNA polymerase III subunit alpha  39.26 
 
 		 1175 aa  667    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0187  DNA polymerase III alpha subunit  49.37 
 
 		 1123 aa  974    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.701424  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0858  DNA polymerase III, alpha subunit  40.12 
 
 		 1141 aa  677    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  unclonable  0.0000342881  normal  0.701952 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1860  DNA polymerase III subunit alpha  43.49 
 
 		 1168 aa  854    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100328 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1715  DNA polymerase III, alpha subunit  41.6 
 
 		 1175 aa  712    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49916  normal  0.677237 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0846  DNA polymerase III, alpha subunit  40.36 
 
 		 1158 aa  688    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1116  DNA polymerase III subunit alpha  38.97 
 
 		 1173 aa  690    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3553  DNA polymerase III subunit alpha  43.57 
 
 		 1163 aa  839    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  41.1 
 
 		 1156 aa  704    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5655  DNA polymerase III subunit alpha  40.35 
 
 		 1176 aa  660    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2925  DNA polymerase III, alpha subunit  38.58 
 
 		 1173 aa  664    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.917555 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1206  DNA polymerase III subunit alpha  39.38 
 
 		 1174 aa  664    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0872  DNA polymerase III subunit alpha  39.63 
 
 		 1161 aa  795    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.224124  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0327  DNA polymerase III subunit alpha  39.48 
 
 		 1174 aa  664    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  41.33 
 
 		 1155 aa  719    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  40.84 
 
 		 1165 aa  702    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1115  DNA polymerase III, alpha subunit  39.76 
 
 		 1158 aa  671    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.560519  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  41.45 
 
 		 1181 aa  697    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1363  DNA polymerase III subunit alpha  40.72 
 
 		 1157 aa  685    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3038  DNA polymerase III subunit alpha  40.08 
 
 		 1176 aa  708    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117325 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2731  DNA polymerase III, alpha subunit  39.67 
 
 		 1174 aa  701    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1582  DNA polymerase III subunit alpha  44.59 
 
 		 1170 aa  833    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1872  DNA polymerase III DnaE  43.93 
 
 		 1156 aa  707    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0984  DNA polymerase III subunit alpha  39.92 
 
 		 1278 aa  667    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3445  DNA polymerase III, alpha subunit  37.73 
 
 		 1210 aa  652    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2601  DNA polymerase III subunit alpha  43.77 
 
 		 1151 aa  847    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.742859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1770  DNA polymerase III, alpha subunit  39 
 
 		 1215 aa  775    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183542  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0167  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 		 1077 aa  2215    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0922  DNA polymerase III, alpha subunit  48.16 
 
 		 1120 aa  978    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0940  DNA polymerase III subunit alpha  41.49 
 
 		 1155 aa  791    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.863457 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2040  DNA polymerase III, alpha subunit  39.24 
 
 		 1185 aa  675    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.918185  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1106  DNA polymerase III subunit alpha  36.9 
 
 		 1173 aa  692    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2433  DNA polymerase III subunit alpha  43.93 
 
 		 1185 aa  853    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.184139 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1247  DNA polymerase III, alpha subunit  41.59 
 
 		 1149 aa  696    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2893  DNA polymerase III, alpha subunit  37.45 
 
 		 1190 aa  640    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.580471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3292  DNA polymerase III subunit alpha  39.12 
 
 		 1193 aa  670    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1569  DNA polymerase III subunit alpha  40 
 
 		 1159 aa  673    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.840877  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2858  DNA polymerase III subunit alpha  43.97 
 
 		 1151 aa  855    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.813555  normal  0.262906 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  39.47 
 
 		 1168 aa  685    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1693  DNA polymerase III subunit alpha  43.68 
 
 		 1168 aa  845    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  40.48 
 
 		 1170 aa  643    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0754  DNA polymerase III subunit alpha  38.85 
 
 		 1176 aa  670    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0538  DNA polymerase III, alpha subunit  39.43 
 
 		 1163 aa  671    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2620  DNA polymerase III subunit alpha  39.72 
 
 		 1157 aa  667    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3240  DNA polymerase III, alpha subunit  38.33 
 
 		 1190 aa  667    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.860175 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0500  DNA polymerase III subunit alpha  43.42 
 
 		 1166 aa  827    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0751072  normal  0.378075 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1179  DNA polymerase III, alpha subunit  45.13 
 
 		 1162 aa  828    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1701  DNA polymerase III subunit alpha  39.39 
 
 		 1177 aa  666    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  42.33 
 
 		 1157 aa  707    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1264  DNA polymerase III, alpha subunit  40.74 
 
 		 1155 aa  696    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1255  DNA polymerase III subunit alpha  42.56 
 
 		 1172 aa  847    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1197  DNA polymerase III subunit alpha  39.48 
 
 		 1274 aa  664    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0198  DNA polymerase III subunit alpha  41.13 
 
 		 1158 aa  706    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2626  DNA polymerase III subunit alpha  40.85 
 
 		 1158 aa  697    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0206088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2693  DNA polymerase III subunit alpha  40.85 
 
 		 1158 aa  696    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112631 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  41.25 
 
 		 1182 aa  681    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1285  DNA polymerase III subunit alpha  39.5 
 
 		 1158 aa  674    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.876044  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2043  DNA polymerase III DnaE  41.49 
 
 		 1130 aa  665    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1378  DNA polymerase III subunit alpha  44.08 
 
 		 1147 aa  822    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.450591  normal  0.182438 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2352  DNA polymerase III subunit alpha  40.55 
 
 		 1177 aa  666    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17260  DNA polymerase III subunit alpha  39.58 
 
 		 1173 aa  705    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1830  DNA polymerase III, alpha subunit  38.88 
 
 		 1187 aa  672    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.575666  normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2313  DNA polymerase III subunit alpha  39.39 
 
 		 1177 aa  666    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  41.29 
 
 		 1164 aa  690    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3229  DNA polymerase III, alpha subunit  43.04 
 
 		 1195 aa  744    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909958  normal  0.738512 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2800  DNA polymerase III subunit alpha  40.74 
 
 		 1158 aa  695    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.867982 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  40.87 
 
 		 1225 aa  675    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1453  DNA polymerase III, alpha subunit  37.4 
 
 		 1183 aa  658    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  39.74 
 
 		 1184 aa  699    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1044  DNA polymerase III, alpha subunit, form 1  39.48 
 
 		 1686 aa  662    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.108134  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1762  DNA polymerase III subunit alpha  42.16 
 
 		 1156 aa  821    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.402462  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1154  DNA polymerase III subunit alpha  40.6 
 
 		 1157 aa  692    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2961  DNA polymerase III, alpha subunit  37.44 
 
 		 1173 aa  635    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.078928 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0916  DNA polymerase III subunit alpha  37.77 
 
 		 1162 aa  692    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>